Une équipe de recherche dirigée par Beate Averhoff et Volker Müller de l’Université Goethe de Francfort a découvert un mécanisme fondamental qui aide le redoutable pathogène hospitalier Acinetobacter baumannii à survivre. Ce mécanisme explique pourquoi l’agent pathogène est difficile à éradiquer dans les hôpitaux et pourquoi les infections se multiplient encore chez les patients : lorsque les conditions de vie deviennent trop défavorables pour les bactéries, elles tombent dans une sorte de sommeil. Dans cet état, les méthodes de diagnostic conventionnelles ne peuvent plus les détecter ni les tuer. Lorsque les conditions de vie s’améliorent à nouveau, ils se réveillent de ce « sommeil profond ».
La bactérie Acinetobacter baumannii est un agent pathogène extrêmement dangereux que l’on trouve notamment dans les hôpitaux : de nombreuses souches bactériennes sont résistantes à différentes classes d’antibiotiques. Infections à Acinetobacter baumannii ont été observés pour la première fois à plus grande échelle pendant la guerre en Irak et ont depuis augmenté à un rythme rapide dans le monde entier. C’est la raison pour laquelle l’Organisation mondiale de la santé (OMS) a classé Acinetobacter baumannii en tête de liste des bactéries contre lesquelles de nouveaux médicaments sont nécessaires de toute urgence. Cependant, la propagation dangereuse de Acinetobacter baumannii n’est pas seulement dû à la résistance aux antibiotiques mais aussi à son énorme adaptabilité : il prospère même dans des conditions difficiles, comme la dessiccation et une salinité élevée, et est donc capable de coloniser différents écosystèmes du corps humain comme la vessie, la surface de la peau et les poumons. L’unité de recherche (FOR) 2251 de la Fondation allemande pour la recherche, dont le professeur Volker Müller de l’Université Goethe de Francfort est le porte-parole, étudie depuis 2017 les bases moléculaires de ces stratégies d’adaptation.
L’équipe de recherche dirigée par les professeurs Beate Averhoff et Volker Müller, les deux responsables du sous-projet FOR 2251, a découvert un mécanisme d’adaptation jusqu’alors inconnu dans Acinétobactérie. Lorsque les conditions de vie deviennent inhospitalières, de nombreuses bactéries entrent dans un état de dormance qui s’apparente presque à la mort : elles développent des formes permanentes sans activité métabolique. Celles-ci sont connues sous le nom de spores.
Cependant, et comme l’équipe de recherche l’a découvert, Acinetobacter baumannii En alternative, ils peuvent former des cellules spéciales qui se trouvent dans une sorte de sommeil profond. Bien que ces cellules montrent encore signes de vie et respirent, il n’est plus possible de les cultiver sur des milieux de culture en boîtes de Pétri. « Nous connaissons cet état grâce aux bactéries du choléra, par exemple ; on l’appelle état viable mais non cultivable (VBNC) », explique Müller. Patricia König, première auteure de l’étude récemment publiée dans la célèbre revue mBiorapporte que les bactéries peuvent survivre longtemps dans cet état : « Cela fait maintenant onze mois que nous maintenons les bactéries dans un sommeil profond VBNC et vérifions régulièrement si nous pouvons encore les réveiller. L’étude est toujours en cours et il n’y a pas de fin. aperçu. »
Les chercheurs ont pu déclencher l’état VBNC dans le Acinétobactérie bactéries en augmentant la teneur en sel du milieu de culture, mais aussi – avec un certain retard – par des températures de réfrigérateur (4 °C) et de fièvre (42 °C), par dessiccation et en éliminant l’oxygène. Dans tous les cas, il a été possible de « réveiller les bactéries » après deux jours de « rééducation » dans le shaker avec un apport optimal en nutriments et en oxygène.
Le problème est que la détection des bactéries en les cultivant sur des milieux de culture reste la référence en médecine et en contrôle alimentaire. Beate Averhoff explique : « Imaginez ce qui suit : un patient avec un Acinetobacter baumannii l’infection est traitée avec des antibiotiques, et après sept jours plus Acinétobactérie les bactéries se développent sur les boîtes de Pétri. Le médecin et le patient supposent que la bactérie a disparu, mais en réalité elle dort simplement dans les coins et recoins du corps, attendant de se réveiller à la prochaine et meilleure occasion, de se multiplier et de déclencher à nouveau des symptômes chez le patient. C’est extrêmement dangereux, en particulier dans le cas de bactéries multirésistantes. »
Nous espérons que cela nous aidera à contribuer au développement de concepts de traitement plus efficaces contre Acinetobacter baumannii. Il faut avant tout utiliser des méthodes plus sensibles – en plus des boîtes de Pétri – pour le détecter, comme la PCR, qui peut également être utilisée pour repérer les cellules VBNC.s. »
Patricia König, première auteure de l’étude
En termes thérapeutiques, les protéines qui semblent jouer un rôle important dans le passage à l’état de sommeil pourraient constituer de nouvelles portes d’entrée. L’équipe de recherche a déjà identifié plusieurs de ces protéines. König déclare : « Nous devons apprendre à comprendre le rôle de ces protéines. Cela constituera la base pour développer des inhibiteurs contre elles, qui peuvent être administrés avec des antibiotiques pour empêcher les bactéries de tomber dans un sommeil dangereux. »
