En utilisant la protéine de pointe (S) soluble comme appât, plusieurs enquêtes distinctes ont isolé des cellules B spécifiques anti-syndrome respiratoire aigu sévère coronavirus 2 (SRAS-CoV-2) chez les personnes infectées ou celles qui avaient reçu une maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) vaccin. Les anticorps neutralisants développés à l’aide de cette méthode ciblaient presque toujours le domaine de liaison au récepteur (RBD) et étaient généralement plus efficaces que ceux ciblant le domaine N-terminal (NTD).
Arrière-plan
Contrairement à RBD, les anticorps neutralisants anti-NTD ont principalement ciblé un seul supersite avec différentes boucles bordées de glycanes. Plusieurs variantes préoccupantes ont modifié les résidus de supersite, notamment Beta, Gamma et Omicron. Ce dernier a trois délétions, quatre changements d’acides aminés et une insertion dans le NTD, rendant les anticorps dirigés contre le supersite inactifs. La protéine S de PMS20, une construction artificielle fortement résistante aux anticorps, a des résidus dans ce site muté, et les protéines chimériques fabriquées à partir des protéines de type sauvage (WT) et PMS20 présentent des anticorps spécifiques aux MTN qui sont un élément essentiel de l’action neutralisante chez les convalescents et vaccinés. plasma receveur.
L’étude
Dans une étude récente publiée dans Immunitéune équipe de chercheurs a évalué la réponse anticorps humaine à la MTN de la protéine S en enquêtant sur un groupe d’individus qui avaient déjà été infectés par le SRAS-CoV-2 ou qui avaient reçu un vaccin à ARNm par l’isolement du domaine NTD utilisé comme une sonde pour capturer les lymphocytes B producteurs d’anticorps spécifiques de NTD.
Six personnes ont fourni 275 anticorps monoclonaux (mAbs), dont 103 neutralisant au moins une des trois souches : Wuhan-Hu-1, Gamma ou PMS20. Six groupes de complémentation ont été découverts sur la base d’essais de liaison compétitive parmi les 43 anticorps neutralisants qui ont ensuite été décrits.
Les chercheurs ont examiné une cohorte longitudinale précédemment documentée de patients échantillonnés 1,3 et 12 mois après l’infection, certains ayant reçu une vaccination par ARNm environ 40 jours avant l’étude. ELISA a été utilisé pour détecter la réactivité des anticorps dans le plasma contre les Wuhan-Hu-1 et Omicron NTD isolés. Les titres anti-NTD Wuhan-Hu-1 ou Omicron ELISA n’étaient pas corrélés avec l’âge, le sexe, l’intensité des symptômes, la durée des symptômes ou le temps écoulé entre l’apparition des symptômes et la première visite à la clinique.
La réponse IgG anti-Wuhan-Hu-1 NTD n’a pas été sensiblement modifiée entre les intervalles de temps de 1,3 et 12 mois chez les patients précédemment infectés qui n’avaient pas été immunisés. D’autre part, la réponse IgG à l’Omicron NTD a considérablement diminué entre les deux points dans le temps. Chez les patients précédemment infectés qui n’avaient pas été vaccinés, il n’y avait aucun lien entre la réponse ELISA IgG NTD et RBD ou la réactivité ELISA IgG NTD et la moyenne géométrique plasmatique des titres neutralisants demi-maximaux. La vaccination d’individus précédemment infectés a augmenté la réactivité IgG ELISA aux MTN Wuhan-Hu-1 et Omicron, avec une connexion positive entre NTD et RBD ELISA. Chez toutes les personnes étudiées, la réponse anti-MTN IgM et IgA dans le plasma était faible, et seules les IgA étaient renforcées par la vaccination.
À ce jour, presque tous les anticorps anti-NTD ont été produits en capturant des cellules B mémoire spécifiques à l’aide de la protéine S intacte. Ce mécanisme de production d’anticorps anti-NTD neutralisants ne représente qu’un petit sous-groupe des anticorps anti-S totaux qui ciblent généralement un épitope flanqué d’un glucide unique muté. Pour isoler les cellules B mémoire qui produisent des anticorps spécifiques du domaine NTD, les chercheurs ont utilisé un mélange de protéines solubles Wuhan-Hu-1 et Gamma NTD.
Entre les intervalles de temps de 1,3 et 12 mois, les personnes précédemment infectées qui n’avaient pas été vaccinées ont montré une baisse mineure mais substantielle du nombre de lymphocytes B mémoire anti-NTD, qui a été augmenté par la vaccination. Neuf cent quatorze séquences d’anticorps anti-NTD ont été extraites de trois individus vaccinés précédemment infectés et de trois individus non vaccinés et ont été dosées à deux moments différents. Différentes personnes ont développé des anticorps étroitement liés à NTD, similaires à la réponse anti-RBD, les anticorps codés par les gènes VH1-24, VH3-30, VH3-33, VH4-4 et VH4-39 étant surreprésentés.
Les auteurs ont utilisé des tests d’interférométrie de biocouche pour voir si l’affinité des anticorps s’améliorait entre les deux points dans le temps. Parmi les clones persistants et les anticorps découverts seulement à un moment donné, l’affinité avec le Wuhan-Hu-1 NTD s’est améliorée entre 1,3 et 12 mois. Les anticorps anti-NTD atteignent une affinité plus élevée au cours des 12 premiers mois après l’infection, quelle que soit la vaccination ultérieure.
Conséquences
L’infection ou la vaccination dérivée de la souche Wuhan-Hu-1 entraîne des réponses anticorps relativement spécifiques à Wuhan-Hu-1, qui sont beaucoup moins efficaces contre les variantes ultérieures telles que Omicron. Les populations de cellules B mémoire, d’autre part, varient considérablement en réponse à une infection virale ou à une vaccination pour inclure des anticorps de haute affinité capables de neutraliser une large gamme de variants. On s’attend à ce que ce groupe varié de cellules B mémoire et leurs cellules T mémoire associées jouent un rôle clé dans l’évolution généralement plus bénigne de l’infection chez les personnes précédemment infectées par le SRAS-CoV-2 et/ou celles qui ont reçu le vaccin.
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