Dans une récente étude publiée sur bioRxiv* serveur de prétirage, les chercheurs ont étudié les titres d’anticorps neutralisants contre les nouveaux sous-variants Omicron BQ.1, BQ.1.1, XBB et XBB.1 du syndrome respiratoire aigu sévère coronavirus 2 (SARS-CoV-2) en utilisant des sérums d’individus atteints de primaire et de rappel vaccinations contre la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) et infections antérieures par le SRAS-CoV-2.
Sommaire
Arrière plan
Bien que les efforts mondiaux de développement de vaccins aient atténué la morbidité et la mortalité à grande échelle associées à la pandémie de COVID-19, les sous-variantes émergentes d’Omicron, présentant une évasion immunitaire et une transmission accrue grâce à de nombreuses mutations de protéines de pointe, sont devenues dominantes à l’échelle mondiale.
Cependant, 44 %, 46 % et 32 % des cas récents aux États-Unis, en France et au Royaume-Uni, respectivement, ont été attribués aux sous-variantes nouvellement émergentes BQ.1 et BQ1.1, apparues pour la première fois au Nigeria. en juillet 2022. En Inde et dans d’autres régions d’Asie, comme à Singapour, deux nouvelles sous-variantes, XBB et XBB.1, ont émergé et sont devenues dominantes.
On pense que les sous-variantes BQ.1 et BQ1.1 ont évolué à partir de BA.5, tandis que la recombinaison entre les lignées BJ.1 et BA.2.75 de BA.2 a abouti aux sous-variantes XBB et XBB.1. Alors que les sous-variantes BQ.1 et BQ1.1 portent respectivement deux et une mutations supplémentaires, en dehors des mutations trouvées dans BA.5, les variantes XBB et XBB.1 portent respectivement 14 et 15 nouvelles mutations, en dehors de celles trouvées dans BA. .2. Le grand nombre de nouvelles mutations de protéines de pointe et la propagation rapide de ces quatre sous-variantes d’Omicron soulèvent des inquiétudes quant à l’efficacité des vaccins COVID-19 actuels pour se protéger contre ces sous-variantes.
À propos de l’étude
Dans la présente étude, des échantillons de sérum ont été prélevés sur des personnes ayant reçu trois doses de vaccin monovalent à base d’acide ribonucléique messager (ARNm) (Pfizer BNT162b2 ou Moderna ARNm-1273), quatre doses de vaccins monovalents à ARNm ou trois doses de vaccin monovalent et une dose du vaccin bivalent ciblant la souche sauvage et le sous-variant BA.2 ou BA.5 Omicron.
Des sérums ont également été obtenus à partir d’individus vaccinés (avec des vaccinations à ARNm monovalent) qui avaient des infections percées BA.2 ou BA.4/BA.5. Le test immuno-enzymatique anti-nucléoprotéine SARS-CoV-2 (ELISA) a été utilisé pour confirmer les infections précédentes par le SARS-CoV-2.
La résistance des quatre sous-variants nouvellement émergents aux anticorps sériques a été testée en évaluant la neutralisation des sous-variants BQ.1, BQ.1.1, XBB et XBB.1 par des sérums de différentes cohortes. Les résultats des tests de neutralisation sérique ont été utilisés pour construire une carte antigénique afin de déterminer la distance antigénique entre la souche ancestrale D614G et les sous-variantes d’Omicron.
Des pseudovirus construits pour chaque sous-variant, ainsi que ceux portant des mutations individuelles trouvées dans ces sous-variants, ont été utilisés pour évaluer l’activité neutralisante des anticorps sériques. Un total de 23 anticorps monoclonaux ciblant divers épitopes du SRAS-CoV-2 ont été utilisés pour déterminer la sensibilité des sous-variants à la neutralisation. Les anticorps monoclonaux qui étaient utilisés en clinique, ainsi que les combinaisons d’anticorps monoclonaux comme Evusheld, ont été inclus dans ce panel.
De plus, une modélisation structurelle a été réalisée pour comprendre l’impact de nouvelles mutations ponctuelles sur la liaison des anticorps monoclonaux. L’affinité de liaison au récepteur des trimères de protéine de pointe des quatre nouvelles sous-variantes, les sous-variantes BA.2 et BA.4/BA.5, a été testée contre le récepteur de l’enzyme de conversion de l’angiotensine humaine-2 (ACE-2) en utilisant la résonance plasmonique de surface.
Résultats
Les résultats ont indiqué que la neutralisation des quatre nouvelles sous-variantes BQ.1, BQ.1.1, XBB et XBB.1 par les sérums d’individus vaccinés et ayant des infections antérieures était nettement réduite, quel que soit le nombre de doses de vaccin ou le type de vaccin. Les titres d’anticorps neutralisants contre les sous-variants BQ et XBB étaient respectivement de 13 à 81 fois et de 66 à 155 fois inférieurs à ceux contre la souche ancestrale D614G.
De plus, les résultats de la cartographie antigénique ont indiqué que la distance antigénique entre les sous-variants nouvellement émergents et le variant original d’Omicron est comparable à celle entre le variant original d’Omicron et son prédécesseur. Cependant, les sous-variants BQ et XBB avaient des affinités de liaison aux récepteurs similaires à celles de leurs lignées parentales, ce qui indique que les capacités de transmission accrues proviennent probablement d’autres facteurs, tels que l’évasion immunitaire.
Les anticorps monoclonaux qui étaient efficaces contre la variante originale d’Omicron étaient inefficaces contre les quatre nouvelles sous-variantes. Les sous-variants BQ et XBB étaient pan-résistants aux anticorps ciblant le domaine de liaison au récepteur et les épitopes de classe 1 et 3. Les sous-variants XBB étaient également résistants aux anticorps ciblant les épitopes de classe 2. Les mutations supplémentaires de ces nouveaux sous-variants semblaient leur avoir permis d’échapper aux quelques anticorps monoclonaux efficaces contre les précédents sous-variants d’Omicron.
Les sous-variants BQ et XBB étant résistants au bebtélovimab, le seul anticorps monoclonal efficace contre les variants SARS-CoV-2 circulants, aucun traitement autorisé ne reste efficace contre les variants nouvellement émergents. Cette évolution est très préoccupante pour les personnes immunodéprimées qui ne développent pas de réponses immunitaires adéquates aux vaccins.
conclusion
Dans l’ensemble, les résultats de l’étude ont indiqué que les quatre sous-variantes nouvellement émergentes du SRAS-CoV-2 Omicron BQ.1, BQ.1.1, XBB et XBB.1 étaient partiellement ou complètement résistantes à la neutralisation par les sérums d’individus atteints de mono et bivalent vaccins et infections antérieures par le SRAS-CoV-2. De plus, les quatre nouvelles sous-variantes étaient résistantes à toutes les thérapies par anticorps monoclonaux actuellement utilisées en clinique.
Les résultats mettent en évidence les inquiétudes concernant l’inefficacité des vaccins actuels et des traitements par anticorps monoclonaux contre les variants du SRAS-CoV-2 émergents rapidement avec des capacités d’évasion immunitaire accrues.
*Avis important
bioRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.
