De nombreuses études ont indiqué que les animaux sauvages peuvent héberger des zoonoses dangereuses. De plus, les plantes sauvages européennes et de nombreuses plantes d’intérieur et de jardin contiennent des produits chimiques qui peuvent être toxiques pour les animaux. Cependant, le rôle des espèces exotiques dans l’augmentation du risque d’épidémies dans le monde n’a pas encore été abordé. Il a été observé que l’introduction d’espèces exotiques dans une nouvelle zone entraîne souvent l’introduction de nouveaux agents pathogènes qui n’y étaient pas auparavant. Dans le cas d’un débordement d’agents pathogènes, les agents pathogènes peuvent infecter la flore, la faune et les humains locaux, ou des espèces exotiques peuvent être infectées par des agents pathogènes locaux lors d’un déversement d’agents pathogènes.
De graves conséquences liées aux agents pathogènes des espèces exotiques sont observées dans les régions où les espèces exotiques sont largement répandues. Cependant, on observe des débordements d’agents pathogènes dans des zones où les espèces exotiques ne sont pas établies et leur présence dans l’environnement est transitoire. Bien que l’enregistrement de ces espèces attire souvent les médias et le public, leur présence à court terme est généralement sous-estimée.
La récente pandémie de COVID-19 causée par le virus du syndrome respiratoire aigu sévère coronavirus 2 (SARS-CoV-2) a soulevé des inquiétudes concernant le rôle de la faune dans la propagation d’un agent pathogène. L’imprévisibilité de ces événements a encore accru le risque, car il existe des lacunes fondamentales dans les connaissances sur la taxonomie des agents pathogènes, leurs origines et leurs hôtes potentiels. Le déficit de connaissances est plus important dans le cas des animaux et des plantes sauvages.
Une nouvelle étude publiée dans la revue Indicateurs écologiques a évalué les agents pathogènes et les parasites transportés par 118 espèces végétales et animales exotiques envahissantes pour combler ce manque de connaissances. Les législatures nationales européennes et polonaises ont réglementé la majorité de ces espèces.
À propos de l’étude
L’étude a inclus 60 plantes et 58 animaux, dont les espèces hôtes animales représentaient 4 phylums différents et couvraient 41 vertébrés, 6 mollusques, 10 arthropodes et 1 cténophore, tandis que toutes les plantes hôtes se sont révélées être des plantes vasculaires. Les ressources en ligne ont été réactivées de décembre 2017 à février 2018 pour obtenir des données sur les agents pathogènes, les parasites et les vecteurs. Les sources d’information utilisées comprenaient NOBANIS – Réseau européen sur les espèces exotiques envahissantes, CABI Invasive Species Compendium, Centers for Disease Control and Prevention, GISD – Global Invasive Species Database et Base de données mondiale de l’OEPP.
Les données ont été recueillies non seulement en Europe, mais également dans d’autres régions qui incluaient l’aire de répartition naturelle des espèces hôtes évaluées. Dans plusieurs cas, les sources d’information originales ne distinguaient pas les parasites, les agents pathogènes ou les maladies susceptibles d’affecter négativement les hôtes. Tous ont été collectivement appelés agents pathogènes dans la présente étude. La classification des agents pathogènes cellulaires a eu lieu à l’aide du Système d’information taxonomique intégré (ITIS), du Registre mondial des espèces marines (WORMS) et de MycoBank. Les virus ont été classés selon l’ICTV Master Species, développé par le Comité international sur la taxonomie des virus (ICTV).
Les agents pathogènes n’ont été identifiés qu’au niveau du genre, de la famille ou de l’ordre dans un quart des enregistrements récupérés. Pour ceux identifiés au niveau du genre, la source a été suivie pour déterminer si l’enregistrement donné faisait référence à une (sp.) ou à plusieurs (spp.) espèces. Ces agents pathogènes étaient inclus dans la liste des agents pathogènes portés par un hôte donné s’ils étaient les seuls représentants d’un genre particulier chez cet hôte. Si plus d’un enregistrement d’un agent pathogène non identifié a été trouvé dans un hôte, un seul enregistrement a été ajouté à la liste des agents pathogènes. Cependant, si un hôte était infesté par un pathogène identifié au niveau de l’espèce et un pathogène non identifié appartenant au même genre, les deux enregistrements étaient inclus.
De plus, l’aire de répartition naturelle, le mode d’infection dominant et l’environnement ont été déterminés pour chaque espèce hôte. Pour les hôtes végétaux, l’analyse a été effectuée au niveau de la famille, alors que pour les hôtes animaux, elle l’a été au niveau de la classe.
Résultats de l’étude
Les résultats ont indiqué que le niveau de connaissance concernant les espèces exotiques qui agissent comme des parasites était variable. Le nombre total d’enregistrements sur les agents pathogènes qui ont été évalués par espèce s’est avéré être de 2 096, dont 452 enregistrements concernaient des hôtes végétaux et 1 644 enregistrements concernaient des hôtes animaux. 14,9 pour cent de tous les enregistrements ont été identifiés au niveau du genre, avec le plus grand nombre d’espèces trouvées parmi Platyhelminthes, Nematoda et Proteobacteria.
Aucune information sur les agents pathogènes n’a été trouvée pour dix espèces hôtes, et pour la plupart toutes étaient des plantes. Aucun agent pathogène n’a pu être identifié jusqu’au niveau de l’espèce pour la plante Gunnera tinctoria. Les agents pathogènes signalés appartenaient à 48 embranchements différents, 89 classes et 188 ordres. La diversité des agents pathogènes aux trois niveaux taxonomiques était de 2,3 à 2,6 fois plus faible chez les hôtes végétaux que chez les hôtes animaux.
L’agent pathogène le plus répandu qui infectait les plantes était Xylella fastidiosa qui a été trouvé sur 7 espèces hôtes. L’agent pathogène le plus répandu chez les animaux était la rage, qui a été trouvée sur 11 hôtes. La plupart des agents pathogènes se sont avérés présents uniquement dans un seul hôte dans le cas des plantes et des animaux. De plus, le nombre moyen d’hôtes infestés par des agents pathogènes était presque égal pour les plantes et les animaux.
Oranges infestées d’Amarelinho ou CVC, Citrus Variegated Chlorosis, qui est une maladie causée par la bactérie Xylella fastidiosa. Crédit d’image : Alf Ribeiro/Shutterstock
Les principaux groupes d’agents pathogènes parmi les plantes hôtes étaient Arthropoda (embranchement), Insecta (classe) et Hemiptera (ordre), et parmi les hôtes animaux – Platyhelminthes (embranchement), Trematoda (classe) et Plagiorchiida/Strongylida (ordre). Au niveau de la classe, Insecta était le groupe avec le plus grand nombre d’agents pathogènes pour les plantes hôtes, alors qu’aucune dominance significative d’agents pathogènes n’a été trouvée au niveau de l’ordre. Pour les animaux, le groupe pathogène dominant était Platyhelminthes suivi de Nematoda, Arthropoda, Ciliophora et Ascomycota. Au niveau de la classe, Trematoda était le groupe avec le plus grand nombre d’agents pathogènes, tandis que Plagiorchiida et Strongylida ont été trouvés au niveau de l’ordre.
L’aire de répartition naturelle de la plupart des espèces hôtes serait l’Amérique du Nord et l’Asie, la plupart étant terrestres et d’eau douce. Quatre fois plus d’espèces ont été introduites intentionnellement par rapport à celles introduites involontairement. Les deux plantes hôtes les plus infestées seraient Ambrosia artemisiifolia et Prunus sérotineet l’hôte animal le plus infesté serait Loteur de Procyon. Il a été observé que dans le cas des hôtes végétaux et animaux, le nombre d’espèces pathogènes augmentait avec le nombre de publications disponibles sur l’infestation de l’hôte, le niveau d’infestation des hôtes avec l’aire de répartition indigène nord-américaine s’est avéré plus élevé que celui des autres régions, et les hôtes introduits involontairement transportent plus d’agents pathogènes que ceux introduits intentionnellement. Cependant, concernant l’habitat, dans le cas des hôtes végétaux, plus d’agents pathogènes ont été enregistrés chez les hôtes terrestres que chez les hôtes d’eau douce. Dans le cas des hôtes animaux, les habitats marins transportaient beaucoup plus d’agents pathogènes que les habitats terrestres et d’eau douce.
Genre Ambrosia. Crédit d’image : Nouvelle Afrique/Shutterstock
De plus, dans le cas des bactéries et des virus uniquement, la plante hôte la plus infestée s’est avérée être R. rugosaet l’hôte animal le plus infesté s’est avéré être le raton laveur (P. l. lotor). Astéracées et Rosacées les familles représentaient plus de la moitié de toutes les espèces de virus et de bactéries trouvées dans les plantes. La charge pathogène différait selon le type d’habitat et l’origine de l’hôte. Ragondin Myocastor, le seul mammifère hôte d’Amérique du Sud, a été signalé comme transmettant la plupart des espèces de virus et de bactéries enregistrées. De plus, les hôtes d’Amérique du Nord se sont avérés plus infestés de bactéries et de virus, et les hôtes terrestres ont transmis plus d’agents pathogènes viraux et bactériens que les autres habitats.
Raton laveur. Crédit d’image : Karin Jaehne/Shutterstock
Par conséquent, l’étude actuelle a pu classer les espèces d’agents pathogènes et déterminer les agents pathogènes qui ont été largement trouvés dans les hôtes végétaux et animaux. Il était également capable d’analyser l’impact du nombre de publications, de la classe, de l’aire de répartition indigène, de l’habitat et du type d’introduction d’hôtes pour déterminer la différence de charge pathogène dans le cas des hôtes animaux et végétaux. Cependant, des recherches supplémentaires doivent être menées car des lacunes importantes subsistent dans la connaissance des autres hôtes, tels que les hôtes invasifs dans la transmission des agents pathogènes.
