Dans une étude récente publiée sur le bioRxiv serveur de préimpression*, les chercheurs examinent la neutralisation des variantes BA.2.86 et FLip du coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2) récemment identifiées, qui est une variante de la lignée XBB, en utilisant des sérums provenant de professionnels de la santé avec trois- dose de vaccins monovalents ou bivalents et aux personnes infectées par la variante XBB.1.5.
Étude: Évasion immunitaire, infectivité et fusogénicité des variantes du SRAS-CoV-2 Omicron BA.2.86 et FLip. Crédit d’image : Kateryna Kon/Shutterstock.com
*Avis important: bioRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/le comportement lié à la santé, ni être traités comme des informations établies.
Sommaire
Arrière-plan
L’évolution rapide du SRAS-CoV-2 reste un défi majeur pour le développement d’un vaccin. Les variantes virales telles qu’Omicron et ses sous-variantes contiennent des mutations dans le domaine de liaison au récepteur de la protéine Spike qui leur permettent d’échapper aux anticorps neutralisants générés contre le SRAS-CoV-2 par les différents vaccins développés depuis le début de la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19). ) pandémie. En plus de l’évasion immunitaire, ces nouvelles mutations dans la lignée Omicron augmentent également la transmissibilité du virus tout en réduisant son pouvoir pathogène.
Une lignée recombinante de sous-variantes d’Omicron appelée XBB, composée de XBB.2.3, XBB.1.16 et XBB.1.5, est capable d’échapper à l’immunité induite par le schéma vaccinal à trois doses. En fait, ces variantes ne peuvent être que partiellement neutralisées après une dose de rappel du vaccin bivalent à acide ribonucléique messager (ARNm). L’émergence de BA.2.86, qui comprend plus de 30 nouvelles mutations par rapport à XBB.1.5, a également accru les inquiétudes concernant l’efficacité du vaccin.
Compte tenu de l’émergence de ces variantes génétiquement distinctes du SRAS-CoV-2, il est essentiel d’évaluer l’efficacité de l’immunité induite par le vaccin actuelle pour neutraliser ces variantes.
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les chercheurs examinent les titres d’anticorps neutralisants contre BA.2.86, ainsi que contre D614G, Omicron BA.1, BA.2 et BA.4/5, ainsi que contre les récentes variantes d’Omicron EG.5.1 et FLip. À cette fin, des échantillons de sérum obtenus auprès d’agents de santé vaccinés soit avec trois doses du vaccin monovalent à ARNm, soit avec deux doses du vaccin monovalent à ARNm et une dose du vaccin bivalent à ARNm ont été utilisés.
Les sérums collectés auprès d’individus infectés par la variante XBB.1.5 ont également été utilisés pour tester les titres d’anticorps neutralisants contre les variantes les plus récentes et précédentes du SRAS-CoV-2. L’efficacité de l’anticorps monoclonal S309, qui s’est révélé efficace contre un large éventail de sous-variantes d’Omicron, notamment EG.5.1 et XBB.1.5, a également été testée contre les variantes récemment apparues.
Lignée cellulaire de rein embryonnaire humain (HEK293T) exprimant l’enzyme de conversion de l’angiotensine humaine 2 (ACE-2) a été utilisé pour propager des lentivirus pseudotypés exprimant les protéines de pointe de toutes les variantes testées du SRAS-CoV-2. Le pouvoir infectieux des virus pseudotypés a été évalué à l’aide de cellules de la lignée cellulaire d’adénocarcinome du poumon humain CaLu-3 et HEK293T. Des tests de neutralisation du virus ont été réalisés à l’aide d’échantillons de sérum dilués provenant des différentes cohortes.
Les cellules HEK293T cotransfectées avec la protéine de pointe de chacune des variantes et la protéine fluorescente verte améliorée ont été utilisées pour déterminer la fusogénicité de la protéine de pointe. Les cellules HEK293T utilisées pour produire les lentivirus ont également été colorées à l’aide d’anticorps polyclonaux contre la sous-unité S1 de la protéine de pointe pour déterminer l’expression de surface de la protéine de pointe.
La protéine de pointe BA.2.86 a également été structurellement modélisée pour comprendre son interaction avec les anticorps neutralisants et le récepteur ACE-2. Une cartographie antigénique a été réalisée pour comprendre l’évolution des titres d’anticorps neutralisants.
Résultats de l’étude
BA.2.86 a des capacités d’évasion immunitaire inférieures à celles des variantes XBB ou FLip, qui étaient soutenues par les distances antigéniques. Cependant, l’anticorps monoclonal S309 n’a pas été efficace pour neutraliser BA.2.86, ce qui pourrait être dû à la présence de la mutation D339H révélée par modélisation structurelle.
L’infectiosité et la fusogénicité du variant BA.2.86 étaient plus faibles dans les cellules HEK293T mais plus élevées dans les cellules CaLu-3 que dans la plupart des variants XBB. Cette observation indique des changements dans la stabilité conformationnelle de BA.2.86.
Bien que l’antigénicité du variant BA.2.86 soit distincte, les résultats de l’étude suggèrent que structurellement, il est plus proche des variants Omicron antérieurs tels que BA.1, BA.2 et BA.4/5 que des variants XBB plus récents. Néanmoins, les échantillons de sérum obtenus auprès d’individus vaccinés avec le vaccin monovalent à ARNm de Moderna contenant l’antigène XBB.1.5 ont présenté des réponses immunitaires robustes contre les variantes BA.2.86 et FLip.
Conclusions
Les capacités d’évasion immunitaire de la nouvelle variante émergente du SRAS-CoV-2 BA.2.86 ne semblent pas aussi fortes que les récentes variantes XBB EG.5.1 ou FLip. De plus, le pouvoir infectieux et la fusogénicité de BA.2.86 étaient faibles dans les cellules HEK293T exprimant les récepteurs ACE-2 mais élevés dans les cellules CaLu-3. Cependant, la question de savoir si BA.2.86 présente une affinité pour le tissu pulmonaire doit être examinée plus en détail.
*Avis important: bioRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/le comportement lié à la santé, ni être traités comme des informations établies.
