Les chercheurs ont montré qu'une variation du génome viral de Covid-19 améliorait sa capacité à infecter les cellules humaines et l'aidait à devenir la souche dominante circulant dans le monde aujourd'hui.
L'étude, publiée aujourd'hui dans la revue Cellule, montre que la variation est plus contagieuse dans les cultures cellulaires en laboratoire.
La variante, nommée «D614G», modifie légèrement mais efficacement la glycoprotéine «spike» qui dépasse de la surface du virus, qu'elle utilise pour pénétrer et infecter les cellules humaines.
La variante D614G de Covid-19 est rapidement devenue la souche dominante peu de temps après son apparition, avec des échantillons géographiques montrant un changement significatif de la population virale de l'original vers la nouvelle souche du virus.
Des chercheurs du Los Alamos National Laboratory au Nouveau-Mexique et de Duke University en Caroline du Nord, se sont associés au groupe de recherche Covid-19 Genomics UK de l'Université de Sheffield pour analyser des échantillons de génome publiés sur GISAID, une ressource internationale pour partager des séquences de génomes entre chercheurs du monde entier.
Le Dr Thushan de Silva, maître de conférences clinique en maladies infectieuses à l'Université de Sheffield, a dirigé l'analyse des données de Sheffield. Il a déclaré: « Nous séquençons les souches du SRAS-CoV-2 à Sheffield depuis le début de la pandémie et cela nous a permis de nous associer à nos collaborateurs pour montrer que cette mutation était devenue dominante dans les souches en circulation. »
« L'étude complète révisée par les pairs publiée aujourd'hui confirme cela, et aussi que la nouvelle variante de mutation du génome D614G est également plus infectieuse dans des conditions de laboratoire. »
Les données fournies par notre équipe à Sheffield suggèrent que la nouvelle souche était associée à des charges virales plus élevées dans les voies respiratoires supérieures des patients atteints de Covid-19, ce qui signifie que la capacité du virus à infecter les personnes pourrait être augmentée. «
Thushan de Silva, maître de conférences clinique, Université de Sheffield
« Heureusement à ce stade, il ne semble pas que les virus avec D614G provoquent une maladie plus grave. »
Le Dr Bette Korber, du Los Alamos National Laboratory au Nouveau-Mexique, était l'auteur principal de l'étude. Elle a déclaré: « Il est possible de suivre l'évolution du SARS-CoV-2 (Covid-19) à l'échelle mondiale parce que les chercheurs du monde entier mettent rapidement leurs données de séquence virale à disposition via la base de données de séquences virales GISAID. »
« Actuellement, des dizaines de milliers de séquences sont disponibles grâce à ce projet, ce qui nous a permis d'identifier l'émergence d'une variante qui est rapidement devenue la forme dominante à l'échelle mondiale. »
De nouvelles expériences à l'appui, des données cliniques et de séquençage plus étendues et des modèles statistiques améliorés ont été publiés aujourd'hui dans leur intégralité à l'adresse Cellule, cependant, les chercheurs tiennent à souligner que des analyses de laboratoire supplémentaires dans les cellules vivantes doivent être effectuées pour déterminer toutes les implications de la mutation.
« C'est remarquable pour moi », a commenté le Dr Will Fischer, du Los Alamos National Laboratory et auteur de l'étude.
« Que cette augmentation de l'infectiosité a été détectée par une observation attentive des seules données de séquence, et que nos collègues expérimentaux pourraient la confirmer avec un virus vivant en si peu de temps. »
La source:
Référence de la revue:
Korber, B., et al (2020) Suivi des changements dans le SRAS-CoV-2 Spike: preuve que le D614G augmente l'infectiosité du virus COVID-19. Cellule. doi.org/10.1016/j.cell.2020.06.043.
