Rapid Novor Inc et MAbSilico ont annoncé leur partenariat pour fournir le premier service de cartographie d'épitopes HDX-MS piloté par l'IA au monde pour le développement d'anticorps. En intégrant de manière transparente les données expérimentales de HDX-MS avec des analyses prédictives dérivées de la modélisation informatique pilotée par l’IA, les chercheurs peuvent acquérir une compréhension globale de la structure, de la dynamique et des interactions des anticorps avec une précision et une rapidité inégalées.
« L'intelligence artificielle promet un tournant dans la découverte et le développement de médicaments à base d'anticorps », déclare Iain Rogers, vice-président des ventes et du marketing chez Rapid Novor. « En combinant la robustesse du HDX-MS avec la puissance prédictive de la modélisation informatique pilotée par l'IA, nous avons développé un pipeline qui peut accélérer la découverte et la caractérisation des anticorps ».
HDX-MS utilisé par Rapid Novor mesure le taux d'échange des atomes d'hydrogène d'amide en deutérium, lorsqu'ils sont exposés au deutérium à différents moments. En comparant les niveaux de deutération entre les états liés et non liés du complexe anticorps-protéine, les régions protégées par la liaison des anticorps peuvent être identifiées. « Avec notre expertise en protéomique » explique le Dr Dominic Narang, responsable HDX-MS et chercheur scientifique principal à Rapid Novor, « Nous pouvons identifier les épitopes sur les antigènes cibles avec une résolution exceptionnelle, allant jusqu'à 1 à 5 acides aminés, fournissant ainsi aux chercheurs des informations précieuses sur les interactions anticorps-antigène »
Formés sur les données de 1 000 milliards d'anticorps, les algorithmes exclusifs de MAbSilico prédisent les épitopes de liaison sur les antigènes cibles à l'aide de modèles structurels 3D et de méthodologies basées sur l'amarrage. « Nos algorithmes prédictifs sont l'aboutissement de 15 années de recherche en modélisation des protéines, en IA et en apprentissage automatique » déclare Thomas Bourquard, CSO chez MAbSilico. « Notre modélisation informatique prédit avec précision la liaison aux épitopes et est toujours validée par des tests in vitro. » De plus, leurs plates-formes d'IA effectuent un regroupement d'épitopes pour cribler des centaines de séquences d'anticorps contre des épitopes fonctionnellement pertinents, et peuvent également évaluer leur développabilité.
L'intégration de la cartographie des épitopes guidée par l'IA éclaire non seulement la conception d'expériences in vitro pour cibler les régions les plus pertinentes de l'antigène, mais elle garantit également la plus haute qualité, confiance et résolution dans l'identification des sites de liaison pour les interactions anticorps-antigène.
Cette approche intégrée à l’IA permet un criblage rapide des anticorps provenant de vastes pools de candidats. Ceci accélère le rythme de la découverte et du développement d’anticorps, conduisant finalement à de nouveaux traitements dotés d’une efficacité accrue. »
Zak Omahdi, développeur d'affaires scientifique, MAbSilico
