Les micronoyaux, qui sont de petites structures semblables à des noyaux dans les cellules, sont généralement associés aux tumeurs. Maintenant, des chercheurs de Tsukuba, au Japon, ont développé un programme informatique automatisé qui peut compter avec précision et de manière reproductible ces structures à partir d’images au microscope, ce qui augmentera la vitesse et la précision de la recherche sur les micronoyaux.
Dans une étude récemment publiée, des chercheurs de l’Université de Tsukuba ont signalé leur nouveau programme basé sur MATLAB, nommé CAMDi (Ccalculer UNEautomatique Mles micronoyaux Distinction), qui compte automatiquement les micronoyaux à partir d’images de cellules colorées. Les micronoyaux peuvent être colorés de la même manière que les noyaux normaux, mais ils se différencient des noyaux par leur taille beaucoup plus petite. Cependant, les identifier est plus facile à dire qu’à faire, car les systèmes automatiques de comptage des micronoyaux ont traditionnellement utilisé des images prises à partir d’un seul niveau de tissu. Pour comprendre pourquoi c’est important, imaginez couper une section transversale à travers une boule qui est fixée dans l’espace. Si vous coupez une tranche plus près des zones supérieure ou inférieure de la balle, la taille de la section transversale serait beaucoup plus petite que si vous choisissiez une tranche plus proche du centre, donc une section transversale proche de la périphérie d’un noyau peut facilement être confondu avec un micronoyau.
Pour lutter contre ce problème, des chercheurs de l’Université de Tsukuba ont pris des photos à différents niveaux à travers des cellules ou des tissus et ont créé un programme capable d’analyser les informations tridimensionnelles résultantes. De cette façon, ils ont assuré que ce que le programme comptait comme micronoyaux étaient, en fait, des micronoyaux. Ils ont ensuite utilisé ce programme pour examiner les micronoyaux dans les neurones de souris et testé les effets de la neuroinflammation sur le nombre de micronoyaux.
Un lien a été rapporté entre l’inflammation et les micronoyaux dans les cellules cancéreuses. Nous avons décidé de tester si la neuroinflammation dans le cerveau pouvait affecter le nombre de micronoyaux dans les neurones. »
Dr Fuminori Tsuruta, auteur correspondant de l’étude
Pour ce faire, les chercheurs ont d’abord introduit des facteurs inflammatoires dans des neurones de souris cultivés en culture, mais ils n’ont trouvé aucun changement dans le nombre de micronoyaux à l’aide de leur programme CAMDi. Cependant, lorsqu’ils ont administré à des souris des injections de lipopolysaccharides, qui ont provoqué l’activation des cellules inflammatoires de la région de l’hippocampe, il y a eu une augmentation des micronoyaux dans les neurones de l’hippocampe.
« Ces résultats étaient surprenants », explique le Dr Tsuruta. « Ils suggèrent que la formation de micronoyaux dans les neurones est induite par des réponses inflammatoires des cellules voisines. »
Étant donné que les micronoyaux sont des marqueurs d’une gamme de pathologies, le développement de ce nouveau programme informatique pourrait être très important pour les diagnostics pathologiques et le suivi des réponses au traitement. La recherche sur les micronoyaux, pour mieux comprendre leur formation et leur rôle dans la maladie, sera également renforcée par l’utilisation de CAMDi.
