Une combinaison de seulement 11 protéines peut prédire les conséquences d’une invalidité à long terme liée à la sclérose en plaques (SEP) chez différents individus. Les protéines identifiées pourraient être utilisées pour adapter les traitements à chaque individu en fonction de la gravité attendue de la maladie. L’étude, dirigée par des chercheurs de l’Université de Linköping en Suède, a été publiée dans la revue Communications naturelles.
Une combinaison de 11 protéines prédisait l’activité de la maladie et les conséquences sur le handicap à court et à long terme. Nous avons également conclu qu’il est important de mesurer ces protéines dans le liquide céphalo-rachidien, qui reflète mieux ce qui se passe dans le système nerveux central, par rapport à la mesure dans le sang. »
Julia Åkesson, doctorante à l’Université de Linköping et à l’Université de Skövde
Dans la sclérose en plaques, le système immunitaire attaque le corps de la personne, endommageant les nerfs du cerveau et de la moelle épinière. Ce qui est principalement attaqué, c’est un composé gras appelé myéline, qui entoure et isole les axones nerveux afin que les signaux puissent être transmis. Lorsque la myéline est endommagée, la transmission devient moins efficace.
La progression de la maladie dans la sclérose en plaques varie considérablement d’une personne à l’autre. Pour ceux pour qui on prévoit une maladie plus grave, il est important de ne pas perdre un temps précieux dès l’apparition de la maladie mais d’obtenir rapidement le traitement approprié. Les chercheurs à l’origine de l’étude actuelle, fruit d’une collaboration entre l’Université de Linköping, l’Institut Karolinska et l’Université de Skövde, voulaient savoir s’il était possible de détecter à un stade précoce de la maladie quels patients nécessiteraient un traitement plus puissant. Pouvoir le faire serait pertinent à la fois pour les médecins et pour les personnes vivant avec la SP.
« Je pense que nous avons fait un pas de plus vers un outil d’analyse permettant de sélectionner les patients qui auraient besoin d’un traitement plus efficace à un stade précoce de la maladie. Mais un tel traitement peut avoir des effets secondaires et être relativement coûteux, et certains patients ne le font pas. » nous en avons besoin », déclare Mika Gustafsson, professeur de bioinformatique au Département de physique, chimie et biologie de l’Université de Linköping, qui a dirigé l’étude.
Trouver des marqueurs liés à la gravité de la maladie plusieurs années à l’avance est un défi complexe. Dans leur étude, les chercheurs ont analysé près de 1 500 protéines dans des échantillons provenant de 92 personnes atteintes de SEP suspectée ou récemment diagnostiquée. Les données des analyses de protéines ont été combinées à une grande quantité d’informations provenant des journaux des patients, telles que le handicap, les résultats des IRM du système nerveux et les traitements reçus. Grâce à l’apprentissage automatique, les chercheurs ont découvert un certain nombre de protéines susceptibles de prédire la progression de la maladie.
« Avoir un panel composé de seulement 11 protéines facilite la tâche si quelqu’un souhaite développer une analyse à ce sujet. Cela ne sera pas aussi coûteux que de mesurer 1 500 protéines, nous l’avons donc vraiment réduit pour le rendre utile à d’autres personnes souhaitant prendre des mesures. cela va plus loin », déclare Sara Hojjati, doctorante au Département des sciences biomédicales et cliniques de l’Université de Linköping.
L’équipe de recherche a également découvert qu’une protéine spécifique, s’échappant des axones nerveux endommagés, constitue un biomarqueur fiable de l’activité de la maladie à court terme. Cette protéine est appelée chaîne légère des neurofilaments, NfL. Ces résultats confirment des recherches antérieures sur l’utilisation du NfL pour identifier les lésions nerveuses et suggèrent également que la protéine indique le degré d’activité de la maladie.
L’un des principaux points forts de l’étude réside dans le fait que la combinaison de protéines trouvées dans le groupe de patients à partir duquel des échantillons ont été prélevés à l’hôpital universitaire de Linköping a ensuite été confirmée dans un groupe distinct composé de 51 patients atteints de SEP échantillonnés à l’hôpital universitaire Karolinska de Stockholm.
Cette étude est la première à mesurer une si grande quantité de protéines avec une méthode très sensible, le test d’extension de proximité, combinée au séquençage de nouvelle génération, PEA-NGS. Cette technologie permet également de mesurer avec une grande précision de très petites quantités, ce qui est important car ces protéines sont souvent présentes en très faibles quantités.
L’étude a été financée par la Fondation suédoise pour la recherche stratégique, la Fondation suédoise du cerveau, la Fondation Knut et Alice Wallenberg, la Fondation Margaretha af Ugglas, le Conseil suédois de la recherche, NEURO Suède et la Fondation suédoise pour la recherche sur la SEP, entre autres.
