Dans une récente étude publiée sur bioRxiv* serveur de prétirage, les chercheurs ont développé un modèle épidémiologique pour simuler la co-circulation du coronavirus du syndrome respiratoire aigu sévère 2 (SRAS-CoV-2) et des bactéries multirésistantes (MRB) dans les établissements de santé pendant la phase précoce de la maladie à coronavirus 2019 ( Pandémie de covid19.
Sommaire
Arrière plan
De plus, la résistance aux antibiotiques est l’une des principales causes de morbidité et de mortalité dans le monde, et la pandémie de COVID-19 a eu un impact sur l’épidémiologie de plusieurs maladies bactériennes invasives. Pourtant, les études ont à peine exploré l’impact de la pandémie de COVID-19 sur la transmission et le contrôle des bactéries résistantes aux antibiotiques.
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les chercheurs ont utilisé un modèle mathématique pour quantifier la dynamique épidémiologique de la résistance aux antibiotiques basée sur les épidémies de SRAS-CoV-2 et les réponses COVID-19 correspondantes. Ils ont exploré comment une augmentation des cas de COVID-19 peut conduire à des conditions favorables à la prolifération des MRB, notamment la désorganisation des soins aux patients, une demande accrue de travailleurs de la santé et l’abandon des programmes de gestion des antibiotiques.
En outre, ils ont exploré comment le renforcement des mesures de prévention et de contrôle de l’infection par le SRAS-CoV-2 (IPC), la distanciation sociale, le confinement des patients, le respect des protocoles d’hygiène des mains et l’utilisation de désinfectants pourraient aider à prévenir la transmission bactérienne.
Le modèle d’étude décrivait une infection bactérienne chez les patients, les travailleurs de la santé (TS) et entre les deux dans un établissement de soins de santé. En outre, il a montré une colonisation bactérienne chez les patients présentant des souches bactériennes sensibles aux antibiotiques ou résistantes aux antibiotiques. Il est à noter que les travailleurs de la santé sont porteurs transitoires de bactéries commensales et servent de vecteurs pour la colonisation des patients. Alors que l’infection bactérienne chez les travailleurs de la santé est éliminée s’ils maintiennent l’hygiène des mains, les patients ont besoin d’antibiotiques pour la même chose.
Le modèle d’étude a incorporé 10 paramètres de réponse COVID-19 (τ) dans des équations différentielles ordinaires (ODE), chacune reflétant l’impact des épidémies de SRAS-CoV-2 sur l’organisation des établissements de santé et des soins aux patients. Les chercheurs ont classé chaque réponse comme un réponse politique ou un réponse à la charge de travail; le premier a été adopté lors d’épidémies de SRAS-CoV-2 pour limiter les transmissions virales, et le second a résulté involontairement d’augmentations subites du nombre de patients COVID-19 ou d’infections par les agents de santé. Les chercheurs ont utilisé deux ensembles de simulations probabilistes de Monte Carlo pour tenir compte de l’incertitude τ étendue, qui reflétait l’hétérogénéité entre différents types de bactéries et d’établissements de santé.
Résultats
Les simulations adaptées à un contexte pandémique précoce ont montré que les réponses combinées au COVID-19 (τ = 0,5) ont entraîné une réduction moyenne de 88,1 % de l’incidence totale de l’infection nosocomiale par le SRAS-CoV-2 sur toutes les voies d’infection. Cependant, il a eu un impact hétérogène sur l’épidémiologie des MRB. Les auteurs ont également observé que les patients dans les établissements de santé adoptant des mesures IPC COVID-19 plus efficaces étaient moins susceptibles de subir une colonisation par MRB et ont connu des taux de résistance inférieurs à ceux des patients dans des établissements inondés de cas de COVID-19.
Le nombre cumulé de jours-patients colonisés par des BMR a diminué de 13,2 % avec réponses politiques mais a augmenté de 6,3 % avec réponses à la charge de travail. De même, l’incidence de la colonisation par les MRB a diminué de 28,2 % avec réponses politiques mais a augmenté de 13,8 % avec réponses à la charge de travail. Inversement, réponses politiques eu peu d’impact sur le taux de résistance moyen, tandis que réponses à la charge de travail conduit à une augmentation moyenne de 10,4 %.
Conclusion
La propagation sans précédent du SRAS-CoV-2 dans le monde a choqué le système de santé au début de 2020, révélant son incapacité à détecter et à contrôler les agents pathogènes encore émergents susceptibles de créer une pandémie. Cette révélation a mis en évidence la nécessité d’un investissement mondial dans la préparation à la pandémie pour apporter des changements dans le droit international et la gouvernance.
L’examen actuel a montré que les initiatives de préparation à une pandémie atténueraient également la propagation des MRB, en faisant un avantage collatéral d’une solide préparation à une pandémie. D’autres stratégies de santé publique pour prévenir la transmission du SRAS-CoV-2 dans les établissements de santé, notamment la vaccination et les tests de masse, pourraient également contribuer à atténuer la propagation des MRB.
Les études futures devraient également utiliser la modélisation mathématique pour quantifier les liens mécanistes entre le COVID-19 et la résistance aux antibiotiques au-delà du contexte pandémique précoce. De plus, ces études devraient évaluer des impacts similaires dans d’autres contextes (par exemple, les maisons de retraite, les prisons).
Les autorités de santé publique ont réorienté l’infrastructure de résistance aux antimicrobiens pour les tests et la surveillance du SRAS-CoV-2 au début de la pandémie de COVID-19, ce qui a entraîné un retard dans la communication des données sur la résistance aux antimicrobiens. Après la première flambée internationale de la consommation d’antibiotiques en mars 2020, des études ont estimé une réduction de 19 % de la consommation mondiale d’antimicrobiens d’avril à août 2020 par rapport à 2019. Par conséquent, les études futures devraient comprendre l’impact du COVID-19 sur la résistance aux antibiotiques et la consommation modifiée d’antibiotiques. en milieu communautaire.
Conclusion
L’étude a montré que les politiques de PCI limitaient la transmission nosocomiale des MRB (p. Pseudomonas aeruginosa, Acinetobacter baumannii, Enterobacter spp.) pendant la pandémie de COVID-19 pourrait aider à atténuer la sélection pour la résistance aux antibiotiques. Par conséquent, des investissements mondiaux dans des initiatives de préparation à une pandémie contribueraient également à lutter contre la résistance aux antibiotiques.
*Avis important
bioRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.
