Le syndrome endothélial iridocorneal (ICE) est un trouble oculaire rare et irréversiblement aveuglant avec une étiologie inconnue. Le manque de médicaments efficaces ciblés, le pronostic inadéquat de la maladie et les taux de rechute élevés après la chirurgie sont les défis actuels de la glace. Par conséquent, comprendre son paysage génomique et épigénomique pourrait aider à développer des thérapies basées sur l'étiologie.
Cette recherche, publiée dans le Gènes et maladies Journal d'une équipe de l'Université Sun Yat-Sen, de l'Université médicale de Guangzhou, de l'Université médicale du Fujian, de la première université médicale du Shandong, de l'Université Huazhong des sciences et de la technologie, Université Nanchang, Université de Nanjing Medical, China Three Gorges University, Hebei Medical University, Central South University, Xiamen University, Zhejiang University et University of Science et Technology, Syndren, Syndress de la glace, Syndressée de la glace, Syndressée de la glace, Syndren de la glace et épigouvant avec le potentiel d'informer le développement de thérapies basées sur l'étiologie.
Les chercheurs ont recruté 99 patients ICE et ont effectué un séquençage du génome entier (WGS) sur 51 et le profilage de méthylation de l'ADN à l'échelle du génome sur 48. Des tests de la charge mutationnelle ont été effectués pour comparer la cohorte de glace avec les groupes témoins, révélant une association significative entre le gène RP1L1 (rétinite pigmentosa 1-like 1) le syndrome de glace.
The researchers then investigated copy number variation (CNV) in ICE syndrome and identified 41 regions with significant CNVs, including three regions at chr19:15783859-15791329 (hg19), chr3:75786061-75790887 (hg19) and chr19: 55276166-55295820 (HG19), montrant respectivement la perte du nombre de copies chez 39, 19 et 5 patients. De plus, cette étude a indiqué que la perte de nombres de copies des gènes CYP4F12, ZNF717 et KIR2DL1 peut induire un dysfonctionnement des cellules endothéliales cornéennes et une conversion pathologique induite par l'infection virale des cellules endothéliales cornéennes dans le syndrome de la glace.
Cette étude a également identifié 2 717 régions méthylées différentiellement (DMR), avec une hypométhylation répandue dans le syndrome de la glace (91,9% des DMR). Parmi ceux-ci, 45 régions hypométhylées récurrentes (RMR) chez plus de 10% des patients atteints de glace ont montré une méthylation différentielle par rapport aux témoins normaux. Fait intéressant, les chercheurs ont constaté que CHR2_95692705_95692728 (HG19), le HMR le plus fréquemment identifié chez les patients glaciaires, se trouve sur le promoteur du gène mal. Cela indique que l'hypométhylation du promoteur et l'expression élevée du MAL peuvent contribuer à l'hyperplasie épithélioïde des cellules endothéliales cornéennes dans le syndrome de la glace.
Les principales résultats de cette étude comprennent l'identification des gènes pathogènes chez les patients atteints du syndrome de glace qui sont liés aux maladies oculaires, à l'immunité virale et à l'hyperplasie épithélioïde. Ces résultats suggèrent que les infections virales peuvent déclencher la transformation pathologique des cellules endothéliales cornéennes en fonction de ces sensibilités génétiques et épigénétiques, conduisant au développement du syndrome de la glace. En conclusion, cette étude représente la première analyse génomique et épigénomique complète du syndrome de glace en utilisant un séquençage de nouvelle génération impartial.
