Dans une récente étude publiée sur bioRxiv* serveur de préimpression, les chercheurs ont évalué la synchronicité des impulsions d’excrétion virale dans deux colonies de maternité de chauves-souris à queue libre (Mormopterus francoismoutoui) à La Réunion dans le sud-ouest de l’océan Indien. Ils se sont concentrés sur les modèles d’excrétion virale de trois virus à acide ribonucléique (ARN) – les coronavirus (CoV), les astrovirus (AstV) et les paramyxovirus (PMV).
Sommaire
Arrière plan
Les études n’ont pas encore évalué l’impact des facteurs sociaux, écologiques et biologiques et des changements dans la population hôte qui génèrent des conditions facilitant la transmission d’agents pathogènes infectieux, tels que le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SARS-CoV-2). Par exemple, la structure de la population de chauves-souris et les cycles de reproduction ont un impact sur la transmission des virus à ARN, y compris le SRAS-CoV-2. Une évaluation détaillée de tous ces facteurs pourrait considérablement élargir la compréhension des interactions hôte-pathogène et aider à évaluer le potentiel de propagation zoonotique de ces virus à d’autres hôtes.
Bien que de nombreuses études aient rapporté des virus, des bactéries et des parasites sanguins chez les chauves-souris, les études n’ont pas encore étudié le rôle des facteurs associés aux colonies de chauves-souris (par exemple, la durée d’occupation) et la circulation simultanée de plusieurs agents pathogènes infectieux dans celles-ci.
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les chercheurs ont collecté 3422 échantillons de matières fécales fraîches de deux colonies de maternité de chauves-souris à queue libre de la Réunion (RFTB), une espèce de molosse endémique de La Réunion, au cours de 64 séances de prélèvement. Étant donné que leurs cycles de reproduction sont hautement synchronisés, les chercheurs ont émis l’hypothèse que les schémas d’excrétion virale des chauves-souris sont également synchronisés au cours des saisons de mise bas. Cependant, il pourrait y avoir des différences entre les familles virales.
Les chercheurs ont testé cette hypothèse et évalué les variations temporelles de l’excrétion virale chez les chauves-souris. En outre, ils ont effectué une extraction d’ARN viral à partir de tous les échantillons de matières fécales. L’équipe a testé l’acide désoxyribonucléique complémentaire (ADNc) pour la présence du gène AstVs ARN polymérase dépendante de l’ARN (RdRp), du gène CoVs RdRp et du gène PMVs L-polymérase en utilisant des protocoles basés sur la réaction en chaîne par polymérase (PCR) précédemment établis.
En outre, les chercheurs ont estimé le nombre de chauves-souris co-infectées et testé si la détection d’une famille virale chez les chauves-souris était associée à la présence d’une autre famille de virus à l’aide de trois modèles mixtes linéaires généralisés (GLMM). De même, ils ont utilisé quatre GLMM pour explorer l’effet de la colonie elle-même. Les analyses de l’étude incluaient une saison de parturition et des dates de collecte d’échantillons comme facteurs aléatoires.
Les chercheurs ont surveillé visuellement la structure d’âge et le moment de la parturition des chauves-souris dans la colonie de la grotte et ont identifié les adultes, les nouveau-nés et les juvéniles en fonction de la couleur de la fourrure (morphologie des chauves-souris). Cependant, la même chose n’était pas possible dans la colonie de maternité de chauves-souris basée sur le bâtiment. L’équipe a surveillé la colonie de grottes entre octobre 2016 et mars 2020 (quatre saisons de naissance consécutives) et la colonie de construction entre novembre 2017 et octobre 2020 (trois saisons de naissance).
Résultats de l’étude
La première colonie maternelle de chauves-souris était un 30m3 grotte naturelle sur la côte Ouest de l’île de la Réunion (grotte). Il abritait un maximum de chauves-souris gestantes pendant la saison des naissances d’octobre à juin, et leur population atteignait environ 40 000 à 50 000 avant le début de la parturition à la mi-décembre. Alors que les chauves-souris adultes avaient une fourrure brune, les nouveau-nés avaient une peau rose nude et les juvéniles avaient une fourrure gris foncé. La deuxième colonie de maternité de chauves-souris était d’environ 5 m3 bâtiment qui abritait jusqu’à 1 200 chauves-souris volantes. Cette colonie comptait des chauves-souris adultes toute l’année, mais les nouveau-nés étaient présents à la mi-décembre et les juvéniles entre janvier et mai.
Pour les CoV et dans une moindre mesure pour les PMV, les chauves-souris ont présenté un schéma de mue similaire malgré les différences entre les colonies, notamment la taille de la population et la durée d’occupation. Les variations temporelles étaient probablement associées à la synchronisation des cycles de reproduction et à la parturition des chauves-souris. Les auteurs ont également détecté des chauves-souris co-infectées par des CoV et des PMV, les co-infections étant plus fréquentes dans les PMV et les CoV que dans les AstV. Les résultats de l’étude n’ont pas pu mettre en évidence un schéma clair associé à la variation de la structure par âge de la population et du type de colonie pour les AstV.
À l’inverse, les auteurs ont remarqué des différences marquées dans la prévalence des chauves-souris excrétant des PMV et des CoV entre juin et octobre. Alors qu’ils détectaient des PMV chaque année dans le bâtiment, les CoV étaient indétectables. De plus, ils ont observé des impulsions de perte répétées pour les PMV, mais celles-ci étaient moins prononcées pour les CoV. Curieusement, le schéma d’excrétion des CoV était hautement reproductible entre les saisons de naissance et également synchronisé entre les colonies de chauves-souris maternelles. Ce n’est peut-être pas la taille de la population, mais la structure par âge des RFTB qui a conduit les cycles épidémiologiques du CoV. Les études futures devraient élucider les mécanismes régissant le maintien de la transmission virale dans les populations de chauves-souris pour les PMV et les CoV.
conclusion
L’étude actuelle a remarquablement étudié l’effet de la taille de la population, de la durée de l’occupation et de la structure par âge des colonies de maternité de chauves-souris molosses sur l’excrétion du virus. Cependant, une évaluation globale est nécessaire pour explorer le risque de débordement associé à l’excrétion importante de légumineuses dans les populations de chauves-souris tropicales. De telles études permettraient de mieux évaluer les moteurs impliqués dans la dynamique de transmission virale chez les chauves-souris, au-delà des facteurs liés à l’hôte, en étudiant leurs interactions avec l’environnement et d’autres agents pathogènes infectieux.
*Avis important
bioRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.
