La pandémie de la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) – causée par le nouveau coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2) – a été déclarée en mars 2020, deux mois après la reconnaissance initiale de nouveaux symptômes de type pneumonie dans un groupe des patients à Wuhan, en Chine. Depuis lors, il s’est propagé dans plus de 192 pays et territoires, causant plus de 3,81 millions de décès.
La nécessité de comprendre comment et pourquoi une telle propagation se produit est vitale pour la contenir. Un nouveau medRxiv* la prépublication décrit une réduction significative de la transmission pendant l’été (de 42 %), ce qui est comparable à l’impact de l’intervention non pharmaceutique (IPN) la plus efficace.
Sommaire
Arrière-plan
De nombreuses infections respiratoires, telles que le virus de la grippe (ou « grippe »), ont été documentées pour avoir des taux d’incidence ou des vagues variables. Certaines études antérieures ont suggéré que la transmission de COVID-19 peut également varier avec la température, l’humidité et le rayonnement ultraviolet, tandis que d’autres ont nié une telle association.
Ces facteurs, liés au climat et aux conditions météorologiques, ne sont cependant pas isolés, car ils se conjuguent à de nombreux autres facteurs biologiques et épidémiologiques pour déterminer la dynamique de transmission d’un agent pathogène. Par exemple, la stabilité du virus peut varier avec les conditions météorologiques et climatiques, tout comme le niveau de sensibilité de l’hôte.
Les humains changent également leur comportement avec les saisons, restant à la maison en hiver mais augmentant considérablement leurs activités sociales et de plein air avec le début de l’été. Évidemment, ce dernier sera associé à une opportunité beaucoup plus élevée de transmission virale. Un autre facteur est de savoir si les enfants sont à la maison, à cause des vacances scolaires ou à l’école.
Ainsi, même si la saison de la grippe survient avec «périodicité élégante et prévisible” dans un ensemble donné d’années, le chemin vers cette régularité n’est pas aussi évident que s’il était uniquement causé par les variations saisonnières de la propagation virale.
Comme l’a observé une étude antérieure sur ce sujet :
La reconnaissance de cette complexité, ainsi que de la probabilité que la saisonnalité résulte de nombreux facteurs différents, est essentielle pour un examen et une élucidation continus de la saisonnalité.. «
Examen des changements de transmission en fonction du temps
Pour cette raison, les chercheurs se sont concentrés sur un seul déterminant de la saisonnalité, sous la forme de l’ampleur de la variation du nombre de reproduction en fonction du temps, Rt, sur une année, dans la même région climatique. Cela évite la difficulté d’essayer de démêler les facettes individuelles et interdépendantes de la saisonnalité.
Il est important de noter que le début de la pandémie elle-même a été marqué par la mise en œuvre de NPI de rigueur variable, allant des blocages nationaux et de la fermeture des frontières internationales aux voyageurs en passant par les directives sur le port du masque. Étant donné qu’elles sont dures pour les gens et pour l’économie, elles ont été resserrées et assouplies plusieurs fois de suite au cours des 18 mois qui ont suivi leur première imposition.
Ainsi, l’effet des NPI sur la saisonnalité de cette pandémie doit être pris en compte afin de comprendre comment la saisonnalité entraîne la transmission du virus.
Diminution de 42 % de la transmission estivale
Les scientifiques ont utilisé les données d’études plus anciennes basées uniquement en Europe pour déterminer comment les facteurs environnementaux et les changements de comportement se traduisaient en effets saisonniers. Cela a montré que le 1er juillet, le pic de l’été, le nombre de reproduction est tombé en dessous du pic de l’hiver (le 1er janvier), la diminution médiane étant de 42%.
Cette réduction était similaire à celle obtenue par le NPI le plus efficace, même si elle était inférieure à celle obtenue par des mesures combinées, telles que la fermeture d’écoles et d’entreprises ; limitation des rassemblements sociaux à moins de 10 à moins de 1 000 ; et les mandats d’hébergement sur place.
Avantages de l’incorporation d’estimations de saisonnalité
Ces estimations de saisonnalité sont restées constantes même lorsque les données étaient limitées aux pays tempérés d’Europe. L’étude a également aidé à comprendre comment la saisonnalité pourrait aider à améliorer la compréhension de l’efficacité réelle des NPI en prenant en compte une partie de la variation résiduelle du Rt.
Par exemple, dans un modèle, une marche aléatoire a été ajoutée au taux de reproduction de base afin d’expliquer de manière dynamique les tendances de transmission en les attribuant à des facteurs qui n’étaient pas inclus dans l’étude. Un tel facteur de marche aléatoire diminuerait, deviendrait plus petit et plus uniforme une fois que la saisonnalité est incluse dans les estimations du taux de reproduction.
Ainsi, le déplacement quadratique moyen (MSD) de la marche aléatoire est de 0,131 log et de 0,072 log lorsqu’il est appliqué à l’estimation non saisonnière et saisonnière, respectivement. Cela signifie qu’une bonne partie de la variation résiduelle est attribuable à la saisonnalité dans les deux cas.
Ces estimations restent robustes lorsque la réduction de la transmission sur n’importe quel jour de saisonnalité de pointe en décembre ou janvier est calculée, avec moins de 5 % de différence entre les estimations de pointe ou de creux.
Quelles sont les implications ?
Les résultats de cette étude indiquent que les taux de transmission de pointe du SRAS-CoV-2 en été sont environ 42% inférieurs, par rapport au pic hivernal, attribuable uniquement à la saisonnalité.
Les résultats sont en corrélation avec les hypothèses antérieures de 10 à 40 % de baisse du taux de transmission de ce virus des pics d’hiver aux pics d’été. Des résurgences peuvent cependant se produire dans les régions plus froides en été comme en hiver, ainsi que dans les pays plus chauds, le Rt restant supérieur à 1.
Il est également important de se rappeler que la latitude modifie tout un éventail de facteurs démographiques, d’attributs socioculturels et épidémiologiques, et donc la dynamique de transmission.
Une attention plus particulière doit être accordée aux aspects distincts de la saisonnalité, en particulier les conditions météorologiques et climatiques par rapport aux changements de comportement, ces derniers étant très uniques en 2020 et peu susceptibles de fonctionner à nouveau dans un proche avenir.
Pourtant, la seule estimation de l’ampleur de la saisonnalité peut être suffisante pour fournir une image de ce qui se passe au fil du temps et pour élaborer une stratégie en conséquence, même sans une connaissance adéquate de chaque facteur distinct. Sa capacité à fournir une idée plus fiable de ce à quoi on peut s’attendre en termes de transmission est susceptible d’être importante pour obtenir des modèles plus précis, en particulier lorsqu’il s’agit de tenir compte des effets des NPI.
Considérant que les vacances scolaires sont responsables d’une grande partie des variations saisonnières des autres maladies virales respiratoires, le fait qu’elles ne soient incluses que comme NPI dans ce modèle souligne l’importance de la saisonnalité observée du SARS-CoV-2. Étant donné que l’immunité de la population s’est construite au cours de la première année de la pandémie, il semble que «à l’avenir, la saisonnalité à long terme du SRAS-CoV-2 dépendra en partie de l’évolution de l’immunité de la population ainsi que de l’émergence de variantes. «
En bref, la saisonnalité peut aider à comprendre la réduction de la transmission du COVID-19 en été en dehors de l’immunité au niveau de la population, favorisant ainsi une bonne préparation à une poussée automnale ou hivernale. Deuxièmement, connaître les limites du rôle joué par les facteurs météorologiques et climatiques aidera à éviter une dépendance excessive aux variations saisonnières et encouragera les stratégies NPI pour contenir la propagation virale.
*Avis important
medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, orienter la pratique clinique/le comportement lié à la santé, ou traités comme des informations établies.
