La propagation des bactéries résistantes aux antibiotiques dans les hôpitaux pourrait être considérablement réduite grâce aux recherches menées par l’Université du Queensland et Queensland Health.
Une équipe comprenant Dr Patrick Harris et Dr Brian Forde de l’UQ Center for Clinical Research a utilisé le séquençage génomique complet comme outil de surveillance pour identifier, suivre et perturber rapidement les agents pathogènes qui causent des infections nosocomiales (IAS) graves.
Le Dr Harris a déclaré que les IASS étaient courantes et liées à de moins bons résultats pour les patients et à des coûts excessifs liés aux soins de santé.
Plus de 9% des personnes admises à l’hôpital en Australie contracteront une HAI et le coût du traitement impose un fardeau énorme sur un système de santé étiré.
L’impact est exacerbé par l’augmentation des taux de résistance aux antimicrobiens.
Si les bactéries résistantes provoquent des maladies graves, telles que des infections du sang, les taux de mortalité peuvent atteindre 20 % ».
Dr Patrick Harris, Centre de recherche clinique de l’UQ
L’étude de quatre ans a comparé les bactéries résistantes aux antibiotiques recueillies auprès de patients dans les hôpitaux du Queensland pour identifier les liens génomiques et, par conséquent, la transmission de patient à patient.
« Les méthodes traditionnelles de contrôle des infections et de diagnostic ne peuvent pas suivre avec précision les bactéries à l’origine de ces infections ou détecter les événements de transmission dans les hôpitaux », a déclaré le Dr Harris.
« Mais les tests génomiques peuvent potentiellement prévenir des centaines d’infections, économiser des millions de dollars en coûts de soins de santé excessifs et, en fin de compte, réduire la souffrance et les décès des patients. »
L’équipe de recherche a séquencé et comparé les génomes de plus de 3 000 bactéries différentes pour fournir une notification précoce du regroupement, une signature clé de la transmission probable à l’hôpital.
Le Dr Forde a déclaré que la clé du succès du projet était l’utilisation continue de la génomique comme outil de surveillance.
« Le déploiement du séquençage de cette manière signifiait que nous pouvions identifier, suivre et interrompre la transmission de ces bactéries en temps réel », a déclaré le Dr Forde.
« En utilisant la génomique avec les données épidémiologiques disponibles, nous avons également pu faire la distinction entre la transmission hospitalière et communautaire et diriger la réponse de contrôle des infections là où elle était le plus nécessaire. »
Le projet, qui a été financé par Queensland Health, a démontré que l’application systématique de la surveillance génomique en temps réel des IASS est faisable.
« Bien qu’elles soient difficiles à mettre en œuvre, les stratégies de prévention des infections fondées sur la génomique sont susceptibles de devenir la nouvelle référence », a déclaré le Dr Forde.
« Les coûts considérables associés à la gestion de ce service seraient justifiés par les économies potentielles pour le système de santé et la prévention accrue des IASS chez les patients vulnérables. »
La recherche, financée par le programme Queensland Genomics de Queensland Health, a été publiée dans Maladies infectieuses cliniques.
