Des chercheurs de l'Institut Karolinska ont mis au point une méthode de dépistage rapide, bon marché et précis de l'infection au COVID-19. La méthode simplifie et libère les tests d'étapes de réaction coûteuses, permettant une mise à l'échelle des diagnostics.
Cela rend la méthode particulièrement intéressante pour les lieux et les situations aux ressources limitées. Il est également intéressant pour les tests répétés et pour déplacer des ressources de diagnostics coûteux vers d'autres parties de la chaîne de soins. L'étude est publiée dans Communications de la nature.
Nous avons commencé à travailler sur la question du développement d'une méthode de test facilement disponible dès que nous avons vu les développements en Asie et en Europe du Sud, et avant que la situation n'atteigne le point de crise en Suède. Notre méthode était effectivement déjà terminée fin avril, et nous avons ensuite rendu toutes les données disponibles gratuitement en ligne. «
Bjorn Reinius, chercheur principal et responsable de la recherche, Département de biochimie médicale et de biophysique, Karolinska Institutet
La propagation du nouveau coronavirus à la fin de 2019 dans la région chinoise de Wuhan s'est rapidement transformée en une pandémie mondiale.
Le taux de transmission relativement élevé et le grand nombre d'infections asymptomatiques ont conduit à un énorme besoin mondial de tests diagnostiques rapides, abordables et efficaces qui pourraient être effectués dans des contextes cliniques et non cliniques.
Les tests diagnostiques établis pour COVID-19 sont basés sur la détection d'ARN viral dans des échantillons de patients, tels que des prélèvements nasaux et de gorge, à partir desquels les molécules d'ARN doivent ensuite être extraites et purifiées.
La purification de l'ARN constitue un goulot d'étranglement majeur pour le processus de test, nécessitant beaucoup d'équipement et de logistique ainsi que des composés chimiques coûteux.
Simplifier les méthodes actuelles sans compromettre notablement leur précision signifie que des tests plus nombreux et plus rapides peuvent être effectués, ce qui contribuerait à réduire le taux de transmission et à faciliter les soins à un stade précoce.
Le groupe de recherche interdépartemental du Karolinska Institutet a maintenant développé des méthodes qui contournent complètement la procédure d'extraction d'ARN, de sorte qu'une fois que l'échantillon du patient a été inactivé par chauffage, rendant les particules virales plus infectieuses, il peut passer directement au réaction diagnostique qui détecte la présence du virus.
Selon les chercheurs, les clés les plus importantes du succès de la méthode sont à la fois la procédure d'inactivation du virus ci-dessus et une nouvelle formulation de la solution utilisée pour collecter et transporter le matériel d'échantillonnage prélevé sur les patients.
«En remplaçant le tampon de collecte par des formulations de tampon simples et peu coûteuses, nous pouvons permettre la détection virale avec une sensibilité élevée directement à partir de l'échantillon clinique d'origine, sans aucune étape intermédiaire», déclare le Dr Reinius.
Les institutions et groupes de recherche du monde entier ont manifesté un grand intérêt pour la méthode depuis la publication d'une première version de l'article scientifique sur le serveur de pré-impression medRxiv.
L'article a été lu plus de 15000 fois avant même d'être revu par d'autres chercheurs dans le domaine et publié officiellement dans Communications de la nature.
«Grâce au faible coût et à la simplicité de la méthode, cela devient une option particulièrement intéressante sur les sites et dans des situations avec des ressources limitées mais un besoin pressant de tester le COVID-19», dit-il et ajoute: «Je voudrais certainement voir que ce test est également utilisé en Suède, par exemple pour des tests périodiques bon marché de personnes asymptomatiques afin d'éliminer la propagation de l'infection. «
La source:
Référence du journal:
Smyrlaki, I., et al. (2020) Des tests COVID-19 massifs et rapides sont réalisables par RT-PCR SARS-CoV-2 sans extraction. Communications de la nature. doi.org/10.1038/s41467-020-18611-5
