*Avis important: medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.
La prévision des trajectoires futures des infections par le coronavirus du syndrome respiratoire aigu sévère 2 (SRAS-CoV-2), des hospitalisations et des décès associés a été essentielle pour prendre des décisions efficaces en matière de santé publique. Ces prévisions peuvent aider les hôpitaux à anticiper les augmentations des demandes de ressources et les décideurs/agences à distribuer des ressources limitées aux zones à haut risque.
Une étude récente publiée sur medRxiv* Les chercheurs du serveur de préimpression de l’Université de Washington ont modélisé les prédictions de la trajectoire pandémique de la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) selon différents scénarios de variantes et d’intervention.
Étude: Prévision de la trajectoire de la pandémie de COVID-19 jusqu’en 2023 selon des variantes plausibles et des scénarios d’intervention : une étude de modélisation mondiale. Crédit d’image : Mila Supinskaya Glaschenko / Shutterstock.com
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les chercheurs ont créé un modèle dynamique sensible-exposé-infectieux (SEI) pour prévoir les trajectoires du COVID-19 pour 2023 selon divers scénarios d’intervention et de variantes du SRAS-CoV-2.
Les résultats de la COVID-19 ont été prédits à l’aide d’un groupe de sous-modèles interconnectés. Le modèle de base était le modèle de transmission SEI qui tenait compte de la vaccination, des infections multiples, des thérapies antivirales et du déclin de l’immunité induite par l’infection et le vaccin.
À l’aide de ce modèle, l’équipe a d’abord estimé les infections, les hospitalisations et les décès historiques par lieu, jour et variante. Une grande partie de cette analyse historique était centrée sur la période Omicron s’étendant sur près de 13 mois de novembre 2021 à décembre 2022. Les mêmes mesures de résultats ont été évaluées selon cinq scénarios d’émergence de nouvelles variantes pour la période du 12 décembre 2022 au 30 juin 2023.
Dans le scénario de variante de base, aucune nouvelle variante virale n’est apparue. Les quatre scénarios restants avaient quelques caractéristiques communes, y compris la même date d’émergence de nouvelles variantes du 15 janvier 2023, l’Afrique du Sud comme lieu d’émergence pour l’identification de nouvelles variantes et suivant le schéma d’invasion d’Omicron, mais différaient dans le paramétrisation de la sévérité et de l’intensité de la transmission. Parmi les scénarios de variantes restants, la variante de type Omicron est apparue dans l’un et une variante de type Delta est apparue dans le second.
Le troisième modèle avait une amélioration du scénario de type Delta, tandis que le modèle de variante final (DeltaCron) était le pire scénario avec l’émergence d’une variante avec des capacités de percée et une intensité de transmission de type Omicron et une gravité de type Delta.
Enfin, l’équipe a évalué le fardeau évitable de la COVID-19 avec trois scénarios d’intervention. Celles-ci comprenaient une utilisation accrue des masques, la réimposition de mandats de distanciation sociale et des doses de rappel spécifiques à la variante pour tous les sujets vaccinés.
Résultats de l’étude
Selon les projections de modélisation, la variante SARS-CoV-2 Omicron était la variante prédominante dans le monde au 27 novembre 2021. Le modèle estimait environ 8,6 milliards d’infections mondiales par le SARS-CoV-2 entre le 15 novembre 2021 et le 12 décembre 2022, avec l’Omicron et ses sous-variantes/lignées responsables de 8,47 milliards d’infections. La plupart des hospitalisations et des décès par rapport aux infections au cours de cette période étaient attribuables à la variante Delta.
Classement du taux de mortalité COVID-19 par habitant par région de l’OMS. La colonne « pandémie à ce jour » située à l’extrême gauche classe le taux de mortalité par habitant pour chaque région pour l’ensemble de la pandémie jusqu’au 12 décembre 2022, par région de l’OMS. Ce classement détermine l’ordre relatif des régions de l’OMS sur l’axe des ordonnées. Les quatre colonnes de droite affichent des classements relatifs pour quatre partitions de la pandémie, correspondant à peu près à (a) la phase pré-variante préoccupante, (b) la phase Alpha, Beta, Gamma, (c) la phase Delta et (d) la phase Omicron.
Presque tous les pays et territoires ont connu au moins une onde Omicron. Pendant les vagues d’Omicron, l’Europe et les Amériques avaient les taux de mortalité par personne les plus élevés, tandis que les régions d’Asie du Sud-Est et du Pacifique occidental ont évité une grande partie des conséquences graves. Le modèle a estimé que 97,3 % de la population mondiale avait été exposée au SRAS-CoV-2 par vaccination, infection ou les deux, au 12 décembre 2022.
Dans le Pacifique occidental, une grande partie de leur exposition était due au vaccin en raison de la politique zéro-COVID de la Chine qui garantissait de faibles taux d’infection. À l’inverse, l’Afrique a été principalement exposée au SRAS-CoV-2 par le biais d’infections en raison de la disponibilité/de l’accès limité aux vaccins. Dans les autres régions, l’exposition était due à la vaccination et à l’infection.
Total cumulé des infections par le SRAS-CoV-2 et des décès par COVID-19 pour la vague Omicron du 15 novembre 2021 au 12 décembre 2022. La colonne de gauche affiche les infections cumulées par le SRAS-CoV-2 par emplacement par nombre (A), taux (C) et taille relative par rapport à l’ensemble de la pandémie jusqu’au 15 novembre 2021 (E). Les valeurs correspondantes pour les décès par COVID-19 sont présentées dans les panneaux B, D et F, respectivement.
Dans le scénario de variante de base, le modèle prévoyait 3,54 milliards d’infections, 6,26 millions d’hospitalisations et 1,58 million de décès.
Dans le deuxième scénario de variante, une variante de type Omicron aurait entraîné 5,19 milliards d’infections, 13,6 millions d’hospitalisations et 2,74 millions de décès, avec plus de 2,6 milliards de cas attribuables à cette variante. Une nouvelle variante avec des caractéristiques de type Delta entraînerait 3,64 milliards d’infections, la nouvelle variante ne représentant que 423 millions d’infections, 7,87 millions d’hospitalisations et 2,87 millions de décès.
Une nouvelle variante améliorée de type Delta entraînerait une charge massive de COVID-19, provoquant 4,5 milliards d’infections, 21,3 millions d’hospitalisations et 11,1 millions de décès. Dans le scénario DeltaCron, une nouvelle variante avec une gravité de type Delta et une infectivité de type Omicron aurait entraîné le même nombre d’infections que dans le scénario de type Omicron, mais 30,2 millions et 15,9 millions d’hospitalisations et de décès, respectivement.
L’augmentation de l’utilisation du masque à 80% de la population a été postulée pour prévenir au moins 15% des décès prévus dans les régions et les scénarios de variantes. Le scénario de réimposition du mandat de distanciation sociale n’aurait été que modérément ou modérément efficace. Dans le scénario d’intervention de rappel spécifique à la variante, le rappel ciblé a eu un impact minimal, avec seulement une réduction de 3,2 % de la mortalité mondiale due au COVID-19.
La combinaison des scénarios d’utilisation de masque et de réimposition de mandat aurait évité jusqu’à 36 % des décès estimés liés au COVID-19 d’ici juin 2023. Ce scénario d’intervention conjointe aurait évité 5,44 millions de décès dans le scénario DeltaCron et un minimum de 19 % des décès estimés dans tous les régions et variantes de scénarios.
conclusion
Les chercheurs de l’étude actuelle ont exploré différents scénarios qui reflétaient l’émergence potentielle de nouvelles variantes du SRAS-CoV-2 dans le cadre de plusieurs approches interventionnelles. Les rappels accélérés de vaccins spécifiques aux variants ont eu peu d’impact, quelles que soient la transmissibilité et la gravité des variants existants et futurs.
Notamment, l’augmentation de l’utilisation du masque a été associée à des réductions substantielles des taux d’infection et de mortalité, tandis que la réimposition du mandat a légèrement/modérément réduit la future charge de COVID-19. La combinaison de ces deux interventions a conduit à un impact encore plus significatif qu’individuellement. Surtout, l’analyse a montré que des interventions simples, y compris des mandats de masquage et de distanciation sociale, pourraient être des outils essentiels contre le COVID-19.
*Avis important: medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.
