Synthego, la société d'ingénierie du génome, a collaboré avec le Krogan Lab, une unité de recherche scientifique de renommée mondiale au Quantitative Biosciences Institute (QBI) de l'Université de Californie à San Francisco (UCSF), pour fournir plusieurs lignées cellulaires d'ingénierie basées sur CRISPR pour accélérer l'étude des cibles potentielles de traitement du SRAS-CoV-2, le nouveau coronavirus responsable de la maladie COVID-19.
Dans une étude publiée dans Science, le consortium de chercheurs a utilisé des cellules conçues par Synthego ciblant plus de 300 gènes avec lesquels le virus interagit à l'intérieur d'une cellule humaine.
«L'utilisation de la plate-forme d'ingénierie génomique CRISPR, leader de l'industrie, a été essentielle pour accélérer nos recherches au sein du groupe de recherche sur les coronavirus de QBI», a déclaré le Dr Krogan, professeur à l'UCSF, directeur de QBI et chercheur principal aux instituts Gladstone. « La précision et la reproductibilité de CRISPR ont été essentielles pour nous aider à étudier comment le SRAS-CoV-2 affecte les voies cellulaires et provoque finalement des maladies, améliorant notre validation de cibles thérapeutiques prometteuses qui peuvent offrir une large protection contre l'infection par les coronavirus. »
Dans cette collaboration, Synthego a rejoint des scientifiques universitaires et du secteur privé de l'UCSF, du groupe de recherche sur le coronavirus de QBI (QCRG), des instituts Gladstone, de l'Institut européen de bioinformatique de l'EMBL (EMBL-EBI) à Cambridge, en Angleterre, du Georgia Institute of Technology, de la Icahn School of Medicine à Mount Sinai à New York, Institut Pasteur à Paris, Université de Fribourg en Allemagne et Université de Sheffield au Royaume-Uni.
Inspiré par la publication Nature de l'UCSF, «Une carte d'interaction des protéines SRAS-CoV-2 révèle des cibles pour la réutilisation des médicaments», Synthego a étendu son expertise et ses technologies de plate-forme pour valider les cibles identifiées dans l'étude en éditant les gènes individuellement et en série. Cette approche a révélé quels gènes et voies cellulaires sont essentiels pour que le virus infecte et / ou se développe à l'intérieur des cellules humaines grâce à une analyse d'infectivité.
Contribuer au travail critique d'une équipe internationale de près de 200 chercheurs de 14 institutions de premier plan dans six pays a été un immense honneur. Des publications récentes, combinées à notre prochaine Journée mondiale CRISPR, soulignent notre expertise scientifique croissante et notre leadership dans l'application des dernières innovations des plateformes d'ingénierie du génome pour faire progresser la recherche en sciences de la vie et le développement clinique. «
Kevin Holden, co-auteur de l'étude et directeur scientifique, Synthego
Le Dr Krogan parlera plus en détail de la Science et l'effort de collaboration lors du prochain symposium de la Journée mondiale CRISPR de Synthego, qui comprendra également un discours liminaire de la lauréate du prix Nobel Jennifer Doudna, Ph.D.