Dans une récente étude publiée sur medRxiv* serveur de préimpression, les chercheurs ont évalué les symptômes de la maladie à coronavirus spécifique à la variante 2019 (COVID-19) du coronavirus du syndrome respiratoire aigu sévère 2 (SRAS-CoV-2) chez les résidents d’Angleterre.
Les patients positifs au SRAS-CoV-2 présentent un large éventail de symptômes, qui diffèrent parmi les patients en fonction de la variante causale du SRAS-CoV-2. L’identification des personnes à haut risque de contracter des infections par le SRAS-CoV-2 ou de transmettre le SRAS-CoV-2 par leurs profils de symptômes profiterait à la population, car les autorités sanitaires et les gouvernements ont commencé à lever les restrictions liées au COVID-19.
L’étude REaltime Assessment of Community Transmission-1 (REACT-1) a suivi la prévalence et la transmission des infections par le SRAS-CoV-2 et leurs manifestations cliniques parmi la population générale d’Angleterre entre le 1er mai 2020 et le 31 mars 2022.
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les chercheurs ont évalué la Symptômes COVID-19 spécifiques à la variante du SRAS-CoV-2 parmi la population anglaise.
La symptomatologie COVID-19 des participants à l’étude REACT-1 a été analysée pour les souches SARS-CoV-2 suivantes : type sauvage, Alpha (B1.1.1.7), Delta (B.1.617.2), Omicron BA.1 ( B.1.1.529.1) et Omicron BA.2 (B.1.1.529.2) et les symptômes corrélés à des charges virales (ou infectiosité) plus élevées ont été identifiés pour chaque variante. Les participants à l’étude REACT-1 ont rempli un questionnaire (téléphonique ou en ligne) sur leurs données démographiques et leurs symptômes et ont auto-collecté leurs échantillons d’écouvillonnage oropharyngé et nasopharyngé pour les tests de réaction en chaîne par polymérase (PCR).
Un total de 26 symptômes probables de COVID-19 ont été enrôlés, et les répondants ont mentionné s’ils avaient développé l’un des symptômes au cours de la semaine précédant leurs tests PCR. La liste des symptômes comprenait un changement ou une perte de goût ou d’odorat, des symptômes pulmonaires/cardiovasculaires, des symptômes de rhume et de grippe, des symptômes gastro-intestinaux, des symptômes de fatigue et autres.
Pour l’analyse, les données de 15 séries d’études REACT-1 menées entre le 19 juin 2020 et le 31 mars 2022 ont été analysées. Les cycles 2 à 7 ont été menés entre le 19 juin et le 3 décembre 2020, pendant la prédominance des souches de type sauvage ; les rondes 8 à 10 se sont déroulées entre le 6 janvier, et le 29 mars 2021, pendant la prédominance Alpha ; les rondes 13 à 15 ont été menées entre le 24 juin et le 5 novembre 2021, pendant la prédominance Delta ; et les séries 17 à 19 ont été menées entre le 5 janvier et le 31 mars 2022, pendant la prédominance d’Omicron.
Les données de quelques tours (1, 11, 12, 16) ont été exclues de l’analyse car les questions du tour 1 étaient incompatibles avec les tours suivants, et les autres tours (11, 12 et 16) ont été menés lorsque deux variantes étaient en concurrence pour la prédominance.
De plus, la sévérité des symptômes des infections à Omicron BA.1 et Omicron BA.2 a été évaluée parmi les participants positifs à l’écouvillon qui ont été vaccinés en rappel (triple) 14 jours avant les tests PCR. Enfin, l’association entre le gène de la nucléocapside (N), la valeur du seuil de cycle (Ct) et les profils de symptômes a été évaluée chez les participants positifs à l’écouvillonnage des cycles 17 à 19 (prédominance d’Omicron). Des modèles de régression logistique et des rapports de cotes (OR) ont été utilisés pour estimer le risque de positivité des écouvillons PCR et comparer les profils de symptômes par variante.
Résultats
L’analyse finale comprenait 17 448 participants positifs à la PCR ou à l’écouvillonnage, dont 0,4 %, 0,6 %, 0,7 % et 4 % étaient infectés par le type sauvage, Alpha, Delta et Omicron, respectivement. La plupart des participants positifs à l’écouvillonnage qui ont signalé les symptômes du COVID-19 enrôlés avaient des infections à BA.2 (76 %) par rapport à ceux infectés par Omicron BA.1 (70 %), Delta (64 %), Alpha (55 %) et souches de type sauvage (45%).
La prévalence la plus élevée des symptômes de COVID-19 parmi les participants a été observée de janvier à mars 2022 pendant la prédominance d’Omicron (22 %). Les participants infectés par Omicron BA.2 ont signalé une moyenne de six symptômes par semaine avant les tests PCR, ce qui est supérieur au nombre de symptômes (n) signalés en raison d’infections de type sauvage (2,7), Alpha (3,4), Delta (4,6 ), et Omicron BA.1 (4.6). En outre, un nombre plus élevé de participants infectés par BA.2 (18 %) ont mentionné que leurs symptômes de COVID-19 affectaient considérablement (« beaucoup ») leur capacité à effectuer des activités quotidiennes par rapport à toute autre variante d’infection.
Tous les symptômes COVID-19 signalés étaient en corrélation avec la positivité de l’écouvillon (PCR) pour toutes les variantes du SRAS-CoV-2. Les OR pour la positivité des écouvillons et la corrélation des symptômes étaient les plus élevés pour les infections à Omicron BA.2 (OR = 13) par rapport à ceux de type sauvage (5,2), Alpha (6), Delta (9,5) et Omicron BA.1 (9,6 ) infections. Pour les souches Delta, Alpha et de type sauvage, les OR les plus élevés de positivité des écouvillons observés concernaient le changement/perte d’odorat (OR 73, 38 et 50, respectivement) ou le changement/perte de goût (OR 68 39 et 36, respectivement ).
En revanche, pour les variantes Omicron BA.1 et Omicron BA.2, les symptômes de type rhume et grippal prédisaient mieux la positivité de l’écouvillon ; les OR symptomatiques les plus élevés observés étaient de la fièvre : OR 18 et 30 pour BA.1 et pour BA.2, respectivement contre 13 et 17, respectivement pour altération/perte de l’odorat, et 16 et 21, respectivement altération/perte du goût . Des associations positives ont été observées entre les infections à BA.2 et les symptômes du COVID-19 tels que fatigue intense, douleurs thoraciques, douleurs musculaires, nez qui coule, fatigue, éternuements, frissons, fièvre, fatigue, maux de tête et nez bouché.
Parmi les participants vaccinés par rappel, les participants infectés par BA.2 ont montré une probabilité 64% plus élevée de signaler des symptômes de COVID-19 qui ont considérablement interféré (« beaucoup ») avec leurs performances quotidiennes. De plus, les hommes ont montré 40% de probabilité en moins de signaler des symptômes de COVID-19 qui ont considérablement interféré (« beaucoup ») avec leur travail quotidien. Les valeurs de Ct étaient plus faibles chez les participants infectés par Omicron BA.2 et symptomatiques que chez les participants infectés par BA.1 et asymptomatiques. Pour les infections à Omicron (cycles 17 à 19), les patients qui ont signalé plus de symptômes de COVID-19 ont présenté des scores Ct inférieurs.
Dans l’ensemble, les résultats de l’étude ont mis en évidence des profils de symptômes par variante des infections par le SRAS-CoV-2 et un changement dans l’association entre la notification des symptômes et les scores Ct pour les infections à Omicron.
*Avis important
medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.
