L’étude évalue la présence de la protéine de la pointe SARS-CoV-2 en échantillons d’urine rassemblés pendant la pandémie COVID-19

Le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2), l’agent causal de la maladie à coronavirus (COVID-19), a causé près de 493 millions d’infections avec plus de 6,15 millions de décès signalés. Le SRAS-CoV-2 est un bêta-coronavirus qui infecte généralement les chauves-souris, mais qui a également le potentiel d’infecter les humains.

Contexte

Le SRAS-CoV-2 pénètre dans l’hôte humain en attachant sa protéine de pointe (S) aux récepteurs humains de l’enzyme de conversion de l’angiotensine 2 (ACE2). Par conséquent, le dépistage de la protéine de pointe pourrait être une méthode puissante possible pour surveiller les infections par le SRAS-CoV-2. L’ACE2 humain est exprimé dans les cellules épithéliales des systèmes rénal, alvéolaire, cardiaque, artériel et gastro-intestinal, suggérant une possibilité d’invasion d’autres organes par le virus en plus du système respiratoire.

L’étude

Une étude publiée dans Rein360 analysé la présence de la protéine de pointe SARS-CoV-2 dans des échantillons d’urine des patients infectés. Dans cette étude, l’infection par le SRAS-CoV-2 a été confirmée par des tests de réaction en chaîne par polymérase (PCR) effectués sur des échantillons extraits par écouvillonnage nasopharyngé (NP-PCR).

Résultats

Des échantillons d’urine ont été prélevés dans deux hôpitaux (dont un hôpital pour enfants). Pour détecter la protéine de pointe du SRAS-CoV-2 dans les échantillons d’urine, un test immuno-enzymatique sandwich (ELISA) a été développé à l’aide d’anticorps biotinylés et d’anticorps monoclonaux anti-pointe. Le test a ensuite été optimisé en utilisant l’urine des individus SARS-CoV-2 négatifs et un antigène S1 recombinant purifié.

Le test a été utilisé pour déterminer la limite inférieure de détection (LOD) – 5ng/ml de protéine dans l’urine. Le HCoV-HKU1 (coronavirus causant un rhume et un impact clinique modéré) et les protéines de pointe recombinantes du SRAS-CoV-2 ont été utilisés pour évaluer la spécificité des anticorps.

Aucune réactivité croisée n’a été détectée avec la protéine de pointe SARS-CoV ou HCoV-HKU1 à LOD, bien qu’ELISA ait révélé un signal faible avec la protéine de pointe SARS-CoV à LOD. La spécificité des anticorps pour la protéine de pointe du SRAS-CoV-2 a été confirmée à l’aide d’une analyse Western blot.

Utilisant l’analyse, 253 échantillons d’urine (de 152 patients) ont été examinés pour la protéine de la pointe SARS-CoV-2. Parmi ceux-ci, 203 échantillons (provenant d’adultes et d’enfants) étaient positifs au SARS-CoV-2 NP-PCR. Des échantillons négatifs pour le SARS-CoV-2 NP-PCR provenant de travailleurs de la santé et d’enfants, ceux collectés avant la pandémie de COVID-19 et des échantillons de participants adultes négatifs pour le SARS-CoV-2 ont été utilisés comme témoins.

Les mesures ont été standardisées en calculant le rapport protéine-créatinine dans les échantillons d’urine. Sur les 203 échantillons, 29 étaient positifs pour la protéine de pointe du SRAS-CoV-2. Fait intéressant, des niveaux élevés de protéine de pointe du SRAS-CoV-2 ont été détectés dans l’échantillon d’urine d’un enfant négatif au SARS-CoV-2 NP-PCR.

Bien qu’aucune protéine de pointe du SRAS-CoV-2 n’ait été détectée dans les échantillons d’urine d’enfants positifs à la NP-PCR, de participants pré-COVID-19 et d’agents de santé adultes. Une corrélation entre le sexe et la protéine de pointe du SRAS-CoV-2 n’a pas pu être détectée parmi 20 participants sur les 23 participants positifs à la protéine de pointe du SRAS-CoV-2. Aucune information n’était disponible sur le sexe des trois participants restants.

De plus, il n’y avait aucune corrélation significative entre l’indice de masse corporelle (IMC), la durée d’hospitalisation et la positivité de la protéine de pointe SARS-CoV-2. L’albumine et la cystatine C n’ont pas non plus induit de corrélation avec l’âge, l’IMC et la durée d’hospitalisation. La présence de la protéine de pointe SARS-CoV-2 n’a pas montré d’association avec la charge virale SARS CoV-2 chez les patients SARS-CoV-2 NP-PCR-positifs.

La protéine de pointe du SRAS-CoV-2 a été détectée chez 17 (sur 23) patients positifs au SRAS-CoV-2 du 1er au 44e jour pendant l’hospitalisation (deux échantillons d’urine ont été prélevés sur chaque patient). Cependant, la concentration de la protéine de pointe SARS-CoV-2 n’a pas pu être corrélée au jour de la collecte de l’échantillon d’urine. Seuls deux des 93 patients positifs à la NP-PCR avaient de l’ARN viral dans les urines ; une (femelle) était positive pour l’ARN viral et la protéine de pointe.

Les adultes positifs pour la protéine de pointe SARS-CoV-2 ont révélé une bande de 78,3 kD co-migrant avec l’antigène S1 recombinant. Cependant, la protéine S1 n’a pas été trouvée chez les travailleurs de la santé, les échantillons pré-COVID-19 et les adultes positifs au SRAS-CoV-2 avec la protéine S1 détectée dans l’urine (Ur-S1).

La concentration d’albumine dans l’urine était de 0,073 dans la cohorte positive à la NP-PCR (prélevée auprès de dix patients ayant subi une biopsie rénale avant la pandémie) ; tandis que la concentration urinaire de cystatine C était de 0,00014. Parmi les patients SARS-CoV-2 spike protein-positifs, la concentration d’albumine urinaire était de 0,089, alors que la concentration de cystatine C était de 0,00012.

Parmi les patients positifs à la NP-PCR, la concentration d’albumine dans l’urine était de 0,061 tandis que la concentration de cystatine C était de 0,00012. Pendant ce temps, chez les travailleurs de la santé positifs à la NP-PCR, la concentration d’albumine dans l’urine était de 0,011 tandis que la concentration de cystatine C était de 0,00007.

Une corrélation significative entre la concentration de la protéine de pointe du SRAS-CoV-2 et le rapport albumine-créatinine élevé dans l’urine a été détectée. Pendant ce temps, aucune corrélation n’a été trouvée entre les niveaux d’albumine et de cystatine C et les niveaux de protéine de pointe du SRAS-CoV-2 dans les échantillons d’urine prélevés sur deux patients NP-PCR-positifs.

Il n’y avait aucune différence significative entre la présence ou l’absence de la protéine de la pointe SARS-CoV-2 et le taux de créatinine sérique. Aucune différence significative n’a été trouvée entre l’excrétion fractionnée des niveaux d’urée (FEUrea) et de sodium (FENa), et les échantillons positifs et négatifs pour la protéine de pointe.

Dans l’ensemble, 49 échantillons de sérum provenant de 38 patients positifs pour le SRAS-CoV-2 ont été examinés à l’aide du test ELISA de capture de pointe. Quatre échantillons de trois participants ont révélé des niveaux de protéines de pointe sériques supérieurs à la limite de détection. Aucun des échantillons n’était positif pour le test ELISA. Ainsi, aucune association n’était présente entre des niveaux élevés de protéine de pointe urinaire et de protéine de pointe sérique. concentration.

Conclusion

Les résultats suggèrent la possibilité de complications rénales dues au COVID-19, justifiant davantage d’études sur les effets rénaux de l’infection par le SRAS-CoV-2.