L'arrivée de l'automne dans les pays tempérés a fait craindre que la baisse de l'incidence du COVID-19 soit sur le point d'inverser sa tendance, alors que la hausse saisonnière de la grippe et d'autres virus respiratoires commence à se manifester.
Une étude récente menée par des chercheurs du Brigham and Women's Hospital, de l'École de médecine de l'Université Emory et du Beth Israel Deaconess Medical Center et publiée sur le serveur de pré-impression medRxiv* en octobre 2020 indique que jusqu'à présent, les mesures de confinement mises en place pour prévenir la propagation du coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2) ont efficacement empêché la transmission de nombreux autres virus respiratoires. Cela aidera à la fois les administrateurs des soins de santé et les laboratoires à se préparer à de telles infections saisonnières à l'avenir.
Sommaire
NPI et virus respiratoires non COVID-19
La pandémie de COVID-19 dans les pays froids a commencé en janvier 2020, qui était également la saison de pointe pour la grippe et d'autres virus respiratoires saisonniers. Ceux-ci partagent une voie de transmission commune, principalement par gouttelettes respiratoires et par contact. Auparavant, il y avait une grande inquiétude que si de multiples épidémies de ces virus co-survenaient, la crise économique, ainsi que la surcharge du système de santé, pourraient s'intensifier davantage.
La propagation rapide du SRAS-CoV-2 entre les populations du monde entier a conduit à la mise en œuvre d'une série d'interventions non pharmaceutiques (INM) visant à contenir le virus. Beaucoup concernaient l'ensemble de la population, qu'il s'agisse d'un verrouillage, d'un abri sur place, de fermetures d'écoles et de collèges et d'interdictions de magasins. Les masques faciaux étaient recommandés pour le port dans les espaces publics, ainsi que le maintien strict de la distance physique lors des interactions sociales en dehors de la maison et de l'espace de vie, ainsi que le lavage des mains et les pratiques générales d'hygiène.
De nombreux articles de recherche du monde entier ont montré que ces mesures réduisaient simultanément l'incidence annuelle des maladies virales respiratoires saisonnières par rapport aux années précédentes. L'étude actuelle visait à mesurer l'influence de ces INP sur d'autres virus respiratoires, en particulier la grippe A, la grippe B et le virus respiratoire syncytial (RSV). L'étude comprenait deux grands centres universitaires américains à Atlanta, en Géorgie et à Boston, dans le Massachusetts, couvrant la période de janvier à mai 2020.
Cas par semaine de grippe A et de bande SARS-CoV-2 des saisons 20 15-2020 dans les systèmes MGB Healthcare à Boston (panneau A) et à l'Université Emory à Atlanta (panneau B) par semaine de saison des virus respiratoires. Notez que le changement de y-ax est l'échelle pour les cas de Boston SARS-CoV-2 (panneau A). Comparaison du nombre de reproducteurs au fil du temps, R, pour la grippe A et B au cours des saisons précédentes (la moyenne des saisons 20 I 5-201 6 à 20I 8-20 19, comme illustré par la ligne noire) par rapport aux 20 19- Saison 2020 comme le montre la li ne rouge, pour Boston (panneau C) et Atlanta (panneau D). La ligne horizontale pointillée noire indique R, de 1,0. La ligne verticale en pointillé rouge représente la date approximative à laquelle les NPls ont été lancées à Atlanta et à Boston (semaine 13).
Réduction du nombre de cas et du Rt
Les chercheurs ont utilisé les dossiers médicaux de tous les adultes testés pour ces virus au cours des cinq dernières saisons dans ces deux centres, soit environ 154 000 personnes au total. La saison explorée allait de septembre à mai de l'année suivante, 22 semaines en tout. Tous les tests impliquaient des écouvillons nasopharyngés testés pour les virus ci-dessus, un petit groupe étant testé pour le SRAS-CoV-2 à l'aide d'écouvillons oropharyngés et d'échantillons des voies respiratoires inférieures.
Ils ont constaté que le nombre total de cas de grippe A et B, de RSV et de SRAS-CoV-2 par semaine et par saison avait considérablement diminué au cours de la saison 2019-2020. Le nombre de reproducteurs pour chaque pathogène au fil du temps, Rt, défini par le rapport du nombre de nouveaux cas positifs en une semaine au nombre de cas positifs au cours de la semaine précédente, a également été estimé.
Ils ont constaté qu'à Atlanta, les infections grippales A avaient un Rt en baisse inférieur à 1,0 à la semaine 12 de la saison 2019-2020. En revanche, il n'est pas descendu en dessous de 1,0 avant la semaine 15 au cours des cinq dernières années. Fait intéressant, cela coïncide avec la détection du premier cas de COVID-19 dans cette ville, au cours de la semaine 11, qui a conduit à des restrictions sur les rassemblements sociaux et les commandes au domicile au cours des semaines 12-13.
Pour la grippe B, la baisse des cas a conduit à presque zéro cas chaque semaine après la semaine 13, tandis que les années précédentes, le Rt est tombé en dessous de 1,0 seulement après la semaine 15. Pour le RSV, le Rt est tombé en dessous de 1,0 seulement à la semaine 13 par rapport à la semaine. 14 dans les saisons précédentes.
Ces tendances ont été observées à Boston, où la grippe A Rt est tombée en dessous de 1,0 à la semaine 7 et proche de zéro à la semaine 14, alors que dans les saisons précédentes, elle est tombée en dessous de 1,0 de manière constante seulement après la semaine 15. Avec la grippe B, la Rt était inférieure à 1,0 à semaine 11 contre semaine 15 des saisons précédentes. Le Rt du RSV est tombé en dessous de 1,0 entre les semaines 12 et 15 de la saison en cours, mais cela ne s'est jamais produit au cours des saisons précédentes.
Les chercheurs concluent: « La mise en œuvre des NPI a été un facteur critique pour réduire la propagation du SRAS-CoV-2 à l'échelle mondiale. » Cela est étayé par la preuve d'une baisse du Rt et du nombre de cas pour trois virus respiratoires saisonniers dans deux villes des États-Unis, qui sont éloignées l'une de l'autre. En réduisant les chances de transmission de ces virus, les INP ont également joué un rôle important dans le contrôle de ces pathogènes respiratoires.
Ces résultats aideront à estimer les chances qu'une infection respiratoire donnée ait le COVID-19 par rapport à la grippe et lors du dépistage du COVID-19. L'étude montre également l'importance de la distance physique pour réduire la morbidité et la mortalité liées aux virus respiratoires saisonniers.
Implications
Au cours de la saison à venir, l'évolution des schémas d'infection par ces quatre virus deviendra plus apparente. La réduction déjà apparente des cas de grippe au cours de la dernière saison a eu un impact sur la capacité de prédire les souches en circulation dans les mois à venir. Les restrictions aux voyages internationaux joueront également un rôle dans ces changements au fil du temps, nécessitant une étude plus approfondie pour comprendre le plein impact de la pandémie sur la propagation de la grippe et sa population cible.
Un autre facteur qui ne peut être exclu est le nombre plus faible de consultations médicales pour la grippe et d'autres virus respiratoires pendant la saison pandémique et la baisse des tests pour de tels diagnostics dans l'ensemble, étant donné la nécessité de conserver les ressources pour les tests COVID-19.
Les chercheurs évoquent également la possibilité de « interférence virale respiratoire, « dans laquelle une épidémie virale interfère avec la dynamique d'une autre, peut-être en raison d'une immunité non spécifique contre plusieurs virus respiratoires provoqués par une infection aiguë.
L'étude conclut, « Les données démontrent que les IPN sont probablement efficaces pour réduire la transmission de la grippe et du SRAS-CoV-2. «
Cela pourrait aider à façonner des politiques efficaces pour déployer des NPI, à la fois pour éviter les erreurs de diagnostic avec plusieurs virus en circulation et une charge écrasante pour le système de santé.
*Avis important
medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique / les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.
