Dans une étude récente publiée dans le Clinical Nutrition Journal, les chercheurs ont déterminé l’association entre le microbiome intestinal et l’alimentation avec les résultats de l’infection par le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SARS-CoV-2).
Étude: Association du microbiote intestinal et de l’apport en composants alimentaires avec COVID-19 : une étude de randomisation mendélienne. Crédit d’image : ChristophBurgstedt/Shutterstock.com
Sommaire
Arrière-plan
La maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) a entraîné une morbidité et une mortalité inhabituelles dans le monde entier. Compte tenu de la rareté des médicaments spécifiquement conçus pour traiter les infections par le SRAS-CoV-2, il est essentiel de comprendre les facteurs de risque liés à la sensibilité et à la gravité du COVID-19 pour prévenir et gérer le COVID-19 et réduire son fardeau mondial.
Des études de type observationnelles récemment publiées ont révélé que le microbiote intestinal des individus positifs au SRAS-CoV-2 est significativement altéré.
De plus, l’accumulation de preuves indique qu’une nutrition optimale peut aider à prévenir et à atténuer le COVID-19. Néanmoins, les données sur l’effet causal du microbiome intestinal et de l’alimentation sur le risque de COVID-19 sont limitées.
À propos de l’étude
La présente étude a estimé la causalité du microbiome intestinal et du régime alimentaire sur la sensibilité et la gravité du COVID-19.
L’équipe a effectué une analyse génétique de randomisation mendélienne (MR), y compris des variantes génomiques comme variables instrumentales pour le microbiome intestinal, l’apport alimentaire et les infections par le SRAS-CoV-2.
Pour l’étude, 18 340 individus ont été recrutés dans 24 groupes, principalement européens (132 266 individus), avec 211 taxons (respectivement 131, 35, 20, 16 et neuf genres, familles, ordres, classes et embranchements).
Les chercheurs ont obtenu des données statistiques récapitulatives sur le microbiome intestinal et les phénotypes associés au COVID-19 à partir d’études d’association à l’échelle du génome (GWAS) précédemment publiées et accessibles au public organisées par le consortium international MiBioGen (génome du microbiome) et l’infection SARS-CoV-2 Host Genetics Initiative (HGI, cinquième version), respectivement.
Trois phénotypes associés au COVID-19 ont été dérivés : infection par le SRAS-CoV-2 (38 984 et 1 644 784 cas et témoins de COVID-19, respectivement) ; infection grave par le SRAS-CoV-2 (5 101 et 1 383 241 cas et témoins de COVID-19, respectivement) ; et infection par le SRAS-CoV-2 nécessitant une hospitalisation (3 159 et 7 206 cas et témoins de covid-19, respectivement).
Des informations diététiques sommaires ont été extraites de l’unité d’épidémiologie intégrative du Medical Research Council (MRC) de la deuxième analyse de l’Université de Bristol (IEU) dans la biobanque du Royaume-Uni (UK).
Phénotypes alimentaires, y compris la consommation d’alcool, d’eau, de thé, de café, de céréales, de pain, de viande transformée, de porc, de volaille, de mouton, de poisson gras et non gras, de bœuf, de fruits frais, de légumes crus, de fromage, de sel et de type de lait consommé, ont été utilisés.
Le microbiome intestinal a été profilé en ciblant trois sites variables du gène de l’acide ribonucléique ribosomal (ARNr) 16S.
Les polymorphismes mononucléotidiques (SNP) liés à l’exposition à l’étude avec une signification au niveau du génome ont été sélectionnés comme variants instrumentaux (IV).
L’approche pondérée de la variance inverse (IVW) a été utilisée pour estimer la causalité, et une modélisation à effets aléatoires et à effets fixes a été effectuée pour l’analyse des données hétérogènes et homogènes, respectivement, afin de déterminer les rapports de cotes (OR).
Résultats
Ruminococcustorques a considérablement réduit le risque d’infection par le SRAS-CoV-2 (rapport de cotes 0,5). Ruminococcaceae UCG013 a potentiellement augmenté le risque de COVID-19 (odds ratio 1,4), tandis que Ruminococcus1 a potentiellement réduit le risque (odds ratio FE 0,7).
En outre, Ruminococcustorques (rapport de cotes 0,2) et Bifidobactéries (rapport de cotes 0,5]étaient potentiellement liés à un risque réduit d’infection grave par le SRAS-CoV-2.
Au contraire, Bifidobactériacées (rapport de cotes 2,1), Tyzzerella3 (rapport de cotes FE 2.2), et Actinobactéries (rapport de cotes 2,5) étaient potentiellement liés à un risque élevé d’infection grave par le SRAS-CoV-2. Bifidobactériacées (rapport de cotes CONCERNANT 2.1), Tyzzerella3 (rapport de cotes 2,2), et Actinobactéries (rapport de cotes 2,5) a potentiellement augmenté le risque d’infection grave par le SRAS-CoV-2.
Un lien évocateur entre l’infection par le SRAS-CoV-2 et plus Victivallis compte (rapport de cotes 2,0). De plus, les infections sévères par le SRAS-CoV-2 génétiquement estimées étaient significativement liées à une augmentation Turicibacter compte (rapport de cotes 1,1) et moins Olsenelle compte (rapport de cotes 0,9).
Une infection grave par le SRAS-CoV-2 était potentiellement liée à une augmentation Ruminocoque1 compte (rapport de cotes 1,1) et réduit CandidatusSoleaferrea (rapport de cotes effets aléatoires 0,9) et Parasutterella compte (rapport de cotes 0,9).
Concernant l’apport alimentaire, la consommation de viande transformée a augmenté de manière significative le risque de COVID-19 (rapport de cotes 1,7). Les résultats ont indiqué que la consommation de bœuf augmentait le risque de COVID-19 (rapport de cotes 2,0), tandis que la consommation de fruits frais (rapport de cotes 0,3) réduisait le risque d’infection grave par le SRAS-CoV-2.
De plus, l’ajout de sel aux aliments (rapport de cotes de 1,9) a potentiellement augmenté le risque d’infection grave par le SRAS-CoV-2. Les analyses supplémentaires ont donné des résultats similaires sans hétérogénéités significatives ni pléiotropie horizontale dans les analyses de sensibilité.
conclusion
Dans l’ensemble, les résultats de l’étude ont confirmé les effets causals du microbiome intestinal et de l’alimentation sur les infections par le SRAS-CoV-2.
Le nombre de microbes appartenant à des genres tels que Ruminococcustorques, Ruminococcaceae UCG013, Ruminocoque1, Tyzzerella3ordre des Bifidobactéries, Bifidobactérieset classe Actinobactériesa pourrait augmenter la sensibilité au COVID-19 ainsi que sa gravité.
De plus, la consommation de viande transformée, de bœuf, de fruits frais et de sel ajouté peut avoir un impact sur le risque et la gravité des infections par le SRAS-CoV-2. Les effets inverses des infections par le SRAS-CoV-2 sur les altérations microbiennes de l’intestin ont également été observés.
Les infections par le SRAS-CoV-2 peuvent altérer la numération intestinale des Oscillospire, Lachnospire, Victivallis, RuminococcaceaeUCG009, Olsenelle, Turicibacter, Parasutterella, CandidatusSoleaferreaet Ruminocoque1 genres.
