Un aperçu de la fonction de la protéine nucléocapside pourrait aider à développer des médicaments qui réduisent l’impact du coronavirus.
Une collaboration multicentrique suivant la propagation et l’évolution du virus SARS-CoV-2 en Arabie saoudite a identifié des mutations dans la protéine N du virus associées à une augmentation des charges virales chez les patients COVID-19. L’étude donne un aperçu de la fonction de cette protéine de nucléocapside, qui pourrait aider à développer des médicaments qui réduisent l’impact de l’infection à coronavirus.
La protéine de la nucléocapside (N) est la protéine la plus abondante dans tous les coronavirus, y compris le SARS-CoV-2. »
Muhammad Shuaib, chercheur scientifique KAUST
Cette protéine se lie à diverses parties de l’ARN viral, affectant la façon dont elle est conditionnée dans le virus. Il joue également des rôles à l’intérieur des cellules hôtes liées à la réplication virale et aux réponses immunitaires de l’hôte.
Les chercheurs, travaillant avec Arnab Pain, ont découvert que deux mutations consécutives de la protéine N, appelées R203K et G204R, étaient associées à une sévérité accrue du COVID-19 chez les patients. Les analyses ont montré que les modifications apportées à la protéine l’ont fait se lier plus fortement à l’ARN viral.
D’autres tests dans des cellules de laboratoire ont suggéré que les modifications de la protéine N permettent au virus de détourner plus efficacement la machinerie de traduction de la cellule hôte pour faciliter la réplication du virus. Ils ont également été associés à une expression accrue des gènes impliqués dans la production d’interféron et de chimiokine. Cela pourrait être à l’origine de la tempête de cytokines potentiellement mortelle qui se produit chez certains patients COVID-19, ce qui rend leur respiration très difficile.
Les résultats sont le résultat d’analyses de séquences du génome viral de 892 échantillons de patients prélevés dans diverses régions d’Arabie saoudite entre mars et août 2020, relativement tôt dans la pandémie. Cela a été suivi de comparaisons avec les données des patients pour comprendre comment les mutations affectaient la charge virale et la virulence.
« Par rapport à la protéine de pointe, la protéine N est hautement conservée dans les différents coronavirus, comme le SRAS et le MERS ; pourtant, les tentatives de conception de vaccins contre elle n’ont pas abouti », explique Tobias Mourier, chercheur consultant travaillant dans l’équipe de Pain. « Comprendre la fonction de la protéine N pourrait aider à développer des médicaments qui la ciblent et potentiellement limiter la gravité de la maladie dans le COVID-19 et d’autres infections à coronavirus. »
L’équipe de recherche dirigée par KAUST, qui comprend des scientifiques et des cliniciens d’institutions et d’hôpitaux de toute l’Arabie saoudite, continue de surveiller le virus SRAS-CoV-2 à l’échelle nationale et d’observer comment les mutations affectent les interactions virus-hôte sous divers schémas de vaccination. « Le séquençage des génomes de virus et le signalement des modifications génomiques des régions du monde qui sont gravement sous-représentées dans les bases de données actuelles sont essentiels pour suivre et évaluer les nouvelles variantes préoccupantes », déclare Pain.
