Dans une étude récente publiée dans le Maladies infectieuses émergentes journal, les chercheurs ont évalué l’augmentation rapide du nombre de réinfections par la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) en décembre 2021.
La variation génétique entre différentes variantes du coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2) a soulevé des inquiétudes concernant les réinfections. Des études ont rapporté une réinfection par une variante du SRAS-CoV-2 après des antécédents d’infection en comparant les génomes viraux obtenus chez le même patient. Cependant, il est difficile de faire la distinction entre la réinfection et l’excrétion virale prolongée sans recourir au séquençage génomique.
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les chercheurs ont surveillé la réinfection suspectée par le SRAS-CoV-2 et les taux de réinfection suspectée dans le comté de Clark aux États-Unis entre mars 2020 et mars 2022 dans différentes données démographiques.
L’équipe a obtenu des résultats positifs de réaction en chaîne par polymérase (PCR) du SRAS-CoV-2 rapportés par les établissements médicaux, les prestataires de soins de santé et les laboratoires du district sanitaire du sud du Nevada (SNHD) pour les résidents du comté de Clark. Les résultats ont été enregistrés à l’aide d’un système électronique de surveillance des maladies. L’équipe a estimé les intervalles entre les dates de collecte des échantillons correspondant aux résultats positifs initiaux et ultérieurs au COVID-19 pour chaque participant. Un résultat positif ultérieur au SRAS-CoV-2 a été considéré comme une réinfection suspectée s’il a été diagnostiqué 90 jours ou plus après le prélèvement de l’échantillon positif initial.
Les chercheurs ont également évalué le nombre de nouveaux cas signalés par semaine qui ont été considérés comme des réinfections suspectes. Ceci a été réalisé en divisant le nombre total de réinfections suspectées par le nombre de nouveaux cas PCR-positifs cette semaine-là. En outre, les troisièmes infections suspectées ont été identifiées et ont été définies comme le troisième test PCR positif obtenu au moins 90 jours après le prélèvement de l’échantillon pour le deuxième test PCR positif qui répondait à la définition mentionnée ci-dessus de réinfection suspectée.
De plus, des données relatives aux caractéristiques démographiques des patients ont été recueillies à partir de rapports d’investigation de cas. L’équipe a estimé le taux de réinfection suspectée signalée pour 1000 cas de patients précédemment infectés par le COVID-19 selon le groupe d’âge, le sexe et l’origine ethnique.
Résultats
Les résultats de l’étude ont montré qu’entre mars 2020 et avril 2022, le SNHD a détecté 19 589 cas suspects de réinfection avec des réinfections commençant à partir de juin 2020. Le nombre de cas de réinfection était inférieur à 0,5 % des nouveaux cas de COVID-19 signalés jusqu’en février 2021. Cependant, l’équipe a noté qu’au cours de la dernière semaine de février 2021, le taux d’incidence de réinfection était de près de 2% de tous les cas enregistrés. Cette augmentation de proportion a été considérée comme le résultat de la prévalence de la variante alpha du SRAS-CoV-2 en janvier 2021.
Entre mars et novembre 2021, le taux de réinfection suspectée était compris entre 1 % et 2,7 % du total des cas signalés, même après l’émergence de la variante Delta en mai 2021. De plus, l’équipe a observé que le taux d’incidence est passé de 2 % entre 5 et le 11 décembre 2021 à 11 % entre le 19 et le 25 décembre 2021. Les primo-infections expliquent cette augmentation rapide lors de la prévalence du variant Omicron en décembre 2021. Alors que le taux d’incidence hebdomadaire des suspicions de réinfection a diminué après un pic observé en janvier 2021, le taux est resté élevé à près de 11 % en mars 2022.
L’équipe a noté que le taux de réinfection suspectée était de 49 pour 1000 personnes âgées de 18 à 24 ans et de 46 pour 1000 personnes âgées de 25 à 49 ans. Les femmes auraient le taux de réinfection suspecté le plus élevé avec 44 cas pour 1000 personnes, tandis que les hommes affichaient un taux de 33 pour 1000 personnes. Cela a mis en évidence que les femmes avaient 36% plus de chances de subir une réinfection suspectée que les hommes.
Entre mars 2021 et avril 2022, l’équipe a détecté 161 troisièmes réinfections suspectées. Parmi celles-ci, 13 sont survenues sporadiquement entre mars et décembre 2021. Entre le 19 décembre et le 25 décembre 2021, le taux est passé à 92 % du nombre total de troisièmes réinfections suspectées signalées après l’émergence du variant Omicron. Notamment, la proportion de troisièmes réinfections suspectées a chuté entre janvier et mars 2022, mettant en évidence l’association entre les infections primaires au COVID-19 et les réinfections suspectées.
Conclusion
Les résultats de l’étude ont montré que l’incidence des réinfections suspectées de COVID-19 était relativement rare dans le comté de Clark avant l’émergence de la variante SARS-CoV-2 Omicron. Par la suite, les réinfections suspectées ont représenté la plupart des cas de SRAS-CoV-2 signalés entre décembre 2021 et mars 2022. De plus, les troisièmes infections suspectées étaient rares mais ont été signalées de plus en plus après l’émergence d’Omicron, ce qui indique que la fréquence des infections multiples au COVID-19 pourrait augmentent avec l’émergence de diverses variantes virales.