Une étude portant sur deux grandes cohortes de patients européens a révélé que pour chaque augmentation de 10 % du nombre de bactéries productrices de butyrate dans l'intestin d'un patient, le risque d'hospitalisation pour toute infection diminue entre 14 et 25 % dans deux grandes cohortes nationales. L'étude sera présentée cette année au Congrès européen de microbiologie clinique et de maladies infectieuses (ECCMID 2024) à Barcelone, en Espagne (27-30 avril) et est réalisée par Robert Kullberg, du centre médical de l'université d'Amsterdam, aux Pays-Bas, et ses collègues.
Les altérations du microbiote sont fréquentes chez les patients hospitalisés pour des infections graves et des modèles précliniques ont montré que les bactéries intestinales anaérobies productrices de butyrate protègent contre les infections systémiques. Ces bactéries ont été étudiées car elles sont généralement épuisées chez les patients hospitalisés pour des infections graves. Deuxièmement, le butyrate peut avoir des effets protecteurs contre plusieurs maladies intestinales (autres que les infections).
Cependant, la relation entre les perturbations du microbiote et la susceptibilité accrue aux infections graves chez l’homme reste floue. Dans cette étude, les auteurs ont étudié la relation entre le microbiote intestinal de base et le risque d'hospitalisation future liée à une infection dans deux grandes cohortes de population – des Pays-Bas (dérivation ; HELIUS) et de Finlande (validation ; FINRISK 2002).
Le microbiote intestinal a été caractérisé par séquençage de l’ADN des bactéries afin d’identifier les différents types de bactéries présentes dans les échantillons fécaux des participants. Les auteurs ont mesuré la composition, la diversité et l’abondance relative du microbiote des bactéries productrices de butyrate. Le critère de jugement principal était l'hospitalisation ou la mortalité due à une maladie infectieuse au cours d'un suivi de 5 à 7 ans après le prélèvement d'échantillons fécaux, sur la base des données du registre national. Les auteurs ont ensuite examiné les associations entre le microbiote et le risque d’infection à l’aide d’une modélisation informatique. Une modélisation statistique plus poussée a été utilisée pour ajuster des variables telles que les données démographiques, le mode de vie, l'exposition aux antibiotiques et les comorbidités.
Les chercheurs ont dressé le profil du microbiote intestinal de 10 699 participants (4 248 des Pays-Bas et 6 451 de Finlande). Au total, 602 participants (Pays-Bas : n = 152 ; Finlande : n = 450) ont été hospitalisés ou sont décédés à cause d'infections (principalement une pneumonie communautaire). ) lors du suivi.
La composition du microbiote intestinal de ces participants hospitalisés/décédés différait de celle de ceux non hospitalisés pour infections. Plus précisément, chaque augmentation de 10 % de l’abondance de bactéries productrices de butyrate était associée à un risque réduit d’hospitalisation pour infections – 25 % inférieur pour les participants de la cohorte néerlandaise et 14 % inférieur pour la cohorte finlandaise. Tous les types d’infections ont été évalués ensemble, pas un en particulier. Ces associations sont restées inchangées après ajustement en fonction des données démographiques, du mode de vie, de l'exposition aux antibiotiques et des comorbidités.
Les auteurs déclarent : « La composition du microbiome intestinal, en particulier la colonisation par des bactéries productrices de butyrate, est associée à une protection contre l'hospitalisation pour maladies infectieuses dans la population générale dans deux cohortes européennes indépendantes. D'autres études devraient vérifier si la modulation du microbiome peut réduire le risque de infections graves. »
Les auteurs affirment que des analyses plus approfondies seront nécessaires avant que les traces chez les patients puissent commencer. L’un des défis est que les bactéries productrices de butyrate sont strictement anaérobies (ce qui signifie qu’elles respirent sans utiliser d’oxygène et ne peuvent pas tolérer l’oxygène), ce qui rend très difficile le transport de bactéries viables dans l’intestin. Plusieurs groupes de recherche travaillent à relever ces défis.