Dans l’industrie agroalimentaire, les bactéries mortelles Listeria monocytogenes est surveillé de près. Non seulement la bactérie peut rendre les gens extrêmement malades, mais elle est connue pour développer une résistance à diverses mesures de sécurité alimentaire à travers le monde.
Cependant, deux espèces « inoffensives » de Listeria développent également un nombre surprenant de caractéristiques potentiellement nocives pour l’homme.
Une étude de séquençage du génome entier en Afrique du Sud, menée par une équipe de chercheurs avec le premier auteur, le Dr Thendo Mafuna de l’Université de Johannesburg, montre certaines des caractéristiques changeantes de Listeria trouve dans le pays.
L’étude montre que Listeria innocua les souches développent une résistance à la température, au pH, à la déshydratation et à d’autres stress ; ainsi qu’une hypervirulence génétiquement identique à celle de Listeria monocytogenes.
Certaines souches de L. innocua et L. welshimeri dans l’étude montrent les trois gènes de résistance à un désinfectant largement utilisé, du groupe de composés chimiques d’ammonium quaternaire (QAC ou QUAT).
Deux souches de L. innocua ils ont analysé trois caractéristiques pathogènes préoccupantes ou plus, y compris des systèmes immunitaires adaptatifs de type CRISPR CAS.
Les deux souches non pathogènes de Listeria ont été échantillonnés dans des viandes crues, séchées et transformées dans des installations commerciales de transformation alimentaire du pays.
L’étude confirme d’autres recherches montrant une résistance croissante chez les Listeria espèces dans d’autres parties du monde.
Gènes partagés avec des espèces pathogènes
La Listeria innocua que nous avons testé possède certains des gènes que l’on trouve également dans les pathogènes Listeria monocytogenes.«
Dr Thendo Mafuna, premier auteur, Université de Johannesburg
Mafuna est du département de biochimie de l’Université de Johannesburg.
Ces gènes partagés entre L. innocua et L. monocytogenes sont également responsables de maladies chez l’homme; et la tolérance au stress comme la résistance au désinfectant chlorure de benzalkonium (BC ou BAC).
Des recherches menées par d’autres ont montré que bien que la listériose soit rarement causée par L. innocuacela arrive plus souvent chez les personnes dont le système immunitaire est affaibli, ajoute-t-il.
Le chlorure de benzalkonium (BAC) fait partie d’un groupe de produits chimiques appelés composés d’ammonium quaternaire, ou QUAT. Les quats se trouvent dans de nombreux produits désinfectants courants. Ils se sont avérés très efficaces pour tuer les bactéries, les champignons et les virus.
Tous les L. innocua les souches qu’ils ont testées avaient également la séquence complète du gène d’hypervirulence LIPI-4, qui peut provoquer des maladies chez l’homme, dit-il. La séquence LIPI-4 qu’ils ont trouvée dans L. innocua est identique à celle retrouvée chez les pathogènes L. monocytogenestel qu’enregistré par l’Institut Pasteur à Paris, France.
De viandes crues, séchées et transformées
Les échantillons et isolats analysés dans cette étude ont été collectés entre 2014 et 2019 par le Département de l’agriculture, de la réforme agraire et du développement rural (DALRRD) du gouvernement sud-africain. Ceux-ci ont été soumis au Conseil de la recherche agricole (ARC) d’Onderstepoort Veterinary Research SA pour analyse.
Au total, 258 isolats provenant de boucheries, d’abattoirs, de points de vente au détail, d’entrepôts frigorifiques et d’installations de transformation dans tout le pays ont été étudiés. Parmi ceux-ci, 38 se sont avérés non pathogènes L.Innocua; et trois autres isolats non pathogènes L. welshimeri.
Les isolats provenaient de viandes crues entières, crues transformées, séchées et transformées cuites, de bœuf, de poulet et de porc. Le Dr Itumeleng Matle de la Division de bactériologie, ARC à Onderstepoort a effectué l’analyse microbiologique de l’isolement et de l’identification de Listeria.
Le séquençage du génome entier (WGS) a été réalisé par le Dr Rian E. Pierneef à la plateforme de biotechnologie de l’ARC à Onderstepoort.
Mafuna a ensuite comparé les séquences du génome avec celles enregistrées par l’Institut Pasteur, à Paris, France ; et effectué l’analyse pour l’étude.
À l’affût
« Nous devons examiner nos propres installations en Afrique du Sud pour vraiment voir ce qui se passe. Nos analyses de ces bactéries peuvent nous aider à prédire les types de séquences à surveiller », déclare Mafuna.
C’est le nombre de caractéristiques nocives que L. innocua les souches partagent avec L. monocytogenes c’est préoccupant, ajoute-t-il.
Les transformateurs d’aliments doivent surveiller Listeria innocua car il devient résistant aux désinfectants qui sont utilisés dans l’industrie pour s’en débarrasser. Il serait également utile d’essayer différents types de désinfectants pour les surfaces, dit-il. Le passage d’un type à un autre peut empêcher ou retarder le développement de la résistance des bactéries à un type de désinfectant.
« Les grands transformateurs alimentaires industriels peuvent vouloir enquêter sur l’efficacité des désinfectants BC ou quat dans leurs installations. Cela peut être fait en prélevant des écouvillons avant le nettoyage et à nouveau après le nettoyage, en les cultivant, pour voir à quel point les régimes de désinfection fonctionnent », explique Mafuna. .
