Dans une étude récente publiée dans le Journal des infections, les chercheurs ont utilisé les données des tests de diagnostic en laboratoire sur les cas de monkeypox. Ils ont effectué une modélisation mathématique pour prédire combien de temps l’acide désoxyribonucléique (ADN) viral du monkeypox reste détectable dans différents échantillons de fluides corporels.
Sommaire
Arrière plan
Le virus monkeypox appartenant à la Orthopoxvirus genre, était, jusqu’à très récemment, endémique des pays d’Afrique occidentale et centrale. En août 2022, il y avait eu des épidémies de monkeypox dans 99 pays.
Le monkeypox se présente sous la forme de lésions muqueuses et cutanées, principalement dans les régions génitales, périanales et oropharyngées, avec une prévalence élevée chez les hommes ayant des rapports sexuels avec des hommes.
Les confirmations du monkeypox sont basées sur des tests positifs de réaction en chaîne par polymérase (PCR) qui détectent l’ADN viral du monkeypox dans l’échantillon de liquide. Alors que divers échantillons de fluides corporels ont été utilisés pour tester la variole du singe, il y a un manque d’informations sur la stabilité de l’ADN viral dans ces échantillons. Cette information pourrait grandement améliorer la précision des méthodes de diagnostic clinique du monkeypox.
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les chercheurs ont utilisé des résultats de tests de laboratoire archivés pour recueillir des données de détection moléculaire, qui ont ensuite été regroupées en fonction de l’âge et du sexe des patients, du statut du virus de l’immunodéficience humaine (VIH) et des manifestations cliniques du monkeypox.
Ils ont utilisé des modèles mathématiques tels que la régression paramétrique de Weibull, les modèles log-normal et gamma pour estimer la durée pendant laquelle l’ADN viral du monkeypox pouvait être détecté dans différents types de fluides corporels. Le temps jusqu’à la perte de détection de l’ADN a été estimé sur la base du nombre de jours entre l’apparition des symptômes et le premier test PCR négatif. Pour les échantillons avec des résultats ambigus, le temps entre le dernier résultat positif et le premier résultat négatif a été pris en compte.
L’étude comprenait 62 cas de monkeypox, dont 23 étaient des échantillons d’urine, 19 étaient des écouvillons des lésions, et les échantillons d’écouvillonnage nasopharyngé et rectal étaient chacun de 17. Les échantillons de sperme, de sang, de matières fécales et de salive étaient de 16, 15, 14 et 14, respectivement. L’échantillon comprenait 49 hommes et 13 femmes, dont 51 personnes séronégatives.
Les manifestations cliniques étaient des éruptions cutanées et des lésions cutanées, de la fièvre, des adénopathies, des myalgies, des maux de tête, des frissons et de la fatigue par ordre décroissant de fréquence rapportée.
Résultats
Les résultats de la modélisation mathématique ont indiqué que la persistance de l’ADN viral du monkeypox dans les fluides corporels variait de 5,7 à 13,5 jours. Le temps médian était le plus élevé pour les échantillons d’urine (13,5 jours), suivis des échantillons de sperme et de sang (11,4 et 10,5 jours, respectivement). L’ADN viral était le moins persistant dans les échantillons de lésions cutanées (durée médiane de 5,7 jours).
Les auteurs ont discuté de certaines des limites de l’étude. L’étude n’a pas testé l’infectivité des particules virales et n’a enquêté que sur la persistance de l’ADN dans les fluides. De plus, la date de prélèvement des échantillons pouvait différer de la date d’apparition des symptômes. Enfin, les auteurs pensent que le temps de persistance de l’ADN viral dans les fluides corporels estimé dans cette étude pourrait ne pas être généralisable à toutes les infections à monkeypox, en particulier celles asymptomatiques.
conclusion
Pour conclure, l’étude a examiné la stabilité de l’ADN viral du monkeypox dans divers types d’échantillons de fluides corporels provenant de patients atteints du monkeypox. Les chercheurs ont utilisé la modélisation mathématique pour estimer le temps jusqu’à la perte de détection de l’ADN. Ils ont découvert que l’ADN viral du monkeypox était le plus stable dans les échantillons d’urine, suivi des échantillons de sperme et de sang, et le moins stable dans les échantillons de lésions cutanées.
Les résultats de l’étude peuvent être utilisés pour faire des recommandations de tests cliniques pour un échantillonnage et une détection efficaces des cas de monkeypox. Des tests rapides et précis peuvent améliorer la mise en place de mesures préventives telles que l’isolement et la médication, ce qui limite la transmission ultérieure de la maladie.
