Une étude identifie plusieurs différences génomiques importantes dans les tumeurs malignes BCL en utilisant l’ascendance génomique

Le lymphome à cellules B et les leucémies (BCL) sont un ensemble diversifié de tumeurs malignes. Bien que le paysage génomique de nombreux sous-types de BCL ait été décrit, l’ascendance génomique a rarement été explorée.

Des chercheurs de Foundation Medicine, Inc. et du Rutgers Cancer Institute of New Jersey, le seul Comprehensive Cancer Center désigné par le National Cancer Institute, ont examiné l’ascendance génomique dans les sous-types de BCL en appliquant une méthodologie de prédiction d’ascendance génomique à des données de profilage génomique complètes et ont trouvé de multiples différences génomiques.

Les résultats de l’étude seront partagés lors de la réunion annuelle virtuelle de l’American Society of Hematology plus tard cette semaine en présentant l’auteur Andrew M. Evens, DO, MSc, FACP, directeur associé des services cliniques et directeur du programme de lymphome au Rutgers Cancer Institute, médecine directeur des services d’oncologie à RWJBarnabas Health et professeur de médecine à la Rutgers Robert Wood Johnson Medical School.

Lui et Shridar Ganesan, MD, PhD, chef de l’oncologie moléculaire, directeur associé de la recherche translationnelle et de la Chaire Omar Boraie en science génomique au Rutgers Cancer Institute et professeur de médecine et de pharmacologie à la Rutgers Robert Wood Johnson Medical School, partagent plus d’informations sur le travail :

Q: Pourquoi ce sujet est-il important à explorer?

R: Il existe de nombreuses disparités liées au cancer selon la race ou l’appartenance ethnique. Différentes populations raciales et ethniques connaissent une incidence accrue de cancers spécifiques ainsi que des résultats pires pour certains cancers.

Cependant, les causes génomiques des disparités sont mal comprises dans la plupart des cancers, y compris le manque de données sur le lymphome. L’ascendance génétique reflète l’histoire de la migration humaine, fournissant des informations de base sur les variations génétiques essentielles pour l’association génétique des maladies.

Q: Parlez-nous du travail et de ce que vous et vos collègues avez trouvé.

R: Nous avons analysé les altérations de l’ADN et de l’ARN dans 2 834 échantillons uniques de BCL de patients pour obtenir des informations sur les classes d’ascendance génomique. Les principales conclusions comprenaient: l’enrichissement de l’ascendance américaine (AMR) (reflétant la population hispanique et latino-américaine) chez les patients atteints de leucémie lymphoblastique aiguë à cellules B (LAL).

La leucémie chez ces patients étant enrichie en chromosome Philadelphie à haut risque comme la LAL, et ayant une plus grande fréquence de mutations dans IL7R, IGH, CRLF2, JAK2, et IKZF1 les gènes.

Le lymphome diffus à grandes cellules B (DLBCL) était principalement d’origine européenne, mais nous avons identifié de multiples différences d’ascendance génomique (p. CD79B les altérations ont été enrichies chez les patients d’ascendance sud-asiatique; CDKN2A était fréquemment modifié dans l’ascendance asiatique de l’Est; EZH2 les altérations ont été légèrement enrichies dans l’ascendance américaine; et CUX1, un suppresseur de tumeur impliqué dans la signalisation de PI3K, a été fortement enrichi en ascendance africaine pour les DLBCL et les lymphocytes B.

Q: Pourquoi ces résultats sont-ils significatifs?

R: Cette étude a identifié plusieurs différences génomiques importantes dans les tumeurs malignes BCL en utilisant l’ascendance génomique plutôt que des variables descriptives rapportées par les patients. Une analyse plus approfondie des marqueurs informatifs sur l’ascendance dans la BCL, y compris l’enrichissement des marqueurs d’ascendance dans des sous-types de cancer spécifiques et l’enrichissement associé à l’ascendance d’altérations génomiques spécifiques, peut conduire à de nouvelles connaissances sur les raisons pour lesquelles certains cancers peuvent survenir plus fréquemment dans certaines populations, et aider à identifier de meilleures stratégies pour la prévention, le diagnostic précoce et les traitements ciblés.