Des chercheurs du Karolinska Institutet et de l’hôpital universitaire de Karolinska ont développé une méthode de microscopie révolutionnaire qui permet une analyse tridimensionnelle détaillée (3D) de l’ARN à résolution cellulaire dans des cerveaux entiers de souris intacts. La nouvelle méthode, appelée TRISCO, a le potentiel de transformer notre compréhension du fonctionnement cérébral, à la fois dans des conditions normales et en cas de maladie, selon la nouvelle étude publiée dans Science.
Malgré les progrès considérables réalisés dans l’analyse de l’ARN, relier les données sur l’ARN à son contexte spatial constitue depuis longtemps un défi, en particulier dans les volumes de tissus 3D intacts. La méthode TRISCO permet désormais de réaliser une imagerie tridimensionnelle de l’ARN de cerveaux entiers de souris sans avoir besoin de découper le cerveau en fines sections, ce qui était auparavant nécessaire.
Cette méthode est un outil puissant qui peut faire avancer la recherche sur le cerveau. Avec TRISCO, nous pouvons étudier la structure anatomique complexe du cerveau d’une manière qui n’était pas possible auparavant. »
Per Uhlén, professeur au Département de biochimie médicale et de biophysique du Karolinska Institutet et dernier auteur de l'étude
Dans l’étude, jusqu’à trois molécules d’ARN différentes ont été analysées simultanément. La prochaine étape pour les chercheurs consiste à augmenter le nombre de molécules d’ARN pouvant être étudiées à une centaine, en utilisant une technique appelée analyse multiplex de l’ARN. Cela pourrait fournir des informations encore plus détaillées sur la fonction cérébrale et les états pathologiques.
L’approche TRISCO ouvre de nouvelles possibilités pour comprendre en profondeur la complexité du cerveau, ce qui peut conduire au développement de nouveaux traitements pour diverses maladies cérébrales.
« Nous sommes impatients de poursuivre nos recherches et d'explorer les nombreuses possibilités offertes par cette nouvelle technique », déclare Shigeaki Kanatani, chercheur spécialisé au laboratoire d'Uhlén et premier auteur de l'étude.
Non seulement TRISCO convient à l’étude des cerveaux intacts de souris, mais l’étude démontre qu’il peut être utilisé pour des cerveaux plus gros, comme ceux de cobayes, et pour divers tissus comme les reins, le cœur et les poumons. L'étude est une collaboration entre le Karolinska Institutet et l'hôpital universitaire de Karolinska.
« Notre laboratoire entretient plusieurs collaborations avec des chercheurs cliniquement actifs de l'hôpital universitaire Karolinska. Il est crucial pour la recherche biomédicale que les chercheurs fondamentalistes et les cliniciens collaborent et se comprennent », explique Per Uhlén.
L'étude a été financée par le Conseil suédois de la recherche, la Fondation suédoise du cerveau et la Société suédoise du cancer. Certains des co-auteurs sont salariés et possèdent des actions dans la société danoise Gubra.
