Dans une récente étude publiée sur medRxiv* serveur de prétirage, les chercheurs ont développé un modèle pour reconstituer les estimations du nombre de voyageurs qui auraient été testés positifs au coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2) dans le pays de départ. Ils ont utilisé les données de la Polynésie française, où ils ont maintenu le dépistage du SARS-CoV-2 aux arrivées à l’aéroport de manière systématique.
Sommaire
Arrière plan
Les voyageurs arrivant à l’aéroport ont été contrôlés et testés pour la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) dans plusieurs pays. Les individus positifs au COVID-19 ont ensuite été isolés pour contrôler la propagation de la maladie. Bien que certains pays aient signalé le nombre de personnes infectées détectées à l’arrivée au fil du temps, ces données se limitaient principalement à des programmes de dépistage à petite échelle qui duraient à court terme. Ainsi, il y a un manque de données de test SARS-CoV-2 à long terme systématiquement rapportées des voyageurs arrivant à un aéroport à l’échelle mondiale.
Malgré l’incohérence dans la communication des données de test COVID-19 dans les aéroports, cela offre une opportunité unique pour la surveillance du SRAS-CoV-2 dans plusieurs pays. Cependant, le défi est que les infections détectées parmi les voyageurs à l’arrivée ne reflètent qu’un sous-ensemble de toutes les personnes infectées par le SRAS-CoV-2.
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les chercheurs ont utilisé les données de plus de 220 000 tests COVID-19 effectués sur des voyageurs arrivant en Polynésie française entre juillet 2020 et mars 2022 pour estimer la prévalence du SRAS-CoV-2 aux départs des aéroports de plusieurs pays.
La Polynésie française a été témoin de trois vagues pandémiques de COVID-19 causées par les variantes de type sauvage, Delta et Omicron du SRAS-CoV-2. Parmi les voyageurs arrivant, 15% des valeurs mesurées du seuil de cycle (CT) étaient inférieures à 20, avec une distribution plus faible dans l’auto-test des travailleurs de la santé. La plupart des voyageurs entrant en Polynésie française avaient soit les États-Unis, soit la France métropolitaine comme point de départ de leur voyage.
Lors de la première phase de surveillance, les voyageurs ont adhéré au protocole d’autotest COV-CHECK effectué quatre jours après leur arrivée. De plus, les voyageurs ont effectué un test de transcription inverse-amplification en chaîne par polymérase (RT-PCR) dans les 72 heures suivant le départ. Plus tard en février 2021, la quarantaine a également été rendue obligatoire dans ce protocole.
Les chercheurs ont également évalué si le dépistage à l’arrivée pouvait estimer de manière fiable la dynamique internationale du SRAS-CoV-2. À cette fin, ils ont converti la prévalence du SRAS-CoV-2 au départ, reflétant la positivité actuelle en une estimation des nouvelles infections quotidiennes. En outre, ils ont comparé l’incidence cumulée du SRAS-CoV-2 au cours de cette période à des enquêtes sérologiques répétées en France et aux États-Unis.
Résultats de l’étude
Il y avait 1341 tests d’arrivée positifs dans l’ensemble de données de l’étude, avec des différences considérables dans la prévalence hebdomadaire tout au long de la pandémie. Les chercheurs ont noté que la croissance et le déclin épidémiques influençaient la détection des cas de COVID-19. Par exemple, ils ont estimé le taux de détection des personnes infectées par le SRAS-CoV-2 à 60 % via un test RT-PCR à l’arrivée au jour 4 de leur arrivée, dans les dix premiers jours de leur infection, alors que l’épidémie dans le lieu de départ se développait. à 10% par jour. Ce taux serait descendu à 40% lors d’une épidémie qui reculait de 10% quotidiennement.
Curieusement, la prévalence mesurée du SRAS-CoV-2 à l’arrivée chez les voyageurs en provenance des États-Unis ou de France anticipait la dynamique réelle du COVID-19 dans les deux pays. En effet, les tests des voyageurs ont servi d’indicateur avancé et ont montré que des pics de prévalence du SRAS-CoV-2 se sont produits peu de temps avant les pics de cas signalés. Cela a également représenté des retards dans l’apparition des symptômes de la COVID-19, les tests et la notification du ou des cas dans le pays d’origine.
En ajustant les protocoles de test des voyageurs, le modèle d’étude a estimé un pic de prévalence de l’infection au départ en France et aux États-Unis fin 2020/début 2021 à 2,8 % et 1,1 %, respectivement. La vague Omicron BA.1 a causé une prévalence de SRAS-CoV-2 de 5,4 % et 5,5 % en France et aux États-Unis début 2022, respectivement. En France, l’estimation de l’incidence cumulée du COVID-19 à la fin de 2020 était légèrement supérieure à ce que montraient les études sérologiques. Il y a plusieurs explications aux écarts observés. Premièrement, les voyageurs en provenance de France ont diminué pendant cette période, ce qui peut avoir affecté la représentativité des voyageurs.
Alors que les personnes averses au risque étaient moins susceptibles de voyager, les preneurs de risques doivent avoir plus probablement contracté le COVID-19 en transit. Ensuite, il est possible que certains voyageurs aient contracté une infection par le SRAS-CoV-2 après leur arrivée. En Polynésie française, ils ont effectué des tests de dépistage du SRAS-CoV-2 chez les voyageurs arrivant quatre jours après leur arrivée. En revanche, les estimations de l’étude pour les États-Unis ont correspondu à des augmentations de la séroprévalence pendant la pandémie de COVID-19 de fin 2020 et 2021.
conclusion
L’analyse de l’étude a mis en évidence l’utilité des tests de routine des voyageurs dans les aéroports. Les résultats de l’étude ont fourni une preuve de concept pour la gestion continue du COVID-19 et la planification future de la pandémie. Il a souligné l’importance de collecter systématiquement des données de test avec un lien minimal pour permettre une estimation en temps réel de la dynamique sous-jacente de la pandémie de COVID-19 dans plusieurs pays. Ces informations resteraient les mêmes à l’échelle internationale ou dans les principaux centres de voyage mondiaux. De plus, ces efforts permettraient la synthèse de l’estimation de la prévalence du SRAS-CoV-2 dans les ensembles de données, réduisant l’incertitude et élargissant considérablement le réseau de pays couverts.
*Avis important
medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.
