Il n'existe actuellement aucun vaccin autorisé pour COVID-19. Bien que plusieurs médicaments antiviraux aient été testés, aucun ne s'est révélé totalement efficace contre la maladie.
Dans une étude qui vient d'être publiée dans la revue MDPI Vaccins, des chercheurs de l'Université Bar-Ilan ont identifié un ensemble d'épitopes immunodominants potentiels du protéome SARS-CoV-2
Ces épitopes sont capables de générer à la fois des réponses immunitaires à médiation par les anticorps et les cellules. Les résultats de ces travaux pourraient ainsi contribuer au développement d'un vaccin peptidique contre les infections par le SRAS-CoV-2 qui pourrait arrêter l'épidémie de COVID-19 et les futures pandémies causées par les coronavirus.
Sous la direction du Dr Milana Frenkel-Morgenstern, chef du laboratoire de génomique du cancer et de bio-informatique des maladies complexes à la faculté de médecine Azrieli de l'Université Bar-Ilan, les chercheurs ont adopté une approche informatique basée sur l'immunoinformatique pour exploiter la teneur en protéines du SRAS-CoV-2 et par la suite identifié des épitopes immunodominants du virus.
Les réponses immunitaires qui sont basées sur des épitopes immunodominants spécifiques impliquent la génération d'une immunité à médiation à la fois par anticorps et par cellule contre les agents pathogènes présentant de tels épitopes. Une telle immunité peut faciliter l'élimination rapide et efficace du pathogène.
L'équipe de chercheurs qui comprend également Sumit Mukherjee, Dmitry Tworowski, Rajesh Detroja et Sunanda Biswas Mukherjee, a identifié 15 régions immunogènes potentielles à partir de trois protéines de SARS-CoV-2 et cartographié 25 épitopes immunodominants sur d'autres protéines SARS-CoV-2.
Pour confirmer que ces épitopes pourraient servir à fournir une immunité à une population mondiale, le pourcentage d'individus qui expriment un complexe majeur d'histocompatibilité (CMH) capable de reconnaître l'un de ces épitopes a été déterminé.
En conséquence, sept épitopes ont été jugés présents dans plus de 87% de la population mondiale affectée par le virus.
D'autres analyses structurales d'amarrage moléculaire ont estimé l'interaction de liaison de ces épitopes potentiels avec le CMH humain.
Des listes complètes de protéines du CMH qui reconnaissent chaque épitope ont été générées et sont présentées à la fois dans le manuscrit soumis et dans une demande de brevet américain provisoire (US 63 / 034.416).
Les sept épitopes ont été testés à l'aide de plusieurs outils pour vérifier leur nature non allergène et non toxique, ainsi que pour démontrer qu'ils comportent un faible risque de déclencher des réponses auto-immunes.
Ensemble, ces résultats indiquent que ces sept épitopes représentent des candidats vaccins potentiellement efficaces.
En effet, le développement de vaccins utilisant ces épitopes immunodominants pourrait activer à la fois les réponses immunitaires humorales et cellulaires chez l'homme comprenant une fraction majeure de la population mondiale.
La source:
Référence de la revue:
Mukherjee, S., et al. (2020) Immunoinformatics and Structural Analysis for Identification of Immunodominant Epitopes in SARS-CoV-2 as Potential Vaccine Targets. Vaccins. doi.org/10.3390/vaccines8020290.
