Une nouvelle étude publiée sur le serveur de préimpression medRxiv * en mai 2020 montre que chez les patients testés positifs pour le coronavirus du syndrome respiratoire aigu sévère 2 (SRAS-CoV-2) dans les échantillons pharyngés et fécaux, le virus persiste plus longtemps dans les échantillons fécaux que dans les échantillons pharyngiens. Cependant, la transmission fécale-orale ne semble pas se produire.
Sommaire
Comment COVID-19 se propage-t-il?
La pandémie actuelle causée par le virus du SRAS-CoV-2 a commencé dans la ville chinoise de Wuhan au cours du dernier mois de 2019, mais s'est propagée rapidement, d'abord dans la ville, puis dans le pays, et enfin dans le reste du monde, en quatre mois. mois. Il a touché près de 187 pays et territoires, avec plus de 4 millions de cas signalés et plus de 282 000 morts.
Cette maladie respiratoire se propage facilement entre les personnes, principalement par contact direct et gouttelettes des voies respiratoires. Cependant, il a également été trouvé dans des échantillons fécaux.
Nouveau coronavirus SARS-CoV-2 Micrographie électronique à balayage colorisée d'une cellule VERO E6 (violet) présentant des projections cellulaires allongées et des signes d'apoptose, après infection par des particules de virus SARS-COV-2 (rose), qui ont été isolées à partir d'un échantillon de patient. Image capturée au NIAID Integrated Research Facility (IRF) à Fort Detrick, Maryland. Crédits: NIAID
Comment l'étude s'est-elle déroulée?
La présente étude vise à découvrir combien de temps les échantillons fécaux restent positifs pour le virus et si le virus peut se propager à travers les matières fécales. Ceci est d'une grande importance pour la santé publique car il pourrait modifier la durée de la quarantaine, la prévention de la propagation et la durée de la période de traitement.
La présente étude s'est concentrée sur les détails cliniques de dix-sept patients COVID-19 dans une conception rétrospective monocentrique couvrant la période du 22 janvier au 7 février 2020. Les critères nationaux alors en place pour le diagnostic de COVID-19 ont été utilisés pour confirmer la cas. Tous les patients ont été testés positifs pour l'acide nucléique viral par PCR quantitative en temps réel (qRT-PCR) sur des échantillons de tampons pharyngés.
Le patient a été jugé négatif (sans SARS-CoV-2) lorsque trois écouvillonnages pharyngés successifs étaient négatifs sur qRT-PCR à des intervalles d'au moins 24 heures chacun. Un écouvillon fécal négatif a été défini comme deux échantillons fécaux successifs négatifs par le même test à 24 heures d'intervalle ou plus.
Les dossiers cliniques, de laboratoire et d'imagerie thoracique (TDM) ont été examinés pour tous les patients. Deux des patients présentaient des symptômes graves, mais aucun patient n'est décédé.
Quelles ont été les conclusions?
Les chercheurs ont découvert que tous les patients avaient été exposés à des cas connus ou s'étaient rendus dans des zones à haut risque. Deux d'entre eux souffraient d'hypertension. La période d'incubation moyenne était de 5,5 jours.
La fièvre était présente chez tous les patients, suivie d'une toux sèche chez 7 patients, les autres symptômes, y compris les expectorations, les maux de tête et les douleurs musculaires, étaient rares.
Tous les patients ont reçu des médicaments antiviraux et cinq ont eu besoin d'un soutien en oxygène par cathéter nasal. Quatorze d'entre eux ont reçu des antibiotiques et 4 d'entre eux étaient sous hormones.
Les échantillons fécaux se sont révélés positifs pour le virus chez 11 patients, soit 65%, restant positifs pendant 17 jours en moyenne (durée la plus longue 40 jours). Cela a été nettement plus long que pour les échantillons de tampons pharyngés chez 16 des 17 patients.
Les caractéristiques cliniques de tous les patients de l'étude étaient similaires, que le virus ait été éliminé par les selles ou non. Les manifestations gastro-intestinales comme la diarrhée, les nausées ou les vomissements étaient rares. Le portage fécal n'était pas significativement corrélé à de tels symptômes. Cependant, il convient de noter que des études ultérieures ont montré que certains patients présentent des caractéristiques liées à l'intestin comme plainte principale.
Le virus est un coronavirus à ARN simple brin enveloppé, se liant à l'enzyme de conversion de l'angiotensine 2 (ACE2), qui se trouve en évidence dans les cellules épithéliales alvéolaires de type II dans le poumon, dans l'épithélium œsophagien et dans l'épithélium intestinal. Le virus a également été cultivé à partir de ces échantillons.
Cela a soulevé la question de savoir si l'infection pouvait être transmise par voie fécale-orale.
Constatations et limites
Les patients ont été étudiés pour les paramètres épidémiologiques. Six d'entre eux appartenaient à deux familles, dont trois de l'une et deux de l'autre étaient positives, tandis que la sixième était négative.
Tous vivaient dans des maisons différentes et avaient une bonne hygiène personnelle avant de tomber malades. Cela excluait la voie fécale-orale et indiquait plutôt une transmission par gouttelettes ou par contact direct.
Après le congé, aucun membre de la famille vivant dans les mêmes ménages n'a été infecté, comme l'a confirmé le suivi. Cependant, la taille de l'échantillon est petite et la période de suivi courte, de sorte qu'aucune conclusion ferme ne peut être tirée.
D'autres facteurs de confusion potentiels pourraient être le risque de tests PCR faussement négatifs des deux types d'échantillons; le manque d'échantillonnage fécal quotidien qui peut avoir introduit une erreur dans la durée observée de passage du virus dans les fèces chez certains patients; et l'absence de données sur les tests viraux du liquide de lavage alvéolaire.
Il n'y avait que deux patients atteints d'une maladie grave dans cet échantillon, ce qui rend impossible de corréler le passage viral fécal avec la gravité de la maladie.
Transmission féco-orale peu probable
Les chercheurs affirment qu'ils n'ont identifié aucune preuve de transmission fécale-orale de COVID-19. Cependant, disent-ils, comme les échantillons fécaux restent positifs pour le virus pendant une durée beaucoup plus longue que les échantillons des voies respiratoires supérieures, la désinfection et l'isolement doivent être effectués méticuleusement tout au long de la période de récupération de ces patients pour éviter la contamination de l'environnement.
*Avis important
medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, orienter la pratique clinique / les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.
