L’Initiative CERVEAU® Cell Atlas Network (BICAN) a lancé sa première publication majeure de données, marquant une étape importante dans l'effort ambitieux visant à cartographier l'ensemble du cerveau humain.
Les données, accessibles via l'inventaire à libération rapide BICAN, comprennent des profils transcriptomiques et épigénomiques unicellulaires et mononucléaires provenant d'humains, de souris et de 10 autres espèces de mammifères. Provenant de plusieurs subventions et laboratoires du consortium, notamment de l'Allen Institute, ces données proviennent de projets visant à identifier et à définir des types de cellules cérébrales sur la base de profils moléculaires.
Le robinet est ouvert, les données circulent et d’autres sont en route. L’espoir est que si nous pouvons encourager la réutilisation et le partage des données par plusieurs laboratoires, nous pourrons maximiser la valeur de ces ensembles de données et réellement amplifier l’investissement public dans la recherche. »
Carol Thompson, Ph.D., directrice associée de la gestion des données, Allen Institute
Cet effort est financé par le National Institutes of Health Recherche sur le cerveau grâce à l'avancement des neurotechnologies innovantes® Initiative, ou The BRAIN Initiative®. BICAN réunit des neuroscientifiques, des biologistes computationnels et des ingénieurs logiciels pour créer un atlas complet du cerveau humain. Cet effort s'appuie sur des projets antérieurs financés par la NIH BRAIN Initiative à l'Allen Institute et ailleurs, qui ont cartographié les cellules de l'ensemble du cerveau de souris et de certaines parties du cerveau humain en étudiant les gènes actifs dans des cellules individuelles.
« Cette version représente une étape majeure vers cette prochaine frontière des neurosciences, où nous commencerons enfin à comprendre ce qui distingue le cerveau humain », a déclaré Fenna Krienen, Ph.D., professeur adjoint au Princeton Neuroscience Institute dont le laboratoire a contribué données à la version d'aujourd'hui.
« En réunissant des experts de multiples spécialités, le projet BICAN est un modèle de science ouverte », a déclaré John Ngai, Ph.D., directeur de la NIH BRAIN Initiative. « La disponibilité de ce trésor de données en croissance rapide permettra aux chercheurs du monde entier de propulser le domaine vers une compréhension plus profonde du cerveau humain, tant dans la santé que dans la maladie, ouvrant finalement la voie à des traitements et des remèdes plus précis pour des troubles cérébraux dévastateurs. «
La publication de données ouvertes est conçue pour accélérer les découvertes en neurosciences en fournissant un accès sans précédent aux données brutes des cellules cérébrales de toutes les espèces et de tous les stades de développement. Traditionnellement, il peut s'écouler des années entre la génération de données par un scientifique et la publication de ces informations dans un article.
Cette initiative marque une rupture avec cette approche conventionnelle, en donnant la priorité au partage précoce des données pour favoriser la collaboration et accélérer la recherche. « J'espère que ce modèle deviendra la norme, dans lequel nous divulguons les données avant qu'elles ne soient publiées et travaillons ensemble pour créer des ressources pour l'ensemble de la communauté », a déclaré Krienen.
Les chercheurs peuvent désormais utiliser cet ensemble de données ouvert pour cartographier et définir les types de cellules cérébrales, offrant ainsi de nouvelles informations sur la diversité et la fonction des cellules cérébrales. « Les neurosciences sont un domaine difficile », a déclaré Thompson. « Plus nous pouvons faire pour garantir que les données que nous générons alimentent davantage d'études et aident la communauté, mieux nous nous porterons. »
