Complete Genomics Inc., un leader mondial des outils pour les sciences de la vie et une filiale de MGI Tech Co., Ltd. (« MGI »), a lancé aujourd’hui de nouveaux produits et prix révolutionnaires lors de l’Assemblée générale des progrès de la biologie et de la technologie du génome (AGBT).
Complete Genomics propose des séquenceurs génétiques des séries T, G et E couvrant une large gamme d’applications de séquençage à débit faible, moyen, élevé et ultra élevé. « Nous nous sommes donné pour mission de répondre au besoin mondial d’un séquençage plus rapide, rentable et précis, que ce soit pour identifier et tracer les agents pathogènes dans le monde post-pandémique d’aujourd’hui ou pour tenir la promesse de la médecine de précision. a déclaré Rade Drmanac, PhD, directeur scientifique.
Crédit d’image : Génomique complète
DNBSEQ-T20 × 2, brise les frontières et lit la séquence du génome humain entier pour moins de 100 $
DNBSEQ-T20×2 représente une évolution de produit de la série T conçue pour les projets de génome de grande population. À l’aide d’une grande lame de séquençage de type ouvert découpée dans une plaquette de silicium entière, un DNBSEQ-T20 × 2 prend en charge le fonctionnement de 6 lames simultanément, produisant jusqu’à 42 To par cycle avec PE100 ou même 72 To par cycle avec PE150 dans un encombrement inférieur à DNBSEQ -T10×4*.
Activé par une biochimie innovante par immersion, DNBSEQ-T20×2 perfectionne le processus impensable de trempage robotisé consécutif de plusieurs lames dans le même réactif. La fluidique d’immersion sur des lames de silicium sans couvercle permet une réaction très uniforme sur toute la surface de ces grandes lames assurant une qualité de séquençage élevée, un débit plus élevé et un coût le plus bas. Un seul ensemble de DNBSEQ-T20 × 2 peut produire jusqu’à 50 000 WGS par an pour moins de 100 $ par génome humain 30x, y compris la dépréciation de l’instrument.
En particulier, DNBSEQ-T20×2 est équipé de 2 imageurs et d’un bras robotique rotatif manipulant 6 lames délivrant 72 To/analyse à WGS, WGBS, WES, RNA-seq, single cell, STOmics (un outil Spatial Omics à grande échelle avec une résolution à l’échelle nanométrique ), et d’autres applications de séquençage, y compris le regroupement et le séquençage simultané de différentes bibliothèques. « La commercialisation de DNBSEQ-T20x2 deviendra une force importante motrice du développement et de l’expansion de l’industrie génétique mondiale et accélérera les progrès de la compréhension du génome humain et des applications médicales. » dit le Dr Drmanac. « Maintenant, beaucoup plus d’échantillons peuvent être séquencés ou un séquençage plus approfondi, plus informatif et précis peut être offert par échantillon ».
Étant donné que le faible coût des consommables est obtenu en exécutant simultanément 6 lames à ou près de sa capacité de fonctionnement, DNBSEQ-T20×2 doit être commandé avec une certaine quantité minimale annuelle de consommables. DNBSEQ-T20×2 sera disponible dans le commerce aux États-Unis au troisième trimestre 2023 et en Chine au deuxième trimestre 2023.
Au cours de la conférence, Complete Genomics a également annoncé un nouveau prix promotionnel de réactif aux États-Unis de 1,5 $/Gb pour son séquenceur phare DNBSEQ-T7 qui est déjà sur le marché. Le nouveau prix du réactif DNBSEQ-T7 permet un accès immédiat à un génome de 150 $ avec une qualité DNBSEQ élevée, même lorsque seulement une douzaine d’échantillons sont séquencés par cycle. De plus, les projets de séquençage à grande échelle et abordables comme STOmics peuvent démarrer immédiatement en utilisant plusieurs séquenceurs DNBSEQ-T7 par laboratoire. Un ensemble de trois séquenceurs DNBSEQ-T7 fournit près de 50 000 hWGS 30x par an.
DNBSEQ-G99, libère votre vitesse de séquençage ultime à chaque exécution (PE150) < 12 heures
DNBSEQ-G99, en tant que dernier modèle de la série G, est un séquenceur de gènes ultra-rapide offrant un débit moyen à bas, ce qui en fait une option supérieure pour le séquençage de gènes ciblé et le séquençage de petits génomes. DNBSEQ-G99 adopte pour la première fois des points de signal matriciels triangulaires sur la Flow Cell de séquençage, atteignant une densité plus élevée de sortie de données, avec un débit global de 8 à 48 Gb par cycle. De plus, équipé d’un équipement optique haute performance exclusif et d’un système de contrôle de température de haute précision, le délai d’exécution des données de séquençage PE150 a été réduit à moins de 12 heures. Des rapports de lecture plus courts utiles sont disponibles même dans les 2,5 premières heures pendant les cycles de séquençage PE100 ou PE150.
DNBSEQ-G99 a joué un rôle déterminant dans la découverte du premier cas importé de Monkeypox à Chongqing, en Chine. La souche virale a été rapidement identifiée grâce à la séquence complète du génome complétée par DNBSEQ-G99. Trois statistiques différentes de séquençage du métagénome de longueur de lecture des lectures spécifiques au virus Monkeypox représentaient environ 0,35 % en moyenne dans les tests qPCR pour un échantillon avec une valeur Ct d’environ 21. Les résultats ont montré que la profondeur moyenne du génome du virus Monkeypox était d’environ 35 X à la longueur de lecture de SE40, 110X à SE100 et 200X à PE100, avec une couverture de plus de 99,03 % au-dessus de 100X. Pendant ce temps, le mode de sortie de données multipoint de DNBSEQ-G99 (bioanalyse par séquençage, BBS) a raccourci le délai de livraison à moins de 2,5 heures sans limiter la longueur de lecture du séquençage final, ce qui en fait le meilleur choix pour les scénarios de test urgents et multiples dans un environnement de santé publique. système. Le mode bioinformatique par séquençage (BBS) a été utilisé dans le traçage du virus Monkeypox, ce qui a permis d’obtenir le premier lot de résultats de lectures brutes en seulement 9 heures.
Alors que nous passons d’une approche unique à une approche de médecine de précision ciblant les bons traitements pour les bons patients au bon moment, la vitesse requise pour identifier la constitution génétique de chaque patient est devenue critique. DNBSEQ-G99 répond à ce besoin critique avec sa production de données rapide et de haute qualité, et améliore les délais d’exécution pour les biomarqueurs cliniquement pertinents. DNBSEQ-G99 est particulièrement adapté à l’oncologie de précision, à la détection de tumeurs dans les applications hospitalières et aux recherches décentralisées, et il ouvre une nouvelle opportunité aux laboratoires de s’adapter à ces changements et d’ajouter de la valeur à leurs offres.
À l’heure actuelle, DNBSEQ-G99 prend en charge les longueurs de lecture de séquençage, notamment PE50, SE100 et PE150, tandis que des kits de réactifs avec des longueurs de lecture plus longues telles que SE400 et PE300 seront disponibles à l’avenir. DNBSEQ-G99 devrait entrer sur le marché américain au deuxième trimestre 2023.
Crédit d’image : Génomique complète
Kit de préparation de bibliothèque stLFR, un processus à tube unique pour un co-codage à barres unique dans les longs fragments d’ADN
Complete Genomics offre plusieurs options de longueurs de lecture. stLFR (lectures de fragments longs à tube unique) est basé sur une technologie brevetée de co-codage à barres d’ADN pour fournir des lectures longues synthétiques ou liées sur les plates-formes DNBSEQ. Ce kit immédiatement disponible surmonte les limites des longueurs de lecture courtes et permet l’appel de variantes structurelles petites et grandes de haute qualité, la mise en phase d’haplotype de plus de 99 % du génome humain, l’assemblage de novo et d’autres applications de fragments longs. Les kits stLFR combinés au WGS sans PCR permettent d’obtenir des génomes en phase d’haplotype plus complets et plus précis à un prix abordable, ce qui conduit à une nouvelle norme WGS pour la recherche et les applications cliniques.
Complete Genomics, une société innovante de systèmes de séquençage, propose désormais six séquenceurs aux laboratoires de séquençage américains, dont le séquenceur portable DNBSEQ-E25*, le séquenceur à haut débit DNBSEQ-T10x4 et le séquenceur de paillasse à débit moyen DNBSEQ-G400*. Complete Genomics fournit également des solutions d’automatisation de la préparation d’échantillons et de bibliothèques et des solutions bioinformatiques en aval.
