Imaginez un pays avec un milliard d’habitants, où chaque individu a des intérêts et des objectifs différents. Vous ne connaîtrez jamais leurs intérêts et leurs objectifs tant que vous ne leur poserez pas la question, mais interroger un milliard de personnes n’est pas une tâche facile.
C’est le même scénario complexe auquel les scientifiques sont confrontés lorsqu’ils étudient les bactéries. Il y en a environ un milliard dans une colonie de la taille d’une pointe de crayon, mais quand on regarde l’ensemble de la colonie de bactéries, elles se ressemblent toutes et on suppose qu’elles seront toutes victimes du même antibiotique. Non, malheureusement.
Les fauteurs de troubles
Tout comme les humains, chaque bactérie présente dans une plaie a son propre objectif. Certains prospéreront et se multiplieront, d'autres migreront vers d'autres parties du corps du patient, certains succomberont au traitement antibiotique et quelques-uns resteront discrets et passeront inaperçus.
Ces derniers sont les fauteurs de troubles, car ils sont tous deux capables de survivre aux antibiotiques et ne sont pas détectés par les tests diagnostiques de résistance aux antibiotiques.
Trouver ces fauteurs de troubles parmi des centaines de milliards de bactéries, c’est comme chercher une aiguille dans une botte de foin. Ils sont très difficiles à trouver, mais ils peuvent rendre le traitement médical inutile.
« Nous savons que ces fauteurs de troubles, les aiguilles dans la botte de foin, existent parce que de temps en temps quelqu'un saute dans la botte de foin et en est blessé. Nous savons également que dans certaines infections bactériennes chroniques, la botte de foin contient plus d'une aiguille », dit le chercheur principal d'une étude récente sur le problème, le professeur agrégé Christian Lentz.
Trouver les méchants bugs grâce à la fluorescence
Récemment, des chercheurs de l’UiT, l’Université arctique de Norvège, et du CANS – Centre pour les nouvelles stratégies antibactériennes – ont découvert une nouvelle façon intelligente d’examiner une bactérie unique et de trouver parmi elles celles qui sont résistantes aux antibactériens, ou les fauteurs de troubles.
Les chercheurs peuvent désormais même prédire comment ces méchants se comporteront et à quel point ils deviendront dangereux.
En combinant des étiquettes fluorescentes avec l'antibiotique Vancomycine utilisé contre la bactérie Staphylococcus aureus, les chercheurs ont pu identifier des bactéries uniques qui ressemblent aux autres mais qui peuvent potentiellement causer des dommages supplémentaires aux patients souffrant d'infections à Staphylococcus aureus.
Nous essayons de peindre « les aiguilles » avec une couleur vert fluo facilement repérable. Pour cela, nous utilisons des « peintures » moléculaires spéciales, par exemple des antibiotiques couplés à des colorants fluorescents ou à d'autres sondes qui nous renseignent sur la composition moléculaire en forme d'aiguille des cellules bactériennes. La combinaison de peindre les cellules de différentes couleurs et de corréler la couleur des cellules avec leur capacité à survivre aux antibiotiques nous permet de prédire si les cellules bactériennes individuelles sont plus ou moins susceptibles d'être tuées par les antibiotiques.
Christian Lentz, professeur agrégé, UiT, Université arctique de Norvège
Plus facile de choisir le bon antibiotique
Être capable de savoir quels types de fauteurs de troubles résistants aux antibiotiques se cachent dans une colonie bactérienne peut s'avérer essentiel à l'avenir pour prédire le succès ou l'échec d'un certain traitement antibiotique. Il sera ainsi plus facile de choisir un antibiotique plus approprié en premier lieu.
Espérons que cela nous permettra d’éviter un échec inexpliqué du traitement antibiotique lorsque les antibiotiques qui devraient fonctionner, selon les diagnostics effectués en laboratoire, ne parviennent pas à le faire chez le patient.