L’agent causal de la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19), le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2), a été identifié pour la première fois à Wuhan, en Chine, en décembre 2019. Le virus s’est depuis propagé rapidement à travers le monde, avec l’Organisation mondiale de la santé (OMS) a déclaré que le COVID-19 était une pandémie mondiale en mars 2020. À ce jour, le SRAS-CoV-2 a infecté plus de 127,3 millions de vies et plus de 2,8 millions de décès.
Diverses options thérapeutiques sont recherchées et les vaccins sont développés à un rythme sans précédent. Cependant, la longévité de ces interventions s’est inquiétée, étant donné la nature à mutation rapide du virus et de nombreuses variantes du SRAS-CoV-2 préoccupantes (y compris B.1.1.7, P.1 et B.1.35, 501Y. V2) ayant émergé vers la fin de 2020 et au début de 2021. Ces nouveaux variants présentent de multiples mutations au niveau des résidus clés de la glycoprotéine Spike (S).
Le SARS-CoV-2 est coroné avec des protéines S, une glycoprotéine d’enveloppe transmembranaire homo-trimère. Il se lie au récepteur de la cellule hôte humaine ACE2 (enzyme de conversion de l’angiotensine 2), facilitant l’entrée du virus dans la cellule hôte.
Alors que le domaine de liaison au récepteur (RBD) sur la protéine S est la cible principale des anticorps et du développement de vaccins, c’est aussi le domaine qui évolue le plus rapidement dans la structure virale. Ces changements peuvent entraîner l’émergence de mutations de fuite immunitaire, limitant l’efficacité des vaccins et des anticorps thérapeutiques.
Avec l’émergence de variantes du SRAS-CoV-2 préoccupantes, il est important de se concentrer sur le gain de fonction, facilitant l’infectivité virale, la transmissibilité ou la fuite des anticorps neutralisants. En raison de son rôle dans l’évolution des variantes, les scientifiques se sont concentrés sur la surveillance des mutations RBD du SRAS-CoV-2.
Pour évaluer la réponse inhibitrice des anticorps aux variants naturels de la RBD, simultanément, des chercheurs australiens ont développé un test. Il s’agit d’un test multiplex rapide, à haut débit, à l’aide duquel les chercheurs ont démontré deux mécanismes de fuite immunitaire.
Dans cette étude, ils ont observé que soit les anticorps ne reconnaissaient pas les mutations virales, soit les anticorps avaient une capacité inhibitrice réduite en raison d’une affinité RBD-ACE2 accrue dans les variants.
Une approche compétitive où les anticorps entrent simultanément en compétition avec l’ACE2 pour se lier à la RBD peut donc refléter plus précisément la dynamique physiologique de l’infection. »
Dans une étude récente, publiée sur le medRxiv * serveur, une équipe de chercheurs a discuté du rôle potentiel d’un nouveau test pour combler une lacune majeure dans la recherche sur le SRAS-CoV-2. Ce test peut éclairer 1) la sélection de candidats anticorps monoclonaux complémentaires et 2) l’identification rapide de la fuite immunitaire vers des variants de RBD émergents après une vaccination ou une infection naturelle.
Dans cette étude, les chercheurs ont validé ce test multiplex rapide et à haut débit. Ils ont également évalué comment une sélection de variants de RBD à un seul acide aminé naturel observés au cours de la surveillance virale a un impact sur l’efficacité potentielle des traitements par anticorps monoclonaux et sur la reconnaissance par le plasma humain polyclonal en convalescence.
Ce test multiplex de neutralisation compétitif permet aux anticorps de concurrencer simultanément le récepteur de la cellule hôte ACE2 pour se lier à un tableau de variants de RBD couplés à des billes magnétiques. Les chercheurs y voient une approche qui capture mieux la dynamique physiologique de l’interaction.
Notamment, pour échapper à la reconnaissance des anticorps monoclonaux, les chercheurs ont démontré que si le variant N501Y était reconnu avec une affinité relativement élevée par la plupart des mAbs, l’inhibition du N501Y était atténuée dans la plupart des mAbs, probablement en raison de l’affinité accrue de ce variant pour ACE2.
De nombreuses études ont démontré que des anticorps neutralisants puissants reconnaissant la RBD après l’infection sont déclenchés, qui représentent la plupart de l’activité de neutralisation plasmatique et de l’inhibition de la liaison RBD-ACE2. Du fait qu’environ 90% de cette activité neutralisante se produit dans les sérums immuns du SRAS-CoV-2, ces anticorps ont un grand potentiel pour être cliniquement utiles dans le traitement et la prévention de l’infection par le SRAS-CoV-2.
Cependant, il n’y a pas de méthode standardisée pour évaluer les anticorps médiés
neutralisation du SRAS-CoV-2, qui peut expliquer les variations entre les études. Les tests de référence existants présentent des défis tels que les exigences de biosécurité, le temps, la difficulté à mettre en œuvre, les limitations de l’évolutivité ou le dosage d’un seul mutant RDB à la fois.
Bien que ce test ne soit pas destiné à remplacer les tests de neutralisation cellulaires SARS-CoV-2, il fournit une solution simple pour étudier largement la diversité des spécificités de neutralisation du SARS-CoV-2 à un tableau de mutants RBD dans un format de débit, qui peut facilement s’adapter pour inclure de nouvelles variantes RBD à mesure qu’elles émergent. »
Il est important de noter que dans ces dosages, il n’est pas considéré que les anticorps peuvent physiologiquement entrer en compétition avec ACE2 pour se lier à la RBD. Certains de ces variants RBD ont une affinité significativement améliorée pour ACE2.
Cette étude a abordé ces problèmes et a fourni un test pour la surveillance des variantes du SRAS-CoV-2: un nouveau test d’inhibition multiplex RBD-ACE2 à haut débit qui mesure simultanément les NAbs du SARS-CoV-2 à plusieurs variants naturels de RBD.
En conclusion, les chercheurs ont révélé comment ce test multiplex peut servir à signaler les variants de RBD qui peuvent avoir une affinité améliorée pour ACE2, décrire et comparer la cinétique de liaison de plusieurs de ces variants d’affinité-RBD améliorés, et démontrer comment cette affinité améliorée pour ACE2 peut réduire la capacité inhibitrice des Acm et du plasma convalescent.
*Avis important
medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique / les comportements liés à la santé ou être traités comme des informations établies.
