La première preuve d’un lien génétique expliquant pourquoi certaines personnes qui attrapent Covid-19 ne tombent pas malades a été découverte.
Une équipe scientifique et médicale dirigée par l’Université de Newcastle, au Royaume-Uni, a démontré que le gène HLA-DRB1*04:01 se retrouve trois fois plus souvent chez les personnes asymptomatiques. Cela suggère que les personnes atteintes de ce gène ont un certain niveau de protection contre un Covid sévère.
L’étude, financée par Innovate UK, l’agence d’innovation du Royaume-Uni, a comparé des personnes asymptomatiques à des patients de la même communauté qui ont développé un Covid sévère mais n’avaient aucune maladie sous-jacente, et est publiée dans le HLA journal.
L’équipe d’étude pense qu’il s’agit de la première preuve claire de résistance génétique, car cette étude a comparé des personnes gravement atteintes avec un groupe COVID asymptomatique et a utilisé le séquençage de nouvelle génération pour se concentrer en détail et à grande échelle sur les gènes HLA qui sont regroupés sur le chromosome 6. Autre des études ont scanné l’ensemble du génome mais cette approche est moins efficace dans le complexe de typage tissulaire.
Les études à l’échelle du génome peuvent être comparées à une image satellite. La densité et la complexité élevées du complexe d’histocompatibilité et la variation dans différentes populations signifient qu’une variation significative peut être négligée. Par exemple, différents allèles ou versions du même gène pourraient avoir des effets opposés sur la réponse immunitaire. Cette étude était beaucoup plus ciblée et comparait le symptomatique à l’asymptomatique dans la même population révélant les qualités « protectrices » de l’allèle.
On sait que le gène de l’antigène leucocytaire humain identifié, HLA-DRB1*04:01, est directement corrélé à la latitude et à la longitude. Cela signifie que davantage de personnes dans le nord et l’ouest de l’Europe sont susceptibles d’avoir ce gène.
Cela suggère que les populations d’ascendance européenne seront plus susceptibles de rester asymptomatiques mais de transmettre toujours la maladie aux populations sensibles.
Le Dr Carlos Echevarria de l’Institut de recherche translationnelle et clinique de l’Université de Newcastle, qui travaille également en tant que consultant respiratoire au Newcastle Hospitals NHS Foundation Trust et est co-auteur de l’article, déclare : « C’est une découverte importante car elle peut expliquer pourquoi certains les gens attrapent Covid mais ne tombent pas malades.
« Cela pourrait nous conduire à un test génétique qui pourrait indiquer qui nous devons prioriser pour les futures vaccinations. »
« Au niveau de la population, c’est important pour nous de le savoir car lorsque nous avons beaucoup de gens qui sont résistants, donc ils attrapent Covid mais ne présentent pas de symptômes, alors ils risquent de propager le virus alors qu’ils sont asymptomatiques. »
L’effet des gènes liés à la géolocalisation est un concept scientifique accepté et il est bien connu que les gènes HLA se développent au fil des générations en réaction à des agents pathogènes pathogènes.
L’auteur de l’étude, David Langton, dont la société ExplantLab a aidé à financer l’étude grâce à un prix de recherche Innovate UK, a ajouté : « Certaines des découvertes les plus intéressantes ont été les relations entre la longitude et la latitude et la fréquence du gène HLA. On sait depuis longtemps que l’incidence de La sclérose en plaques augmente avec l’augmentation de la latitude. Ceci a été attribué en partie à une exposition réduite aux UV et donc à une diminution des niveaux de vitamine D. Nous ne savions cependant pas que l’un des principaux gènes de risque pour la SEP, à savoir DRB1*15:01 , est directement corrélé à la latitude.
« Cela met en évidence l’interaction complexe entre l’environnement, la génétique et la maladie. Nous savons que certains gènes HLA sont sensibles à la vitamine D, et que les faibles niveaux de vitamine D sont un facteur de risque de COVID sévère et nous poursuivons nos travaux dans ce domaine. »
L’étude a utilisé des échantillons de 49 patients atteints de Covid sévère qui avaient été hospitalisés pour insuffisance respiratoire, des échantillons d’un groupe asymptomatique de 69 travailleurs hospitaliers qui avaient été testés positifs lors de tests sanguins d’anticorps sanguins de routine et un groupe témoin d’une étude sur la relation entre les génotypes HLA et les résultats de la chirurgie de remplacement articulaire.
La recherche a utilisé des machines de séquençage de nouvelle génération pour étudier en profondeur les différentes versions, ou allèles, des gènes HLA, ce qui a été combiné à une variété d’expertise et de modélisation. Le travail s’est limité à des échantillons du nord-est de l’Angleterre pendant le premier verrouillage, cette variation réduite dans les groupes d’étude, mais d’autres études seront nécessaires au Royaume-Uni et dans d’autres populations car il peut y avoir différentes copies des gènes HLA offrant une résistance dans d’autres populations.
Le travail était une collaboration entre l’Université de Newcastle, le Newcastle Hospitals NHS Foundation Trust, le Northumbria Healthcare NHS Foundation Trust ainsi que le James Cook University Hospital et le North Tees and Hartlepool Hospitals NHS Foundation Trust.
Le SRAS Cov-2 est l’une des plus grandes menaces auxquelles l’humanité ait été confrontée. Plus nous comprenons pourquoi certaines personnes tombent malades, mieux nous pourrons nous défendre contre ce virus et d’autres comme lui à l’avenir. »
Sir John Burn, co-auteur, professeur de génétique clinique à l’université de Newcastle
La source:
Référence de la revue :
Langton, DJ, et al. (2021) L’influence du génotype HLA sur la gravité de l’infection au COVID-19. HLA. doi.org/10.1111/tan.14284.
