Dans une étude récente publiée dans le Journal européen de nutrition clinique, les chercheurs utilisent des techniques de randomisation mendélienne (MR) pour établir un lien de causalité entre la consommation de café et la réduction du risque de migraine.
Étude: Relation causale entre la consommation de café et les maladies neurologiques : une étude de randomisation mendélienne. Crédit d’image : Architecte Farknot/Shutterstock.com
Sommaire
Arrière-plan
Les maladies neurologiques telles que la maladie d’Alzheimer (MA), la sclérose latérale amyotrophique (SLA), les migraines, la sclérose en plaques (SEP), la maladie de Parkinson (MP) et les accidents vasculaires cérébraux sont les principales causes de décès et d’invalidité dans le monde. Les effets de ces maladies sur le système nerveux altèrent la cognition et provoquent des douleurs, des maux de tête, des convulsions et des troubles du mouvement.
Rien qu’en 2016, les maladies neurologiques étaient responsables de près de 10 % des décès et de 16 % des années de vie corrigées de l’incapacité dans le monde. Il est urgent de rechercher les causes de ces maladies et les moyens de les prévenir.
Le café est l’une des boissons les plus consommées au monde, ce qui a amené de nombreux scientifiques à évaluer ses impacts possibles sur la santé humaine. Cependant, ces études étaient principalement observationnelles, ce qui rendait difficile pour les chercheurs d’éliminer les effets de biais et une éventuelle causalité inverse.
À propos de l’étude
MR propose une méthode d’évaluation de l’effet causal d’un facteur de risque et de la maladie qui, dans la présente étude, seraient respectivement la consommation de café et les maladies neurologiques. MR utilise les données génétiques associées au facteur de risque mais pas aux maladies elles-mêmes et utilise ces informations comme variables instrumentales (IV). Dans la présente étude, les chercheurs ont identifié des polymorphismes mononucléotidiques (SNP) connus pour influencer la consommation de café sous le nom d’IV.
L’utilisation des IV repose sur trois hypothèses clés. Premièrement, les instruments doivent être fortement associés à l’exposition. Deuxièmement, les IV ne devraient avoir aucune association avec d’éventuels facteurs de confusion, qui affectent également le risque de maladie. De plus, le seul effet que les instruments devraient avoir sur la maladie devrait être leur effet sur l’exposition.
À l’aide de l’étude d’association pangénomique (GWAS) de la Biobank du Royaume-Uni, les chercheurs ont identifié 40 SNP, chacun indépendant des autres, sur la base de plus de 400 000 personnes d’origine européenne. Les SNP ont été validés de sorte que leur association avec la consommation de café ait un seuil de signification à l’échelle du génome inférieur à 5×10.-8. Des statistiques F supérieures à 10 ont également été utilisées pour réduire l’effet des biais.
Plusieurs autres ensembles de données, notamment le projet international de génomique de la maladie d’Alzheimer, le consortium international de génomique de la maladie de Parkinson et le consortium international de génétique de la sclérose en plaques, ont également été utilisés pour obtenir les données nécessaires sur les maladies neurologiques.
Une méta-analyse de poids de variance inverse (IVW) a été réalisée. La somme résiduelle de pléiotropie MR et des tests de valeurs aberrantes ont été utilisés pour éliminer les instruments potentiellement pléiotropes. À chaque étape de l’analyse, les IV aberrants ont été supprimés pour renforcer les résultats.
Résultats de l’étude
Les 40 SNP sélectionnés comme IV avaient des statistiques F comprises entre 16 et 359, indiquant ainsi qu’il s’agit d’instruments puissants. Selon l’analyse IVW, la consommation de café réduit le risque de migraine et de migraine avec aura. Ces résultats ont été validés grâce à l’utilisation d’une analyse « sans intervention », dans laquelle aucune IV n’était responsable du résultat.
Aucune association entre la consommation de café et la migraine sans aura n’a été observée, ni aucun signe de pléiotropie horizontale. De plus, aucune association entre la consommation de café et l’une des autres maladies neurologiques ou l’un de leurs sous-types n’a été observée. L’hétérogénéité des résultats n’a pas affecté ces conclusions.
Conclusions
Les résultats de l’étude indiquent des associations causales robustes entre la consommation de café et la réduction du risque de migraine ; cependant, aucune association avec d’autres maladies neurologiques majeures n’a été identifiée. Ces résultats contribuent à un vaste corpus de littérature évaluant l’effet du café sur la santé humaine, mais se distinguent par leur utilisation des IV et des données génétiques pour atténuer l’effet des biais et de divers facteurs de confusion.
Même si les résultats sont convaincants, les chercheurs soulignent certaines limites. Par exemple, toutes les sources de pléiotropie directionnelle potentielle n’étaient pas nécessairement exclues, ce qui constitue un défi courant dans les études IRM. De plus, les chercheurs n’ont pas évalué la manière dont le café était consommé, ce qui indique qu’un élément alimentaire vital reste à évaluer.
Une autre limite majeure est que l’étude se concentre uniquement sur les personnes d’origine européenne. Il est donc impératif d’inclure les Asiatiques du Sud, les Asiatiques de l’Est et les individus d’autres ethnies dans les études futures.
