Le Broad Institute of MIT et Harvard, le Dana-Farber Cancer Institute et le St. Jude Children’s Research Hospital ont annoncé aujourd’hui la plus grande collaboration universitaire de ce type pour transformer et accélérer l’identification des vulnérabilités dans les cancers pédiatriques et les traduire en de meilleurs traitements.
La collaboration est soutenue par un nouvel investissement de financement conjoint par les trois institutions de plus de 60 millions de dollars sur cinq ans. Cet investissement soutiendra le développement de l’infrastructure et les travaux scientifiques d’une équipe actuellement composée de plus de 80 chercheurs collaborateurs, scientifiques des données et membres du personnel de recherche. L’effort devrait atteindre 100 membres à mesure que chaque institution ajoute des employés.
En combinant le leadership intellectuel, l’expertise technique et les ressources institutionnelles des trois institutions, cette nouvelle collaboration vise à combler les lacunes critiques dans les connaissances liées à la base biologique du cancer infantile et à la manière dont il pourrait être traité plus efficacement. Le projet Pediatric Cancer Dependencies Accelerator, remarquable pour sa grande échelle d’investissement, le nombre de scientifiques collaborateurs et la portée scientifique, accélérera les progrès dans le développement de nouveaux traitements pour les cancers pédiatriques agressifs en :
- Développer et déployer des techniques d’édition du génome pour identifier les vulnérabilités cachées (dépendances) dans une gamme de cancers du cerveau, solides et sanguins infantiles à haut risque.
- Tirer parti des technologies émergentes pour caractériser le paysage génétique et épigénétique des cancers pédiatriques.
- Développer des systèmes modèles là où il n’en existe pas actuellement pour les cancers infantiles à haut risque qui ont de mauvais résultats.
- Identifier les thérapies combinées efficaces et les mécanismes de résistance aux médicaments et raccourcir le délai de développement de nouvelles thérapies.
- Développer des approches informatiques pour exploiter et intégrer des données et développer des outils logiciels innovants pour le partage de données.
Le projet est codirigé par Charles WM Roberts, MD, PhD, directeur du St. Jude Comprehensive Cancer Center, Kimberly Stegmaier, MD, Dana-Farber Cancer Institute, vice-présidente de la recherche en oncologie pédiatrique, et Francisca Vazquez, PhD, Broad Institute Cancer Directeur du projet de cartographie des dépendances.
Malgré de nombreux progrès, le cancer reste la première cause de décès par maladie chez les enfants aux États-Unis. Cela peut prendre des décennies dans un laboratoire de recherche pour comprendre les mécanismes et développer de nouveaux traitements. Grâce à ce projet, nous pensons que nous pouvons désormais franchir les barrières pour identifier rapidement les vulnérabilités thérapeutiques dans le cancer infantile et les traduire en thérapies ciblées beaucoup plus rapidement en clinique. »
Charles WM Roberts, MD, PhD, Centre de lutte contre le cancer complet St. Jude
« Notre projet de carte de la dépendance au cancer pédiatrique de première génération a connu un succès retentissant, mais ce n’est que la pointe de l’iceberg », a déclaré Stegmaier. « Je suis tellement enthousiasmé par cette collaboration sans précédent entre trois institutions extraordinaires. L’accélérateur PedDep découvrira de nouvelles cibles thérapeutiques nouvelles et indispensables tout en révélant les fondements mécanistes d’un large éventail de cancers infantiles, fournissant un trésor de données pour notre communauté de la recherche. »
« L’accélérateur PedDep illustre la puissance d’une collaboration approfondie et de la mise en place d’une équipe multidisciplinaire à travers les institutions pour s’attaquer à un défi important de la maladie qui affecte les enfants du monde entier », a déclaré Vazquez. « Grâce au partage de données et au développement d’outils, nous nous engageons à créer une ressource que la communauté scientifique peut exploiter pour avoir un impact réel sur les cancers infantiles. Je suis ravi de voir l’impact que ce projet aura sur le rythme de la découverte thérapeutique pour les tumeurs pédiatriques. . »
Cancer pédiatrique : une opportunité d’innovation et de découverte
La collaboration s’appuie sur des initiatives de recherche novatrices de chaque institution. Au cours de la dernière décennie, le projet sur le génome du cancer pédiatrique de l’Université St. Jude-Washington et d’autres efforts de séquençage à grande échelle ont fourni de riches informations sur le paysage génomique des cancers pédiatriques, y compris la compréhension que la plupart des mutations génétiques à l’origine de la maladie ne sont pas médicamentables. Le développement de thérapies de précision nécessitera d’identifier les dépendances et les vulnérabilités au cancer qui ne sont pas révélées uniquement par l’exploration des ensembles de données génomiques.
L’initiative Cancer Dependency Map (DepMap) de Broad a développé de vastes ensembles de données et une infrastructure informatique de classe mondiale qui ont eu un impact sur les programmes de recherche et de découverte de cibles dans le monde entier. Lancé en 2015, le Pediatric Cancer Dependency Map Project (PedDep) a servi de preuve de concept pour appliquer l’approche DepMap aux cancers de l’enfant. Par exemple, les écrans CRISPR du génome entier ont maintenant été efficacement déployés à grande échelle pour identifier les vulnérabilités dans des centaines de cancers adultes, et une preuve de principe a été établie que ces approches peuvent également identifier les faiblesses des cancers infantiles, qui ont souvent des génomes beaucoup plus simples. Des capacités de dépistage de drogues à grande échelle ont également été développées. Cette infrastructure et cette expertise seront exploitées et élargies grâce à cet effort.
Le projet s’appuiera sur l’expertise en modélisation de St. Jude et Dana-Farber dans la création de modèles de xénogreffes dérivées de patients (PDX) qui utilisent des cellules cancéreuses de patients, et correspondent ainsi plus étroitement à la biologie de la maladie telle qu’elle apparaît dans la clinique . Les biologistes computationnels de St. Jude apporteront une vaste expertise sur les analyses des caractérisations épigénomiques et génomiques, la visualisation des données et le développement de pipelines informatiques. De plus, l’infrastructure de St. Jude facilitera le dépistage des médicaments combinés et in vivo Approches CRISPR et de dépistage des drogues.
Les groupes interfonctionnels comprendront des chercheurs de Broad, Dana-Farber et St. Jude, se concentrant sur trois principaux domaines de la maladie (tumeurs cérébrales, hémopathies malignes et tumeurs solides) et mettant à profit l’expertise pan-cancer en science des données, génomique fonctionnelle et grande- dépistage de drogue à grande échelle. Ensemble, les chercheurs de ces institutions amélioreront et accéléreront les progrès en combinant des forces et des ressources uniques pour relever les plus grands défis liés à la compréhension et au traitement des cancers pédiatriques.