Une nouvelle étude suggère que Escherichia coli et d’autres microbes pathogènes se transmettent facilement entre les humains et les animaux au Cambodge, un pays où l’eau potable, l’assainissement et les contrôles d’hygiène font défaut dans de nombreuses régions. L’échange continu, ainsi que l’utilisation non réglementée d’antibiotiques, conduisent à l’émergence et à la propagation de maladies résistantes aux médicaments. E. colidisent les auteurs.
Maya Nadimpalli, collaboratrice scientifique au Antibiotic Research Action Center de l’Université George Washington et ses collègues internationaux, ont mené la recherche à Phnom Penh, une zone urbaine où les humains et les animaux vivent souvent à proximité, sans eau potable ni autres contrôles environnementaux qui aider à prévenir la propagation de E. coli et d’autres microbes potentiellement dangereux.
Nadimpalli a travaillé avec Lance B. Price, directeur du Centre d’action contre la résistance aux antibiotiques chez GW, et son équipe, pour comparer la séquence génétique de E. coli obtenu auprès des humains vivant à Phnom Penh et de la viande achetée sur le marché. L’équipe a identifié plusieurs éléments génétiques qui confèrent une résistance à de puissants antibiotiques largement dispersés parmi les humains et les animaux destinés à la production alimentaire à Phnom Penh.
« Les résultats de notre étude étaient à couper le souffle. Ils ont suggéré que E. coli les souches humaines et animales échangeaient de l’ADN à des rythmes que nous ne voyons pas dans les pays à revenu élevé. Et l’ADN qu’ils partageaient les rend résistants à certains des antibiotiques les plus importants en médecine humaine », a déclaré Price, qui est également professeur de santé environnementale et professionnelle à l’Université George Washington. « Les pays qui n’ont pas un accès généralisé à l’eau potable et d’autres contrôles environnementaux pourraient par inadvertance préparer la prochaine pandémie.
L’étude suggère que l’environnement de Phnom Penh a créé de nombreuses opportunités d’échange de bactéries et d’éléments génétiques conférant une résistance aux antibiotiques. La plupart de la viande et du poisson vendus sur les marchés de Phnom Penh sont cultivés dans les zones rurales. Un manque de traitement des eaux usées en milieu rural peut entraîner la contamination de l’eau potable pour les humains et les animaux. Les poissons d’élevage peuvent être nourris avec les déchets des porcs et des volailles. En outre, certaines personnes à Phnom Penh consomment régulièrement de la viande ou du poisson insuffisamment cuit, a noté Nadimpalli, qui est également professeur adjoint de santé environnementale à la Rollins School of Public Health de l’Université Emory.
Garantir un accès constant à l’eau potable et à l’assainissement peut améliorer la santé et le bien-être des populations de bien des manières. Nous soupçonnons que cela pourrait également contribuer à la résistance aux antibiotiques, mais nos résultats montrent qu’améliorer l’accès à l’eau potable et à l’assainissement est en réalité requis – tant chez les humains que chez les animaux destinés à l’alimentation – si nous voulons avoir une chance de préserver les antibiotiques pour la santé humaine. »
Maya Nadimpalli, collaboratrice scientifique au Antibiotic Research Action Center, George Washington University
L’étude a montré que les souches de E. coli à Phnom Penh avait développé une résistance à deux antibiotiques puissants utilisés pour traiter les humains : les céphalosporines et les fluoroquinolones. Les personnes qui deviennent malades en mangeant de la nourriture ou en étant exposées à des médicaments résistants E. coli et d’autres microbes peuvent développer des infections potentiellement mortelles. Les experts en santé publique estiment que les infections bactériennes résistantes aux antibiotiques sont à l’origine de plus de 1,3 million de décès dans le monde chaque année.
Dans les pays à revenu élevé comme les États-Unis, les experts s’efforcent de développer des antibiotiques plus efficaces et d’amener les gens à éviter leur utilisation inutile.
Toutefois, cette étude suggère que le problème de la résistance aux antibiotiques ne disparaîtra pas à moins que les responsables de la santé publique ne s’attaquent au manque d’accès constant à des installations sanitaires de base et à d’autres contrôles environnementaux dans les pays où la production animale destinée à l’alimentation s’intensifie.
« Il s’agit d’un problème de santé publique urgent qui nécessitera que les décideurs politiques, les chercheurs et autres travaillent ensemble pour réduire le risque », a déclaré Price. « Pour lutter contre cette menace, les experts devront remédier au manque d’assainissement de base et d’autres contrôles environnementaux qui conduisent à l’émergence et à la propagation d’agents pathogènes résistants aux antibiotiques qui nous menacent tous. »
L’étude intitulée « Boucher les fuites : résistance aux antibiotiques aux interfaces homme-animal dans les contextes à faibles ressources » a été publiée le 19 septembre dans la revue Frontières de l’écologie et de l’environnement. Outre Price et Nadimpalli, cette étude a été dirigée par des chercheurs des Instituts Pasteur de France et du Cambodge et soutenue par des co-auteurs du Danemark, de Belgique et d’autres universités américaines.