Une équipe dirigée par des chercheurs du Penn State’s College of Agricultural Sciences a mis au point un test de diagnostic permettant d’identifier les formes virulentes du pathogène bactérien porcin Streptococcus equi sous-espèce zooepidemicus – souvent appelé «zoo de streptocoques» – qui peut provoquer des maladies graves et la mort chez les porcs, les autres animaux et rarement les humains.
Des éclosions de S. zooepidemicus causant une mortalité élevée chez les porcs ont été signalées pour la première fois en Asie en 1977, et jusqu’à récemment, le pathogène n’était pas considéré comme une préoccupation majeure en Amérique du Nord. Cependant, des éclosions de zoo de streptocoques à forte mortalité sont survenues dans des troupeaux de porcs au Canada, au Tennessee, en Ohio et en Pennsylvanie en 2019.
Différentes versions de l’agent pathogène peuvent également provoquer une gamme de symptômes de maladie chez les chevaux, les ruminants, les cobayes, les singes, les chats, les chiens, les volailles et les humains.
Les porcs infectés par le zoo Strep peuvent souffrir d’une léthargie soudaine, d’une faiblesse, d’une forte fièvre et d’une mortalité en escalade rapide qui peut approcher 30% à 50% des animaux infectés.
Cependant, la bactérie à l’origine de ces symptômes présente un défi de diagnostic car les souches virulentes sont largement indiscernables des souches bénignes, selon le chercheur principal Suresh Kuchipudi, professeur clinique de sciences vétérinaires et biomédicales.
Un diagnostic rapide et précis est absolument essentiel pour contrôler et limiter la propagation de cette maladie émergente du porc. Mais la version de la bactérie mortelle est très similaire – avec seulement des différences génétiques mineures – aux bactéries que l’on trouve couramment chez les porcs en bonne santé et chez d’autres animaux. En conséquence, les méthodes conventionnelles ne peuvent pas identifier de manière sélective cette version virulente. «
Suresh Kuchipudi, directeur associé, Laboratoire de diagnostic animal, Penn State
Pour résoudre ce problème, l’équipe a entrepris d’identifier les facteurs génétiques propres aux bactéries virulentes Strep zoo. À l’aide d’outils de pointe, y compris le séquençage de nouvelle génération, les chercheurs ont examiné des isolats bactériens provenant d’une épidémie mortelle de zoo de Pennsylvania Strep.
Leur analyse s’est concentrée sur le gène SzM, qui avait été identifié dans des recherches antérieures comme un facteur de virulence clé de S. zooepidemicus pour les porcs, mais qui n’a pas été trouvé dans les souches avirulentes du pathogène.
Ciblant le gène SzM, les chercheurs ont développé une réaction en chaîne par polymérase en temps réel basée sur des sondes, ou PCR, test de diagnostic pour la détection d’isolats virulents de Strep zoo.
Ils ont évalué la spécificité et la sensibilité du test en l’utilisant pour tester un panel d’isolats bactériens de référence et d’agents pathogènes viraux couramment associés aux maladies respiratoires du porc. De plus, ils ont appliqué le nouveau test pour tester les souches avirulentes de S. zooepidemicus.
L’étude de l’équipe, rapportée récemment dans Frontières de la science vétérinaire, ont constaté que le nouveau test PCR identifiait de manière fiable les souches virulentes de Strep zoo, tout en produisant des résultats négatifs lors du test d’autres agents pathogènes pouvant causer des maladies respiratoires porcines, ainsi que des souches avirulentes de S. zooepidemicus.
Kuchipudi a noté que les maladies infectieuses animales émergentes et réémergentes ont le potentiel d’avoir un impact négatif sur la santé animale, la sécurité alimentaire et le commerce.
« Plusieurs maladies infectieuses animales ont également un potentiel zoonotique, ce qui signifie qu’elles peuvent avoir un impact significatif sur la santé publique », a-t-il déclaré.
«Pour ces raisons, un diagnostic précis et rapide est de la plus haute importance. Ce nouveau test – qui peut donner des résultats en moins de quatre heures et est le premier test permettant de détecter sélectivement S. zooepidemicus virulent chez les porcs – offre une solution pratique pour le problème jusqu’alors non résolu du diagnostic du zoo Strep dans les troupeaux de porcs. «
Kuchipudi a ajouté qu’une question clé qui reste à résoudre est de savoir si les animaux sensibles d’autres espèces servent de réservoirs pour S. zooepidemicus. «Ce test PCR peut également être utilisé pour répondre à cette question et étudier plus avant la gamme d’hôtes de S. zooepidemicus», a-t-il déclaré.
La source:
Référence du journal:
Kuchipudi, SV, et al. (2021) Un nouveau test PCR en temps réel pour la détection rapide des virulents Streptococcus equi Sous-espèces zooepidemicus—Un agent pathogène émergent du porc. Frontières de la science vétérinaire. doi.org/10.3389/fvets.2021.604675.