Au cours de l'épidémie de coronavirus, des épidémies de COVID-19 ont frappé des communautés à travers les États-Unis. Au fur et à mesure que les grappes d'infection évoluent avec le temps, les responsables locaux sont contraints d'adopter une approche féroce pour allouer des ressources et mettre en œuvre des politiques de santé publique. Dans un nouveau étude menée par l'Université de l'Utah, les géographes ont publié le premier effort pour effectuer une surveillance quotidienne des points chauds émergents du COVID-19 pour chaque comté des États-Unis contigus.Les chercheurs espèrent que des données ponctuelles et localisées aideront à éclairer les décisions futures.
À l'aide de statistiques spatio-temporelles innovantes, les chercheurs ont détecté des zones géographiques où la population présentait un risque élevé de contracter le virus. Ils ont effectué l'analyse tous les jours en utilisant le nombre quotidien de cas de COVID-19 du 22 janvier au 5 juin 2020 pour établir des grappes régionales, définies comme un ensemble de cas de maladie étroitement regroupés dans le temps et l'espace. Pour le premier mois, les grappes étaient très importantes, en particulier dans le Midwest. À partir du 25 avril, les grappes deviennent plus petites et plus nombreuses, une tendance qui persiste jusqu'à la fin de l'étude.
le article publié en ligne le 27 juin 2020 dans la revue Épidémiologie spatiale et spatio-temporelle. L'étude s'appuie sur les travaux antérieurs de l'équipe en évaluant les caractéristiques de chaque grappe et la façon dont les caractéristiques changent à mesure que la pandémie se déroule.
Nous avons appliqué une méthode de regroupement qui identifie les domaines de préoccupation et suit également les caractéristiques des grappes – sont-elles en croissance ou en diminution, quelle est la densité de la population, le risque relatif augmente-t-il ou non?. Nous espérons que cela peut offrir des informations sur les meilleures stratégies pour contrôler la propagation du COVID-19 et pour prédire potentiellement les futurs points chauds. «
Alexander Hohl, auteur principal et professeur adjoint au Département de géographie de l'Université de l'Utah
L'équipe de recherche, dont Michael Desjardins du Spatial Science for Public Health Center de la Johns Hopkins Bloomberg School of Public Health et Eric Delmelle et Yu Lan de l'Université de Caroline du Nord à Charlotte, ont créé une application Web des clusters que le public peut consulter quotidiennement. à COVID19scan.net. L'application n'est qu'un début, a averti Hohl. Les représentants de l’État devraient procéder à une analyse à plus petite échelle pour identifier les lieux d’intervention spécifiques.
« L'application est destinée à montrer où les fonctionnaires doivent prioriser leurs efforts – elle ne vous dit pas où vous allez ou ne contracterez pas le virus », a déclaré Hohl. « Je vois cela plus comme une inspiration, plutôt qu'un outil concret, pour guider les autorités pour prévenir ou répondre aux épidémies. Cela donne également au public un moyen de voir ce que nous faisons. »
Les chercheurs ont utilisé des dénombrements quotidiens de cas rapportés dans le référentiel de données COVID-19 du Center for Systems Science and Engineering de l'Université Johns Hopkins, qui répertorie les cas au niveau du comté des États-Unis contigus.Ils ont utilisé les estimations de la population sur cinq ans du site Web du recensement américain pour 2018. dans chaque comté.
Pour établir les grappes, ils ont exécuté une statistique d'analyse spatio-temporelle qui prend en compte le nombre de cas observés et la population sous-jacente dans une zone géographique et une période de temps données. En utilisant SatScan, un logiciel largement utilisé, a identifié les zones de risque significativement élevé de COVID-19. En raison de la grande variation entre les comtés, l'évaluation des risques est délicate. Les zones rurales et les petits comtés isolés peuvent ne pas avoir de grandes populations, donc seulement une poignée de cas ferait augmenter le risque de manière significative.
Cette étude est la troisième de l'itération du groupe de recherche utilisant la méthode statistique de détection et de surveillance des grappes de COVID-19 aux États-Unis.En mai, le groupe ont publié leur première étude géographique utilisant la méthode de suivi, qui était également le premier article publié par des géographes analysant le COVID-19. En juin, ils ont publié un mettre à jour.
« Le mois de mai semble il y a une éternité parce que la pandémie évolue si rapidement », a déclaré Hohl. «Nous continuons à recevoir des commentaires de la communauté de recherche et nous essayons toujours d'améliorer la méthode. Il ne s'agit que d'une méthode pour cibler les communautés à risque.
Une grande limitation de l'analyse est les données elles-mêmes. Le rapport COVID-19 est différent pour chaque état. Il n'y a pas de manière uniforme que les informations circulent des laboratoires qui confirment les diagnostics, aux agences de santé de l'État, au référentiel de données COVID-19 du Center for Systems Science and Engineering de l'Université Johns Hopkins, où l'étude obtient ses données. En outre, les efforts de test sont assez différents d'un État à l'autre et l'équipe s'efforce d'ajuster le nombre de cas observés afin de refléter les efforts d'un État. Hohl travaille également avec d'autres chercheurs de l'U pour examiner la relation entre les médias sociaux et le COVID-19 afin de prédire la trajectoire future des épidémies.
«Nous y travaillons depuis le début du COVID-19 et le terrain évolue incroyablement vite», a déclaré Hohl. « Il est si important de faire passer le mot et de réagir à ce qui est publié pour que nous puissions passer à l'étape suivante du projet. »
La source:
Référence du journal:
Hohl, A., et coll. (2020) Surveillance quotidienne du COVID-19 à l'aide de la statistique prospective de balayage spatio-temporel aux États-Unis. Épidémiologie spatiale et spatio-temporelle. doi.org/10.1016/j.sste.2020.100354.
