Une étude menée par des chercheurs au Royaume-Uni et en Italie suggère que les personnes atteintes du coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2) sont probablement les plus infectieuses au cours de la première semaine de la maladie.
La revue systématique et la méta-analyse des données disponibles sur la dynamique virale du SRAS-CoV-2 ont révélé que, bien que l'excrétion virale puisse être prolongée chez les personnes infectées, tout virus vivant avait tendance à être éliminé des voies respiratoires dans la semaine suivant l'apparition des symptômes.
Aucune étude n'a rapporté l'isolement du virus vivant neuf jours après l'apparition des symptômes, même si les patients avaient encore des charges élevées d'ARN viral. Cette découverte suggère que la durée de détection de l'ARN viral ne peut pas être utilisée pour déduire la durée pendant laquelle une personne est infectieuse, disent Antonio Ho (Université de Glasgow) et ses collègues.
L'équipe affirme que les résultats soulignent l'importance d'identifier les cas d'infection tôt et de commencer les pratiques d'isolement dès que les symptômes commencent, même lorsque les symptômes sont légers.
Une version pré-imprimée du papier est disponible sur le serveur medRxiv *, tandis que l'article fait l'objet d'un examen par les pairs.
Nouveau coronavirus SARS-CoV-2 Micrographie électronique à transmission d'une particule de virus SARS-CoV-2, isolée d'un patient. Image capturée et mise en valeur des couleurs au centre de recherche intégré (IRF) du NIAID à Fort Detrick, Maryland. Crédit: NIAID
Sommaire
L'importance de comprendre la dynamique virale du SRAS-CoV-2
Comprendre la dynamique virale, la durée de l'excrétion de l'ARN viral et l'isolement d'un virus viable sont essentiels pour comprendre la transmission de la maladie, déterminer la durée de l'infectiosité et informer l'efficacité des mesures de contrôle.
«Alors qu'un certain nombre d'études ont évalué l'excrétion du SRAS-CoV-2, la dynamique de la charge virale et la durée de l'excrétion virale rapportées jusqu'à présent dans les études ont été hétérogènes», ont déclaré Ho et ses collègues.
Maintenant, l'équipe a mené une étude visant à caractériser la dynamique de la charge virale, la durée de l'ARN viral et l'excrétion du SRAS-CoV-2 viable dans différents types d'échantillons, y compris ceux prélevés dans les voies respiratoires supérieures (URT), des voies respiratoires (LRT) et des échantillons de selles et de sperme. Les chercheurs ont également comparé la dynamique virale du SRAS-CoV-2 avec celles du SRAS-CoV-1 et du coronavirus du syndrome respiratoire du Moyen-Orient (MERS-CoV).
Qu'a trouvé l'étude?
Après avoir recherché Medline, EMBASE, Europe PMC, les serveurs de pré-impression MedRxiv et BioRxiv et la littérature grise, l'équipe a identifié 79 études sur le SARS-CoV-2, huit sur le SRAS-CoV-1 et 11 sur le MERS-CoV qui répondaient aux critères d'éligibilité .
Pour le SRAS-CoV-2, la durée moyenne de l'excrétion de l'ARN viral était de 17,0 jours dans l'URT; 14,6 jours dans le LRT, 17,2 jours dans les selles et 16,6 jours dans le sérum. Les durées maximales d'excrétion correspondantes étaient de 83, 59, 35 et 60 jours.
Diagramme à bulles de méta-régression de l'impact de l'âge sur l'excrétion moyenne de SRAS-CoV-2 des voies respiratoires supérieures
La plupart des études évaluant la charge virale du SRAS-CoV-2 dans les séries d'échantillons URT ont montré que les charges atteignaient un pic dans la semaine suivant l'apparition des symptômes, avant de diminuer de manière constante. En revanche, les charges virales du SRAS-CoV-1 ont atteint un sommet dans les échantillons d'URT entre les jours 10 et 14 de la maladie, et les charges virales de MERS-CoV ont atteint leur maximum aux jours 7 à 10 de la maladie.
«Les patients infectés par le SRAS-CoV-2 sont susceptibles d'être les plus contagieux au cours de la première semaine de la maladie», écrivent Ho et son équipe. «Plusieurs études rapportent des pics de charge virale pendant la phase prodromique de la maladie ou au moment de l'apparition des symptômes, ce qui justifie la propagation efficace du SRAS-CoV-2.»
Cinq études évaluant les charges virales du SRAS-CoV-2 dans des échantillons de LRT ont montré des pics au cours de la deuxième semaine de la maladie, tandis que les charges virales dans les selles étaient plus incohérentes, allant des pics signalés au jour 7 et jusqu'à six semaines après le début des symptômes.
Aucune des études n'a réussi à isoler le virus vivant
De toutes les études qui ont tenté d'isoler le virus vivant dans des échantillons respiratoires, aucune n'a pu le faire au-delà du neuvième jour de l'apparition des symptômes, même lorsque la charge virale restait élevée. Le délai médian d'élimination du virus vivant était de 3,5 jours dans les échantillons URT et de 6 jours dans les échantillons LRT.
« Aucun virus vivant isolé au-delà du neuvième jour des symptômes malgré des charges d'ARN viral constamment élevées, soulignant ainsi que la période infectieuse ne peut être déduite de la durée de détection de l'ARN viral », ont déclaré Ho et ses collègues. «Bien que l'excrétion d'ARN du SRAS-CoV-2 puisse être prolongée dans les échantillons respiratoires et de selles, la durée d'un virus viable est de courte durée.»
L'équipe affirme que cette revue, qui est la première étude à analyser de manière exhaustive la dynamique virale du SRAS-CoV-2 et la durée de l'excrétion virale, souligne l'importance de détecter et d'isoler les cas précoces et d'éduquer le public sur le spectre de la maladie.
«Cependant, étant donné les retards potentiels dans l'isolement des patients, un confinement efficace du SRAS-CoV-2 peut être difficile même avec une stratégie de détection précoce et d'isolement», concluent les chercheurs.
*Avis important
medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, orienter la pratique clinique / les comportements liés à la santé ou être traités comme des informations établies.
