Un nouveau document de recherche de Chine publié sur le serveur de pré-impression medRxiv * affirme que les résultats positifs récurrents pour le SRAS-CoV-2 sont dus à la présence de faibles niveaux de fragments d'ARN viral et non à l'excrétion de particules virales infectieuses.
Sommaire
Positifs récurrents: le risque
La pandémie COVID-19 en cours s'est propagée dans le monde entier, causant plus de 659000 décès et un nombre étonnant de 16,67 millions de cas confirmés. Sur ce nombre, environ 6,5 millions sont actuellement infectés et près de 10 millions se sont rétablis.
Presque depuis le début, des rapports ont surgi de patients qui apparemment récupérés et ont été renvoyés testés positifs sur les tests de réaction en chaîne transcriptase-polymérase inverse (RT PCR) pour l'ARN viral. On les appelle des positifs récurrents. Dans la plupart des cas, ces rapports concernaient un petit nombre de patients, qui étaient généralement asymptomatiques ou n'avaient que des symptômes bénins.
Le problème avec les positifs récurrents (qui ont été testés négatifs à plusieurs reprises avant ce résultat) est qu'ils pourraient être des porteurs silencieux du virus, entraînant la transmission communautaire. En réponse, le gouvernement chinois place ces patients en quarantaine pendant 14 jours, un effort compliqué et coûteux.
L'étude: des points positifs récurrents
La présente étude vise à combler le manque de connaissances concernant ces patients, leur taux d'ARN viral, les réponses en anticorps et le risque de propagation virale. On espère que cela contribuera à faire évoluer des méthodes de gestion plus adaptées.
L'article est basé sur une étude observationnelle de 479 patients atteints de COVID-19 récupérés qui ont été libérés entre le 1er février 2020 et le 5 mai 2020. Tous ces patients avaient été libérés après un enregistrement normal de la température pendant 3 jours ou plus, la résolution de tous les symptômes des voies respiratoires, et une diminution significative des lésions pulmonaires à la tomodensitométrie thoracique (TDM), ainsi que deux tests RT PCR successifs négatifs, réalisés à un intervalle d'un jour.
Les patients déchargés ont été mis en quarantaine à domicile ou dans des installations de quarantaine pendant deux semaines, avec des tests RT PCR répétés d'écouvillons nasopharyngés et rectaux, le 7e et 14e jours, jusqu'au 18 mars, ou aux jours 1, 3, 7 et 14 après cette date. Les derniers jours, des tests sérologiques ont été effectués. Des échantillons ont été prélevés sur 147 patients sortis avec des positifs récurrents pour la détection d'ARN par RT PCR, à raison de 1 à 4 échantillons par personne.
Sur les 479 patients, il y avait 93 (19%) positifs récurrents, avec 9% qui ont eu plusieurs tests positifs après deux négatifs consécutifs et un congé. Sur les 93, 75% ont été testés positifs pendant la quarantaine de 14 jours, et le reste pendant leur suivi. La période médiane entre le congé et le premier test positif récurrent était de 8 jours. Pourtant, le test positif récurrent final a eu lieu à une médiane de 15 jours après le congé et de 46 jours après le début de la maladie.
Caractéristiques différentes
Dans cette petite cohorte, environ 60% étaient des femmes, et significativement plus jeunes, à 34 ans, par rapport à l'âge médian de 45 ans pour le reste des patients. Les patients positifs récurrents et non récurrents avaient des caractéristiques similaires en ce qui concerne la gravité de la maladie, l'utilisation de stéroïdes ou la période d'hospitalisation. Cependant, le premier avait des niveaux de protéine C-réactive nettement plus élevés à la première présentation mais pas à la sortie.
Parmi les positifs récurrents, ceux avec des tests positifs multiples ont eu des périodes d'hospitalisation plus prolongées, à 24 contre 18 jours pour les patients positifs récurrents uniques, et le double de la période de détection de l'ARN viral à 65 jours contre 33 jours.
Les symptômes étaient absents chez 72% des patients positifs récurrents, tandis que le reste présentait des symptômes bénins seulement. Un seul patient avait un seul signe d'inflammation sous la forme d'un taux élevé d'IL-6. Chez 80% des patients, les lésions pulmonaires se sont améliorées (73%) ou sont restées inchangées depuis la première sortie (8%).
Positivité de l'écouvillon
Chez environ trois patients sur quatre, seuls les prélèvements nasopharyngés étaient positifs, dans 15% des prélèvements rectaux uniquement et chez moins d'un dixième, les deux étaient positifs. Tous les tests sanguins se sont révélés négatifs pour l'ARN viral. Les titres d'ARN viral étaient beaucoup plus faibles qu'au début de la maladie, inférieurs à 5 log copies / ml chez plus de 95% des patients. C'était une constatation cohérente chez les patients positifs récurrents uniques et multiples. De plus, le titre a baissé avec un nombre croissant de jours après la sortie.
Profils d'anticorps
Presque tous les patients positifs récurrents étaient IgG positifs, 62% étant IgA positifs et 88% positifs pour les anticorps neutralisants. Ces valeurs étaient comparables à celles des patients positifs non récurrents. Le titre des anticorps neutralisants était de 1:32 et 1:16, respectivement.
L'isolement du virus a échoué à partir de 9 écouvillons nasopharyngiens positifs récurrents sélectionnés, tandis que les méthodes de séquençage du génome entier n'ont récupéré que des fragments du génome.
Les positifs récurrents propagent-ils l'infection?
Les patients identifiés comme positifs récurrents ont été analysés pour la transmission virale à 96 contacts étroits. Un suivi de deux semaines a révélé qu'aucun n'était symptomatique, tous ayant des résultats de PCR négatifs. Des anticorps anti-RBD n'ont pas été trouvés dans 20 échantillons testés de ces contacts.
Un élève qui a fréquenté l'école pendant 11 jours avant d'être testé positif 90 jours après la sortie de l'hôpital est un élément positif récurrent notable. Tous les 1 200 enseignants et camarades de classe qui sont entrés en contact avec lui avaient des tests négatifs pour l'ARN viral et n'avaient aucun symptôme. Dans l'ensemble, aucune preuve n'a été trouvée d'un seul nouveau cas lié à ces positifs récurrents.
Tous les patients positifs récurrents ont été testés jusqu'à ce que leurs tests de détection d'ARN viral deviennent positifs. Aucun d'entre eux n'a renvoyé d'autres tests positifs récurrents après cette deuxième décharge. La grande majorité d'entre eux avaient des anticorps neutralisants avec un titre médian de 1:32.
Caractéristiques des positifs récurrents
Les caractéristiques communes des patients positifs récurrents, sur la base de cette étude, comprennent un âge plus jeune, des symptômes légers ou absents, une maladie non progressive, de faibles titres d'ARN viral et de longues périodes de test positif pour l'ARN viral jusqu'à 113 jours. L'absence de différences significatives dans les titres d'anticorps ou les niveaux d'anticorps neutralisants indique que le développement de l'immunité humorale est similaire dans les deux classes de patients. Enfin, le risque de transmission virale est faible chez ces patients positifs récurrents. Avec un titre d'anticorps neutralisant de 1:32 ou plus chez 60% des patients qui se sont complètement rétablis, cela pourrait être une référence possible pour de futurs essais de vaccins.
Quelles sont les causes des tests positifs récurrents?
Les raisons de la positivité récurrente ne sont pas claires, mais peuvent inclure des tests de RT PCR faussement négatifs conduisant à un congé, une véritable infection récurrente après la sortie et la persistance du virus en raison d'une immunité affaiblie. Cependant, la présente étude ne soutient aucune de ces hypothèses. Les chercheurs considèrent que des particules virales mortes sont peut-être libérées, ce qui entraîne un manque de particules vivantes ainsi que des résultats positifs répétés pour le test d'ARN viral.
Ils soulignent que des méthodes plus sensibles de détection de virus vivants sont nécessaires pour écarter cette théorie car, à l'heure actuelle, des études antérieures montrent qu'il n'est pas possible d'isoler des virus vivants lorsque la charge virale est inférieure à 106 copies par ml. Ils proposent que « Excrétion intermittente et non stable de faibles niveaux d'ARN viral»Est probablement la cause de tests positifs récurrents.
Implications et orientations futures
L'étude conclut: «Notre étude a révélé que la détection intermittente de faibles niveaux d'ARN du SRAS-CoV-2 (chez les patients sortants) n'est pas rare et que le moment de la détection de la RP varie (jusqu'à 90 jours après la sortie). Le risque de transmission posé par les patients RP-DC est probablement faible. » Les chercheurs recommandent une approche détendue de la gestion des patients libérés, étant donné cela, afin de minimiser le coût économique et psychologique de périodes de quarantaine plus longues, tout en maintenant une protection personnelle et un suivi appropriés.
*Avis important
medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, orienter la pratique clinique / les comportements liés à la santé ou être traités comme des informations établies.