Dans une récente étude publiée sur bioRxiv*, les chercheurs ont rapporté que l’infection par le coronavirus 2 (SRAS-CoV-2) du syndrome respiratoire aigu sévère et la vaccination par ARNm induisent des lymphocytes T mémoire distincts.
Sommaire
Arrière plan
La mémoire des lymphocytes T est essentielle pour une protection à long terme contre les virus et est en corrélation avec la protection immunitaire. De nombreuses personnes développent une mémoire des lymphocytes T contre le pic de SRAS-CoV-2 à la suite d’une infection naturelle ou d’une vaccination. Notamment, le cluster de différenciation 4-positif (CD4+) Les réponses des lymphocytes T ciblent les épitopes conservés à travers les variantes.
Au cours de l’amorçage initial, des facteurs tels que le site et l’exposition à l’antigène, les signaux inflammatoires, le milieu des cytokines et les interactions entre les cellules impriment les pools de mémoire résultants et influencent les réponses des lymphocytes T lors de la réexposition à l’antigène. L’infection virale induit un état hautement inflammatoire qui n’est pas observé avec la vaccination. Comment l’inflammation associée à l’infection affecte la mémoire CD4+ Les lymphocytes T restent à étudier.
L’étude et les conclusions
Dans la présente étude, les chercheurs ont exploré les paysages transcriptionnels de CD4+ Cellules T spécifiques de la protéine de pointe du SRAS-CoV-2 avant et après la troisième dose de vaccin (dose de rappel). Des cellules mononucléaires du sang périphérique (PBMC) ont été prélevées chez 14 adultes environ huit mois après la deuxième dose de vaccin (pré-boost) et un mois après la vaccination de rappel (post-boost) pour examiner longitudinalement la mémoire immunitaire.
Sept adultes ont eu la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) au printemps 2020 et ont été désignés infectés, c’est-à-dire que leur première exposition au pic de SRAS-CoV-2 s’est faite par infection. Les sept autres étaient naïfs d’infection et ont été jugés vaccinés (le premier pic d’exposition était le vaccin à ARNm BNT162b2). De plus, cinq sujets vaccinés ont connu plus tard des percées d’infections au cours de la vague Omicron.
Le test des marqueurs induits par l’activation (AIM) a été utilisé pour identifier les CD4 mémoire+ Cellules T. Les PBMC ont été stimulées avec des pools de peptides de pointe et des CD4 réactifs à l’AIM+ Les lymphocytes T ont été détectés par cytométrie en flux. Après le test AIM, les auteurs ont effectué un séquençage multimodal de l’ARN unicellulaire pour examiner les différences de niveau de transcription dans la mémoire CD4 spécifique à la pointe.+ Cellules T.
Sept groupes principaux ont été identifiés dans les PBMC stimulés, dont deux étaient presque absents chez les témoins non stimulés. Gènes associés à l’activation, tels que l’interféron-γ (IFNG), interleukine 2 (IL2), et la lymphotoxine-α (LTA), étaient fortement enrichis dans ces deux clusters. Réduction de la dimensionnalité appliquée avec 27 paramètres pour identifier les CD4 réactifs à l’AIM+ Les grappes de lymphocytes T ont révélé 11 grappes distinctes.
La distribution des cellules dans ces 11 grappes était similaire entre les deux cohortes aux points de temps avant et après le rappel. La plupart des CD4+ Les lymphocytes T des deux cohortes ont été identifiés dans le groupe 0 exprimant CD27en sélectionnant L (VENDRE) et le facteur de transcription 7 (TCF7), suggérant un état de la mémoire centrale. Vaccin post-rappel, CD4 amorcé par l’infection+ Les lymphocytes T étaient plus nombreux dans le groupe 1 qui exprimait des gènes cytotoxiques que dans les autres groupes. La polyfonctionnalité du CD4+ Les lymphocytes T étaient similaires entre les deux cohortes et n’étaient pas sensiblement modifiés lors de la vaccination de rappel.
Soixante-neuf et 220 gènes ont été différentiellement exprimés dans CD4+ Cellules T avant et après la vaccination de rappel, respectivement, entre les deux cohortes. CD4+ Les lymphocytes T d’adultes infectés ont exprimé de manière différentielle des gènes stimulés par l’IFN. En revanche, CD4+ Les cellules T d’individus vaccinés ont montré une expression différentielle de gènes impliqués dans la signalisation du facteur nucléaire kappa B (NF-kB). L’analyse d’enrichissement de l’ensemble de gènes (GSEA) a été réalisée pour tester les différences au niveau de la voie.
Il a révélé un enrichissement significatif pour les ensembles de gènes de réponse IFN α et γ dans CD4+ Cellules T pour les sujets infectés au moment du pré-boost. La vaccination de rappel n’a pas sensiblement modifié l’enrichissement du jeu de gènes, ce qui suggère que CD4+ Les cellules T ont été imprimées de manière différentielle lors de l’amorçage et le profil transcriptionnel a été peu modifié lors de la réexposition à la pointe pendant la vaccination par l’ARNm.
En revanche, la GSEA a révélé un enrichissement significatif de l’ensemble de gènes de signalisation NF-kB chez les individus vaccinés au moment post-boost. De plus, les ensembles de gènes du fuseau mitotique et du point de contrôle G2M ont été enrichis à des moments pré- et post-boost, suggérant une expression robuste des gènes associés à la prolifération dans les CD4 amorcés par le vaccin.+ Cellules T.
Ainsi, le CD4+ La fréquence des lymphocytes T était deux fois plus élevée chez les adultes vaccinés que chez les individus infectés un mois après la deuxième vaccination par ARNm, ce qui indique que l’empreinte au moment de l’amorçage de la mémoire CD4+ Les lymphocytes T peuvent avoir des effets durables sur l’activation cellulaire et peuvent également influencer le potentiel prolifératif.
Enfin, les infections révolutionnaires du vaccin SARS-CoV-2 chez cinq participants vaccinés ont provoqué des changements subtils dans le profil transcriptionnel du CD4+ Cellules T. Cependant, il n’a pas récapitulé le paysage transcriptionnel des CD4 amorcés par l’infection.+ Cellules T.
conclusion
En résumé, les résultats ont indiqué que l’empreinte de l’inflammation lors de la formation du CD4 mémoire spécifique au pic du SRAS-CoV-2+ Les cellules T ont entraîné des modifications transcriptionnelles persistantes maintenues même après la vaccination par l’ARNm par rapport au CD4+ Cellules T amorcées pendant la vaccination par l’ARNm. L’infection révolutionnaire du vaccin SARS-CoV-2 n’a pas provoqué de changements spectaculaires dans le paysage transcriptionnel du CD4 amorcé par le vaccin+ Cellules T. Dans l’ensemble, l’étude a fourni des informations précieuses sur les facteurs qui ont un impact sur la fonctionnalité et la qualité de la mémoire CD4+ Réponses des lymphocytes T, qui contribueront à éclairer les futures conceptions de vaccins.
*Avis important
bioRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.
