Dans une étude récente publiée dans Sciences Immunologie, les chercheurs ont étudié les mécanismes d’évasion immunitaire d’Omicron de la variante préoccupante du coronavirus 2 (SARS-CoV-2) du syndrome respiratoire aigu sévère (VOC). De plus, ils ont étudié les effets d’une percée d’infection par Omicron BA.2 chez des individus triplement vaccinés.
Sommaire
Arrière plan
Omicron BA.2 est la lignée parentale des sous-lignées hautement contagieuses Omicron BA.4 et BA.5. Les mutations L452R et F486V spécifiques à BA.4/BA.5 leur confèrent la capacité d’échapper aux anticorps neutralisants (nAbs) induits par le vaccin et aux anticorps monoclonaux thérapeutiques (mAbs) ciblant la glycoprotéine de pointe (S) du SRAS de type sauvage -Souche CoV-2.
Suite à une percée d’infection par Omicron BA.1, les personnes triplement vaccinées avec des vaccins contre la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) basés sur la plate-forme d’acide ribonucléique messager (COVID-19) ont des nAb adéquats contre Omicron BA.1, BA.2 et d’autres SARS-CoV- 2 COV. Cependant, ils ont beaucoup moins de nAb contre BA.4 et BA.5, deux sous-lignées Omicron qui dominent désormais à l’échelle mondiale.
À propos de l’étude
Omicron BA.2 est plus étroitement lié à BA.4/BA.5, de sorte que les chercheurs de la présente étude ont cherché à savoir si l’infection percée par BA.2 déplacerait davantage l’activité de neutralisation croisée des sérums induits par le vaccin vers BA.4/BA. 5. Les chercheurs ont créé trois cohortes d’individus, tous triplement vaccinés avec un vaccin COVID-19 à base d’ARNm. Ils ont évalué l’activité de neutralisation des échantillons de sérum de ces cohortes contre les sous-lignées Omicron. En outre, l’équipe a comparé la contribution des nAb ciblant le domaine de liaison au récepteur (RBD) ou le domaine N-terminal (NTD) de la glycoprotéine S de type sauvage à la neutralisation d’Omicron.
La première cohorte comptait des individus sans antécédents d’infection par le SRAS-CoV-2, appelée la cohorte naïve du SRAS-CoV-2 ; tous ses membres ont été triplement vaccinés avec le vaccin BNT162b2. Les individus des cohortes restantes ont été triplement vaccinés avec BNT162b2 ou ARNm-1273, ou un régime hétérologue des vaccins ARNm COVID-19, et pourtant ils ont contracté des infections percées par Omicron.
Les chercheurs ont confirmé l’infection percée d’Omicron BA.1 à l’aide d’une réaction en chaîne de transcriptase inverse-polymérase spécifique à une variante (RT-PCR). Cependant, ils ont en outre validé les participants convalescents infectés par BA.1 et BA.2 par séquençage du génome. De plus, les chercheurs ont utilisé un test de microneutralisation basé sur l’effet cytopathique (CPE) pour déterminer les titres de neutralisation du SARS-CoV-2. Les expériences d’épuisement des anticorps ont appauvri les sérums de plus de 97% et 74% des nAbs de liaison RBD et de liaison NTD, respectivement. Les chercheurs ont testé des sérums appauvris via un test de neutralisation de pseudovirus (pVNT).
Résultats de l’étude
Les auteurs ont noté que l’infection percée d’Omicron BA.2 a déclenché des nAB avec une activité largement neutralisante contre BA.2 et ses trois descendants – BA.2.12.1, BA.4 et BA.5, en accord avec des études précédentes. L’explication la plus probable est que ces sous-lignées Omicron ont une similitude de séquence d’acides aminés plus élevée dans la glycoprotéine S RBD et la NTD. C’est peut-être la raison pour laquelle ces sous-lignées Omicron BA.2 ont entraîné une neutralisation croisée plus efficace que BA.1, qui est antigéniquement plus éloigné.
Plus précisément, l’infection percée de BA.1 n’a pas pu déclencher un rappel de mémoire des cellules B spécifiques de NTD en raison de multiples mutations au sein de BA.1 NTD. Il en est ainsi parce qu’une infection percée par des souches hétérologues de SRAS-CoV-2 élargit principalement un répertoire de lymphocytes B mémoire contre les épitopes S conservés. Notamment, les concentrations sériques des nAb ciblant les NTD ou les RBD étaient comparables dans les trois cohortes d’étude, ce qui indique que les puissances d’anticorps, et non les niveaux de nAb sériques, variaient le potentiel de neutralisation des nAb suscités.
Des expériences d’appauvrissement en anticorps et de pseudovirus hybrides ont montré que les nAb se liant à NTD contribuaient de manière marquée à l’activité neutralisante contre Omicron BA.4/5 dans des sérums de convalescence BA.2 triplement vaccinés. À l’inverse, l’activité neutralisante des sérums de convalescence BA.1 a principalement fonctionné grâce aux anticorps de liaison RBD. Cette découverte corrobore les conclusions d’études antérieures montrant que les attrapes anti-NTD isolés à partir de sérums d’individus infectés par BA.2 ne neutralisent pas BA.1.
conclusion
Pris ensemble, les résultats de l’étude ont élargi les connaissances actuelles sur la façon dont les vaccinations avec les vaccins SARS-CoV-2 de type sauvage combinés à des infections percées avec les COV caractérisent les schémas d’immunité au sein de la population. Ces données pourraient éclairer le développement de vaccins COVID-19 de nouvelle génération contre les variantes du SRAS-CoV-2 qui émergent en permanence.
En fait, un vaccin adapté à la séquence de la sous-lignée Omicron BA.2 pourrait avoir un potentiel de neutralisation plus large contre toutes les variantes émergentes du SRAS-CoV-2, y compris les sous-lignées Omicron BA.4/BA.5 actuellement prédominantes.
