Dans une étude récente publiée sur le medRxiv* serveur de préimpression, les chercheurs ont déterminé les niveaux d’anticorps neutralisants (nAb) contre diverses souches de la maladie à coronavirus associée au syndrome respiratoire aigu sévère 2 (SRAS-CoV-2) dans des sérums prélevés sur des individus présentant divers degrés d’immunité contre la maladie à coronavirus 2019 ( COVID-19[FEMININE)
Sommaire
Émergence de la variante Omicron
Fin novembre 2021, une nouvelle variante du SARS-CoV-2 hautement muté, Omicron (B.1.1.529), a été identifiée au Botswana et en Afrique du Sud. La variante Omicron est distincte des variantes préoccupantes (VOC) SARS-COV-2 Alpha, Beta et Delta en raison de la présence d’environ 30 mutations d’acides aminés dans la région de la protéine de pointe (S).
De plus, l’évasion immunitaire d’Omicron contre l’anticorps monoclonal thérapeutique et l’immunité induite par le vaccin a conduit à une augmentation des cas de COVID-19 même dans la population vaccinée. Des études antérieures d’Omicron chez des individus ayant différents niveaux d’immunité ont suggéré que la neutralisation des anticorps de la variante B.1.1.529 est environ 40 fois inférieure à celle de la souche originale Wuhan D614G du SRAS-CoV-2.
L’étude
Dans la présente étude, les auteurs ont déterminé les niveaux de nAb contre les variantes du SRAS-CoV-2 Wuhan, Delta et Omicron dans environ 30 sérums obtenus auprès de trois groupes de participants. Le variant Omicron a été isolé à partir d’un individu vacciné avec deux doses de Moderna revenant d’Afrique du Sud en Belgique à l’aide du mini kit QIAamp Viral RNA. Il a ensuite été amplifié à l’aide de la transcription inverse-amplification en chaîne par polymérase (RT-PCR) et corrélé avec une séquence SARS-CoV-2 Omicron de Belgique par le logiciel BLAST+.
Le premier groupe avait 10 échantillons de sérum collectés auprès de patients convalescents hospitalisés infectés par la souche SARS-COV-2 Wuhan D614G entre le 21 février 2020 et le 27 mars 2020. Les échantillons ont été collectés après un délai médian d’environ 25 jours depuis le début de les symptômes.
Dans le groupe deux, des échantillons de sérum t 10 ont été collectés auprès d’individus n’ayant jamais été infectés par le SRAS-CoV-2 et environ 28 jours après la vaccination de rappel par BNT162b2. Les participants avaient un intervalle de 21 jours entre la première et la deuxième dose de vaccin et un intervalle de sept mois entre la deuxième et la troisième dose de vaccin.
De même, le groupe trois avait 10 échantillons de sérum prélevés sur des individus convalescents ayant reçu le rappel BNT162b2. Ces participants ont été pré-infectés par la souche SARS-COV-2 Wuhan D614G entre le 24 mars 2020 et le 11 juin 2020, et ont reçu trois doses de vaccin BNT162b2 avec un écart de 21 jours entre la première et la deuxième dose de vaccin et un Intervalle de 8 mois entre la deuxième et la troisième dose de vaccin.
La capacité du nAb contre diverses variantes du SRAS-CoV-2 dans les trois groupes de patients a été testée à l’aide d’un test de neutralisation du virus entier où l’effet cytopathogène (CPE) a été déterminé au microscope. La méthode de Reed-Muench et le test de Mann-Whitney ont été utilisés pour calculer et comparer le titre de nAb parmi les variantes du SRAS-CoV-2.
Résultats
Les résultats ont indiqué que les participants du groupe un avaient les réponses nAb les plus faibles indépendamment de la variante SARS-CoV-2 testée, tandis que les participants du groupe deux avaient un niveau significativement plus élevé de nAb contre le type sauvage SARS-CoV-2 (WT) Wuhan, Delta, et les souches Omicron.
Alors que les participants du groupe trois avaient les titres de nAb les plus élevés qui ont réduit le nombre de puits infectés de 50 % (NT50) valeurs contre toutes les variantes étudiées, les niveaux de nAb contre la variante Omicron n’étaient pas statistiquement différents entre les groupes deux et trois.
Les niveaux NT50 pour les variantes Delta et Omicron dans les trois groupes ont montré une tendance à la baisse ; cependant, la variante Omicron avait un déclin significativement plus élevé par rapport à la variante Delta dans ces groupes. Cette baisse du titre de nAb pour toutes les variantes était la plus prononcée dans le groupe un ; en outre, il y avait une baisse significative de NT50 contre Omicron dans les groupes deux et trois par rapport aux souches Wuhan et Delta dans ces groupes.
Les participants immunisés hybrides du groupe trois avaient un niveau plus élevé de nAb contre les variantes SARS-CoV-2 Wuhan et Delta ; cependant, ils n’avaient pas de différence statistiquement significative dans les nAbs pour Omicron par rapport aux participants vaccinés à trois doses avec BNT162b2 du groupe deux.
Conclusion
La présente étude était conforme aux études précédentes sur la capacité de neutralisation de la variante Omicron, indiquant qu’Omicron échappe à l’immunité naturellement acquise et induite par le vaccin. Les résultats de l’étude ont confirmé qu’une neutralisation significative des anticorps du SRAS-CoV-2 Omicron était induite par trois doses du vaccin BNT162b2. La neutralisation induite par le vaccin d’Omicron dans les groupes deux et trois était plus élevée que la neutralisation par anticorps dans le groupe un. Les échantillons du groupe trois présentaient des niveaux significativement élevés de titres de nAb contre les variantes du SARS-CoV-2 Wuhan et Delta ; cependant, des différences significatives dans les titres de nAb n’ont pas été observées contre la variante Omicron dans les groupes deux et trois.
Les résultats de l’étude soulignent la nécessité d’une campagne de vaccination de rappel rapide pour prévenir le COVID-19 causé par la variante Omicron, car la neutralisation d’Omicron par le vaccin à deux doses BNT162b2 n’est pas efficace pour contrôler la propagation de l’infection.
*Avis important
medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, orienter la pratique clinique/le comportement lié à la santé, ou traités comme des informations établies.