Un nouveau test de diagnostic peut détecter l'ARN du SRAS-CoV-2, le virus qui cause le COVID-19, dans les échantillons d'urine, de sang, de salive ou d'écouvillon buccal en seulement 30 à 45 minutes, selon une nouvelle étude publiée le 12 juin 2020 dans la revue en libre accès PLOS ONE de Laura Lamb du Beaumont Health System, Michigan, USA, et ses collègues.
Le SRAS-CoV-2 est difficile à diagnostiquer au début de l'infection car les patients peuvent être asymptomatiques ou présenter des symptômes légers et non spécifiques. La norme actuelle pour le diagnostic moléculaire est la PCR quantitative à transcription inverse (qRT-PCR), qui nécessite un équipement coûteux et du personnel qualifié uniquement disponible dans des laboratoires limités. L'amplification isotherme médiée par boucle de transcription inverse (RT-LAMP) est une technologie en une étape avec moins de barrières à utiliser que qRT-PCR; les réactifs sont peu coûteux et peuvent être stockés à température ambiante, la technique fonctionne avec une gamme de types d'échantillons, et il s'est avéré être très spécifique, sensible et rapide pour d'autres maladies infectieuses.
Dans la nouvelle étude, les chercheurs ont développé un test de diagnostic RT-LAMP pour le SRAS-CoV-2 et mesuré l'efficacité du test sur des échantillons de sang, d'urine, de salive et d'écouvillons buccaux qui avaient été dopés avec différentes quantités de génétique SARS-CoV-2 Matériel. Le test a également été utilisé sur des échantillons cliniques de patients COVID-19.
Le test RT-LAMP pour le SRAS-CoV-2 a réussi à détecter le virus dans tous les types d'échantillons humains qui ont été enrichis de matériel génétique SARS-CoV-2, dans les 30 à 45 minutes, avec une limite de détection estimée à seulement 304 copies virales dans un échantillon. Il est important de noter que le test n'a pas détecté de virus dans des échantillons enrichis d'ARN d'autres coronavirus, démontrant la spécificité pour le SRAS-CoV-2. Dans les échantillons de frottis buccaux cliniques, RT-LAMP était positif pour 95% (19/20) des échantillons positifs par qRT-PCR et négatifs pour 90% (18/20) des échantillons négatifs par qRT-PCR. Les chercheurs notent que ces écarts entre les méthodes pourraient représenter soit des faux positifs par la RT-LAMP, une contamination ou une sensibilité accrue de la RT-LAMP par rapport à la qRT-PCR. L'étude actuelle n'était pas propulsée pour déterminer la sensibilité d'une population clinique.
Cette méthode peut rapidement détecter le virus de COVID-19 dans des échantillons cliniques sans équipement coûteux. «
Laura Lamb, système de santé de Beaumont
La source:
Référence de la revue:
Agneau, L.E., et al. (2020) Détection rapide de nouveaux coronavirus / syndrome respiratoire aigu sévère Coronavirus 2 (SRAS-CoV-2) par amplification isotherme médiée par une boucle de transcription inverse. PLOS ONE. doi.org/10.1371/journal.pone.0234682.
