La disponibilité des tests antigéniques rapides a considérablement fait progresser les efforts pour contenir la propagation du COVID-19, mais chaque nouvelle variante préoccupante soulève des questions quant à savoir si les tests de diagnostic seront toujours efficaces. Une nouvelle étude publiée dans Cellule tente de répondre à ces questions en évaluant les performances des tests rapides lorsqu’ils seront mis au défi avec les futures variantes du SRAS-CoV-2.
L’équipe de recherche, dirigée par l’Université Emory et financée par le programme technologique Rapid Acceleration of Diagnostics (RADx) du National Institute of Health (NIH), a développé une nouvelle méthode pour évaluer comment les mutations du SRAS-CoV-2 peuvent affecter la reconnaissance par les anticorps utilisés dans tests antigéniques rapides. Étant donné que la plupart des tests antigéniques rapides détectent la protéine de la nucléocapside du SRAS-CoV-2 (protéine N), l’équipe a directement mesuré l’impact des mutations de la protéine N sur la capacité des anticorps diagnostiques à reconnaître leur cible.
« Sur la base de nos découvertes, aucune des principales variantes préoccupantes passées et présentes du SRAS-CoV-2 ne contient de mutations qui affecteraient la capacité des tests antigéniques rapides actuels à détecter les anticorps », déclare le premier auteur de l’étude, Filipp Frank, Ph.D., professeur adjoint au département de biochimie de l’Université Emory. « En outre, ces données nous permettent d’avoir une longueur d’avance et de prédire les performances des tests par rapport à presque toutes les variantes susceptibles de survenir. »
L’étude a utilisé une méthode appelée balayage mutationnel profond pour évaluer toutes les mutations possibles de la protéine N dans une seule expérience à haut débit. Les chercheurs ont ensuite mesuré l’impact des mutations sur leur interaction avec les anticorps utilisés dans 11 tests antigéniques rapides disponibles dans le commerce et identifié les mutations susceptibles de permettre la fuite des anticorps.
L’identification précise et efficace des personnes infectées reste une stratégie d’une importance cruciale pour l’atténuation du COVID-19, et notre étude fournit des informations sur les futures mutations du SRAS-CoV-2 qui pourraient interférer avec la détection. Les résultats décrits ici peuvent nous permettre de nous adapter rapidement au virus alors que de nouvelles variantes continuent d’émerger, ce qui représente un impact clinique et de santé publique immédiat. »
Eric Ortlund, Ph.D., auteur principal de l’étude, professeur, département de biochimie, Université Emory
Les résultats montrent qu’il est relativement rare que des variantes présentent des mutations de la protéine N qui leur permettent d’échapper aux tests de diagnostic, mais il existe une petite proportion de séquences qui pourraient avoir un impact sur la détection. Les chercheurs, les responsables de la santé publique et les fabricants de tests peuvent utiliser ces données pour déterminer si un test de diagnostic doit être évalué pour sa capacité à détecter ces mutations ou pour éclairer la conception future des tests.
« Compte tenu du cycle sans fin de nouvelles variantes, les données de cette étude seront utiles pour les années à venir », déclare Bruce J. Tromberg, Ph.D., directeur de l’Institut national d’imagerie biomédicale et de bioingénierie (NIBIB) et responsable de le programme RADx® Tech au NIH.
Alors que de nombreuses variantes préoccupantes contiennent de multiples mutations de la protéine N, les auteurs de l’étude notent que leur méthode n’évalue pas comment de multiples mutations pourraient affecter la reconnaissance diagnostique des anticorps, ce qui représente une limitation de l’étude.
Le projet a été soutenu par NIBIB sous les numéros de prix 75N92019P00328, U54EB015408 et U54EB027690 dans le cadre de l’initiative RADx, lancée pour accélérer l’innovation dans le développement, la commercialisation et la mise en œuvre de technologies pour les tests COVID-19.
