Dans une récente étude publiée sur bioRxiv* serveur de préimpression, les chercheurs ont comparé les niveaux d’anticorps neutralisants à réaction croisée provoqués par les infections à coronavirus 2 (SARS-CoV-2) Omicron BA.4 et BA.1 du syndrome respiratoire aigu sévère.
La variante préoccupante du SARS-CoV-2 Omicron a évolué vers diverses sous-lignées telles que BA.2, BA.2.12.1, BA.4 et BA.5. Alors que les lignées BA.4 et BA.5 ont la même mutation dominante du gène de pointe, elles diffèrent en ce qui concerne les protéines non structurelles (NSP) et les gènes de la matrice et de la nucléocapside. Par conséquent, BA.4 a présenté une résistance accrue à la neutralisation des anticorps par les sérums de vaccinés et de convalescents ainsi que par les anticorps monoclonaux.
Sommaire
À propos de l’étude
Dans la présente étude, les chercheurs ont étudié la réactivité croisée des anticorps neutralisants (nAbs) provoqués par l’infection par SARS-CoV-2 Omicron BA.4 chez des individus non vaccinés et précédemment vaccinés.
L’équipe a recueilli des échantillons de plasma d’individus diagnostiqués avec la maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) au cours de la cinquième vague de la pandémie en Afrique du Sud. Ces échantillons utilisés pour estimer la réactivité croisée de neutralisation ont été collectés auprès de 35 patients hospitalisés COVID-19 positifs qui ont été admis à l’hôpital de district de Tshwane entre le 9 mai et le 22 mai 2021. L’équipe a effectué un séquençage du génome entier (WGS) et collecté des données ayant plus de 50% de couverture génomique chez 70% des patients, dont 67% pourraient être associés à une lignée ou à un clade spécifique.
En outre, l’équipe a examiné les échantillons de plasma prélevés sur les patients non vaccinés contre la séquence de pseudovirus BA.4 ou BA.5 appariée. Un test de neutralisation du pseudovirus lentiviral a également été utilisé pour estimer la réactivité croisée avec les variantes SARS-CoV-2 D614G, Beta et Delta et les sous-lignées Omicron BA.1, BA.2 et BA.4.
Résultats
Les résultats de l’étude ont montré que selon l’attribution de clade et de lignée effectuée avec WGS, 79 % des infections étaient causées par la sous-lignée SARS-CoV-2 Omicron BA.4 tandis que 21 % étaient par la sous-lignée BA.5. Parmi la cohorte de patients, 13 avaient des antécédents d’au moins une dose de vaccin Ad26.CoV2.S et deux doses de vaccin BNT162b2 au moins 56 à 163 jours avant le diagnostic de COVID-19. De plus, 22 patients n’étaient pas vaccinés et n’ont signalé aucune infection symptomatique antérieure par le SRAS-CoV-2.
L’équipe a également observé que 41% des échantillons de plasma obtenus à partir d’individus non vaccinés ne présentaient aucune neutralisation détectable. De plus, un nombre plus élevé de non-répondeurs, ou d’individus qui n’ont présenté aucune réponse autologue à BA.4 ou BA.5, a été observé pour la vague d’infections BA.4 ou BA.5 que pour la vague BA.1. De plus, 88,9 % des non-répondeurs non vaccinés ont été admis à l’hôpital pour des raisons autres que la COVID-19 et ont été détectés accidentellement avec une infection COVID-19 asymptomatique ou légère. D’autre part, l’équipe a noté que 25 % des patients vaccinés étaient des non-répondeurs, tous rapportant des antécédents de vaccination contre l’Ad26.CoV2.S.
De plus, l’équipe a observé que les individus non vaccinés affichaient des titres d’anticorps modérés en réponse aux gènes de pointe BA.4 ou BA.5 appariés. Ces titres correspondaient aux infections bénignes ou asymptomatiques observées chez ces individus. La réduction des titres de nAb était variable parmi les variantes préoccupantes car les titres ont été observés contre Beta. BA.2 et D614G étaient nettement inférieurs à ceux contre BA.4 ou BA.5. De plus, les titres estimés contre les infections BA.1 étaient deux fois inférieurs à ceux contre les infections BA.4 ou BA.5.
L’étude a également montré que les infections révolutionnaires au COVID-19 notées après la vaccination ont entraîné une augmentation substantielle des titres d’anticorps. Les titres se sont avérés nettement plus élevés contre le D614G tandis que les titres ont été réduits contre le SARS-CoV-2 Beta, Delta et BA.1. L’équipe a également observé que si les réponses provoquées par Beta, BA.4 et BA.5 étaient hautement réactives, celles observées contre Delta et BA.1 étaient significativement moins réactives avec une réduction de 10 à 100 fois des titres d’anticorps.
Conclusion
Les résultats de l’étude ont montré que par rapport aux anticorps neutralisants déclenchés par la sous-lignée SARS-CoV-2 Omicron BA.1 avec une réactivité croisée limitée, BA.4 et BA.5 provoquent des anticorps neutralisants hautement réactifs. Cela suggère que les vaccins COVID-19 nouvellement développés doivent posséder une étendue de neutralisation améliorée pour freiner la transmission d’Omicron.
*Avis important
bioRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.
