Dans une récente étude publiée sur medRxiv* serveur de préimpression, les chercheurs ont cherché à savoir si une transmission non détectée du virus de la variole humaine du singe (hMPXV) s’était produite avant le premier cas documenté de MPX à Rotterdam et à Amsterdam.
Sommaire
Arrière plan
Le premier cas de hMPXV a été documenté à Amsterdam le 10 mai 2022 et à Rotterdam le 19 mai 20222. Depuis lors, MPX a touché plusieurs personnes à travers le monde. Cependant, la transmission antérieure potentielle du hMPXV chez les Néerlandais est inconnue. L’analyse de la transmission prolongée non identifiée du hMPXV pourrait améliorer la compréhension de la dynamique de l’épidémie de MPXV en cours en 2022 et guider l’élaboration de politiques et l’élaboration d’interventions pour réduire le fardeau sanitaire du MPX.
À propos de l’étude
Dans la présente étude rétrospective, les chercheurs ont cherché à savoir si la transmission non détectée du virus du monkeypox humain (hMPXV) s’était produite avant le cas d’infection initialement documenté par le hMPXV à Rotterdam et à Amsterdam.
Au total, 401 spécimens anorectaux et spécimens d’ulcères provenant d’hommes ayant des rapports sexuels avec des hommes (HSH) visitant les centres de santé sexuelle (CSH) de Rotterdam et d’Amsterdam datant du 14 février ont été analysés. Le CSH obtient régulièrement les prélèvements anorectaux pour Ct (Chlamydia trachomatis) et Ng (Neisseria gonorrhoeae) test. En revanche, des échantillons d’ulcère sont obtenus pour les tests VZV (virus varicelle-zona), Tp (Treponema pallidum) et HSV (virus herpès simplex)-1, -2. Tous les spécimens ont été conservés pendant quatre mois.
Une analyse quantitative de la réaction en chaîne par polymérase (qPCR) a été effectuée entre le 14 février et le 9 février pour détecter le hMPXV dans les échantillons. Les données des participants obtenues à partir de leurs fichiers électroniques ont été dissociées avant que les rapports de test hMPXV ne soient disponibles. Comme points limites, l’équipe a utilisé rétrospectivement la veille de la présentation initiale d’un cas MPX identifié à Rotterdam et à Amsterdam, les 18 et 9 mai, respectivement.
Au CSH de Rotterdam, des échantillons anorectaux d’individus HSH, régulièrement obtenus pour des tests Ct ou Ng, et des échantillons d’ulcère obtenus pour des tests VZV et HSV-1, -2 entre le 1er avril et le 18 mai 2022, ont été soumis à des tests hMPXV. L’équipe a détecté le hMPXV par analyse PCR quantitative de pan-orthopoxvirus suivie d’un séquençage du génome entier ou à l’aide d’une cible spécifique au MPXV. En outre, une analyse phylogénétique a été effectuée à l’aide des séquences GenBank disponibles et des méthodes de sous-échantillonnage.
Résultats
À Amsterdam, 169 échantillons anorectaux positifs au Ng/Ct et 125 échantillons d’ulcère (indépendamment de la positivité du VZV, du Tp ou du HSV-1, -2) ont été testés pour la présence de hMPXV. Aucun des échantillons n’était positif au hMPXV. À Rotterdam, 93 échantillons anorectaux positifs au Ct/Ng ont été testés, dont 30 visiteurs ont signalé des plaintes entre le 1er avril et le 18 mai 18. De plus, au cours de la période, 12 échantillons d’ulcère ont été testés pour la présence de hMPXV. Un résident d’Amsterdam du groupe d’échantillon d’ulcères et un résident de Rotterdam du groupe d’échantillon anorectal ont été identifiés comme hMPXV-positifs au cours de la première semaine de mai 2022.
Le patient hMPXV positif diagnostiqué à Amsterdam était âgé de 50 à 54 ans, présentait plusieurs ulcères et une éruption cutanée avec démangeaisons dans les régions supérieures des jambes, n’avait pas été notifié d’infection sexuellement transmissible (IST), avait reçu un diagnostic d’infection génitale herpès lors de la consultation, n’avait pas reçu de PrEP (prophylaxie pré-exposition) contre le virus de l’immunodéficience humaine (VIH), avait des antécédents d’utilisation occasionnelle de préservatifs anaux avec un partenaire sexuel au cours des six derniers mois et avait été préalablement diagnostiquée séropositive, Ct infection, infection à Ng et syphilis primaire.
Le patient hMPXV positif diagnostiqué à Rotterdam durant une période similaire était âgé de 20 à 24 ans, présentait une proctite, avait été notifié pour une IST, avait été diagnostiqué avec un Ct et Ng anorectal et pharyngé lors de la consultation, avait reçu une PrEP contre le VIH, ont donné des antécédents d’utilisation occasionnelle de préservatifs anaux avec 30 partenaires sexuels au cours des six derniers mois, ont participé à des rapports sexuels en groupe et à l’utilisation de drogues à des fins récréatives et avaient déjà reçu un diagnostic d’IST.
Les séquences de l’individu MSM d’Amsterdam hMPXV positif ont été identifiées comme étant des séquences de clade IIb (B.1) et étaient étroitement liées aux souches mondiales de hMPXV. Les séquences résidentes de Rotterdam hMPXV-positives n’ont pas pu être analysées en raison d’un manque d’acide désoxyribonucléique (ADN). Les deux cas positifs au hMPXV ont été identifiés au cours d’une période (fin avril 2022) coïncidant avec celle de la documentation initiale des cas de MPX en Espagne (26 avril), au Portugal (29 avril) et au Royaume-Uni (Royaume-Uni, 21 avril) . En moyenne, le hMPXV a incubé pendant neuf jours dans les cas diagnostiqués aux Pays-Bas.
Aucune preuve de transmission généralisée du hMPXV dans les réseaux sexuels HSH néerlandais n’a été trouvée avant mai 2022. Il est très probable que l’expansion de l’épidémie néerlandaise de hMPXV à travers l’Europe se soit produite dans un court laps de temps au printemps 2022 parmi les HSH activement engagés dans des activités sexuelles. .
Dans l’ensemble, les résultats de l’étude n’ont montré aucune indication de transmission hMPXV étendue non détectée chez les HSH résidant à Rotterdam ou à Amsterdam avant mai 2022. Les résultats de l’étude concordent avec ceux d’autres villes européennes et sous-tendent une épidémie mondiale clonale de hMPXV au printemps 2022.
*Avis important
medRxiv publie des rapports scientifiques préliminaires qui ne sont pas évalués par des pairs et, par conséquent, ne doivent pas être considérés comme concluants, guider la pratique clinique/les comportements liés à la santé, ou traités comme des informations établies.